MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 12639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019779	AGG	2	6	242601	242606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019779	GTAA	2	8	242635	242642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019779	A	6	6	242641	242646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019779	C	6	6	242712	242717	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1005	NC_019779	GTT	2	6	243771	243776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019779	TGGG	2	8	243801	243808	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019779	CTG	2	6	243858	243863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_019779	TGG	2	6	243888	243893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019779	GCA	2	6	243917	243922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_019779	TCA	2	6	243949	243954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_019779	AGT	2	6	243970	243975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_019779	TGATA	2	10	243992	244001	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019779	GTTGA	2	10	244068	244077	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019779	T	6	6	244081	244086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019779	GCTC	2	8	245631	245638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_019779	AT	3	6	247216	247221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019779	CAA	2	6	247286	247291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_019779	T	6	6	247330	247335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019779	C	6	6	247358	247363	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1020	NC_019779	ATT	2	6	247372	247377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019779	G	6	6	247393	247398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019779	G	6	6	247488	247493	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_019779	G	6	6	247497	247502	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_019779	TA	3	6	247530	247535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_019779	AAC	2	6	249420	249425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_019779	TCT	2	6	249523	249528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_019779	AAT	2	6	249531	249536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019779	AAC	2	6	249544	249549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_019779	ACT	2	6	249556	249561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_019779	TAA	2	6	250822	250827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019779	AAT	2	6	250855	250860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019779	ATG	2	6	252158	252163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019779	A	6	6	256938	256943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_019779	ACA	2	6	256954	256959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_019779	ACTT	2	8	256979	256986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_019779	ATCA	2	8	258380	258387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_019779	AGT	2	6	258405	258410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019779	GAA	2	6	259366	259371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_019779	GAG	2	6	259387	259392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019779	TC	3	6	259444	259449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_019779	A	6	6	259452	259457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019779	ATT	2	6	259461	259466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019779	A	7	7	262958	262964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_019779	ACA	2	6	264559	264564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_019779	A	6	6	264576	264581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019779	TC	3	6	264593	264598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_019779	C	7	7	264598	264604	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1048	NC_019779	TAG	2	6	264632	264637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019779	ATT	2	6	265604	265609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019779	TC	3	6	265617	265622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_019779	T	7	7	265624	265630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019779	TCTG	2	8	265685	265692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_019779	TGAT	2	8	268400	268407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019779	ACA	2	6	269168	269173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_019779	ACTC	2	8	274229	274236	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_019779	T	7	7	274277	274283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_019779	ATT	2	6	274323	274328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019779	TA	3	6	274358	274363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019779	TAT	2	6	274387	274392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_019779	A	6	6	274393	274398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019779	T	7	7	274403	274409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019779	TAAG	2	8	274419	274426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_019779	ATA	2	6	274481	274486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_019779	AATG	2	8	274496	274503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_019779	C	6	6	274603	274608	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1066	NC_019779	GAAT	2	8	274656	274663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_019779	AAT	2	6	274903	274908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_019779	TTTC	2	8	277611	277618	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_019779	TGAT	2	8	277707	277714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_019779	GGTTG	2	10	277762	277771	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_019779	CTTCT	2	10	277935	277944	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1073	NC_019779	CAG	2	6	277948	277953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019779	GGTTG	2	10	277956	277965	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019779	CTT	2	6	278026	278031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_019779	CTTCT	2	10	278129	278138	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1077	NC_019779	CAG	2	6	278142	278147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_019779	GGTTG	2	10	278150	278159	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_019779	CT	3	6	278223	278228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_019779	CT	3	6	278278	278283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_019779	TGAT	2	8	278316	278323	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_019779	GA	4	8	278811	278818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_019779	T	6	6	278822	278827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019779	CTT	2	6	278874	278879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_019779	TA	3	6	278900	278905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_019779	T	6	6	278906	278911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_019779	AG	3	6	278915	278920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_019779	TTG	2	6	280257	280262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_019779	CAC	2	6	280306	280311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1091	NC_019779	CTC	3	9	280948	280956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_019779	TC	3	6	280955	280960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_019779	T	6	6	281543	281548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_019779	CTG	2	6	281597	281602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_019779	TAA	2	6	281603	281608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_019779	ATCAAA	2	12	281624	281635	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1098	NC_019779	ATA	2	6	282760	282765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_019779	CAA	3	9	284638	284646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_019779	CAA	3	9	287613	287621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_019779	AAT	2	6	287750	287755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_019779	AGTTA	2	10	287759	287768	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_019779	GAA	2	6	287805	287810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_019779	TAA	2	6	289400	289405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019779	ATG	2	6	291526	291531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019779	AAAGC	2	10	291550	291559	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1107	NC_019779	AGG	2	6	291583	291588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_019779	CTT	2	6	292119	292124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_019779	ATCG	2	8	292134	292141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_019779	CGCAG	2	10	292142	292151	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1111	NC_019779	GA	3	6	292152	292157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_019779	GTG	2	6	293546	293551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_019779	GAG	2	6	293555	293560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019779	AC	3	6	294396	294401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_019779	ATT	2	6	296813	296818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_019779	TTG	2	6	296827	296832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_019779	T	6	6	296837	296842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_019779	TTC	2	6	296844	296849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_019779	TAA	2	6	296852	296857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_019779	TCA	2	6	296872	296877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_019779	ACTG	2	8	296883	296890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_019779	T	6	6	296892	296897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_019779	GAA	2	6	298310	298315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019779	ACA	2	6	298319	298324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_019779	CCCA	2	8	299858	299865	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1126	NC_019779	AGG	2	6	299876	299881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_019779	CAA	2	6	303173	303178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_019779	AAT	2	6	303181	303186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_019779	T	6	6	303256	303261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_019779	T	7	7	307325	307331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_019779	ATTA	2	8	307348	307355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_019779	A	6	6	307370	307375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_019779	TGAT	2	8	307398	307405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_019779	T	6	6	307405	307410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_019779	AGA	2	6	307437	307442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_019779	TCAT	2	8	308899	308906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_019779	CT	3	6	308920	308925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1139	NC_019779	TGA	2	6	310352	310357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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