MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 12639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019779	ACC	2	6	1169108	1169113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_019779	A	6	6	1169117	1169122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_019779	TGT	2	6	1169127	1169132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_019779	TCT	2	6	1169166	1169171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_019779	TTG	3	9	1169308	1169316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_019779	TTTG	2	8	1169370	1169377	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_019779	CTA	2	6	1169461	1169466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_019779	GAT	2	6	1169483	1169488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_019779	TCC	2	6	1169489	1169494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_019779	TAA	2	6	1169511	1169516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_019779	TTA	2	6	1170769	1170774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_019779	GTT	2	6	1172397	1172402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_019779	GAG	2	6	1172403	1172408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_019779	ACTC	2	8	1172443	1172450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_019779	ATT	2	6	1178053	1178058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_019779	C	7	7	1178168	1178174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4017	NC_019779	C	6	6	1178181	1178186	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4018	NC_019779	C	6	6	1178194	1178199	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4019	NC_019779	G	6	6	1178207	1178212	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_019779	G	6	6	1178216	1178221	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_019779	CAT	2	6	1178252	1178257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_019779	TA	3	6	1178263	1178268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_019779	ATGTTC	2	12	1178310	1178321	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4024	NC_019779	CTG	2	6	1178339	1178344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_019779	AAC	2	6	1178370	1178375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_019779	A	6	6	1178394	1178399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_019779	CT	4	8	1179271	1179278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_019779	GAT	2	6	1179299	1179304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_019779	TTTGGC	2	12	1179310	1179321	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4030	NC_019779	TTA	2	6	1179532	1179537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_019779	GAT	2	6	1182845	1182850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_019779	TGC	2	6	1182855	1182860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_019779	A	6	6	1182920	1182925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_019779	AT	3	6	1186174	1186179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_019779	A	7	7	1186888	1186894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_019779	CTT	2	6	1186917	1186922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_019779	CT	3	6	1186926	1186931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_019779	TTG	2	6	1188964	1188969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_019779	TC	4	8	1189007	1189014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_019779	ATA	2	6	1189039	1189044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_019779	AATA	2	8	1189051	1189058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_019779	GCA	2	6	1190122	1190127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_019779	GATT	2	8	1191534	1191541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_019779	ATG	2	6	1191559	1191564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_019779	T	6	6	1191568	1191573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_019779	ACT	2	6	1191606	1191611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_019779	AATT	2	8	1191642	1191649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_019779	TTA	3	9	1191694	1191702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_019779	ATA	2	6	1191708	1191713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_019779	GGATC	2	10	1191746	1191755	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4051	NC_019779	GCCC	2	8	1191775	1191782	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4052	NC_019779	CTAGG	2	10	1191790	1191799	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4053	NC_019779	TCA	2	6	1193454	1193459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_019779	AAG	2	6	1193481	1193486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_019779	CTT	2	6	1193503	1193508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_019779	A	6	6	1193544	1193549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_019779	T	6	6	1193931	1193936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_019779	TTC	2	6	1194040	1194045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_019779	GTT	2	6	1194064	1194069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_019779	CAAC	2	8	1194127	1194134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_019779	T	6	6	1194150	1194155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_019779	GAT	2	6	1194160	1194165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_019779	CTC	2	6	1194578	1194583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_019779	ATG	2	6	1194587	1194592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_019779	GAA	2	6	1194626	1194631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_019779	TGA	2	6	1196116	1196121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_019779	TGAC	2	8	1196182	1196189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4068	NC_019779	AAT	2	6	1196217	1196222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_019779	AAG	2	6	1199425	1199430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_019779	GTT	2	6	1199447	1199452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_019779	T	6	6	1199451	1199456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_019779	TTA	2	6	1199496	1199501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_019779	A	6	6	1199520	1199525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_019779	ATTG	2	8	1199557	1199564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_019779	ACA	2	6	1199585	1199590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_019779	AAT	2	6	1199600	1199605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_019779	GAT	2	6	1201021	1201026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_019779	TC	3	6	1201039	1201044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_019779	TTG	2	6	1201068	1201073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_019779	AAT	2	6	1204308	1204313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_019779	A	6	6	1205114	1205119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_019779	G	8	8	1205155	1205162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_019779	AG	3	6	1207403	1207408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_019779	TGA	2	6	1207438	1207443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_019779	T	6	6	1208804	1208809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_019779	A	7	7	1208849	1208855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_019779	AAT	2	6	1208991	1208996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_019779	AG	3	6	1209003	1209008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_019779	GAT	2	6	1209031	1209036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_019779	TCT	2	6	1209041	1209046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_019779	AACAA	2	10	1209932	1209941	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4092	NC_019779	A	7	7	1209952	1209958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_019779	GAA	2	6	1210201	1210206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_019779	A	6	6	1210205	1210210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_019779	ATT	2	6	1210265	1210270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_019779	GATG	2	8	1210357	1210364	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_019779	TAA	2	6	1210420	1210425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_019779	A	6	6	1210431	1210436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_019779	CAAT	2	8	1210444	1210451	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4100	NC_019779	TGA	2	6	1211479	1211484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_019779	GTT	2	6	1211504	1211509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_019779	GAT	2	6	1212476	1212481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_019779	ATCTT	2	10	1212583	1212592	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4104	NC_019779	TGC	2	6	1212616	1212621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_019779	CT	3	6	1215555	1215560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_019779	T	6	6	1215640	1215645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_019779	GCT	2	6	1218235	1218240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_019779	TATT	2	8	1219083	1219090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_019779	T	6	6	1219167	1219172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_019779	GAG	2	6	1219173	1219178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_019779	TCC	2	6	1219205	1219210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_019779	ATT	2	6	1219255	1219260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_019779	TTTA	2	8	1219365	1219372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_019779	TTA	3	9	1219370	1219378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_019779	ATTC	2	8	1219413	1219420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_019779	TCA	2	6	1219429	1219434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_019779	ATGA	2	8	1219445	1219452	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_019779	ATG	2	6	1219458	1219463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_019779	AAT	2	6	1221945	1221950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_019779	AAAGGG	2	12	1222013	1222024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_019779	TTCT	2	8	1222052	1222059	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4122	NC_019779	AAGC	2	8	1222155	1222162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_019779	ATT	2	6	1222172	1222177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_019779	TAA	2	6	1229365	1229370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_019779	CAA	2	6	1231501	1231506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_019779	T	6	6	1234229	1234234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_019779	TTA	2	6	1234311	1234316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_019779	T	6	6	1234327	1234332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_019779	GAA	2	6	1236102	1236107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_019779	TAA	2	6	1236431	1236436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_019779	TAA	2	6	1236438	1236443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4133	NC_019779	TC	3	6	1238432	1238437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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