MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 12639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019779	TAT	2	6	127277	127282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019779	AT	3	6	127281	127286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_019779	C	6	6	127324	127329	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
504	NC_019779	G	6	6	127345	127350	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
505	NC_019779	AGG	2	6	127356	127361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_019779	GA	3	6	129071	129076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_019779	CGAAA	2	10	129079	129088	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
508	NC_019779	AG	3	6	129128	129133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_019779	AAC	2	6	129160	129165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_019779	TA	3	6	130027	130032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_019779	AATG	2	8	130042	130049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_019779	C	6	6	130060	130065	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
513	NC_019779	C	7	7	130092	130098	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
514	NC_019779	ATCAC	2	10	130103	130112	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
515	NC_019779	CAA	2	6	130186	130191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_019779	TG	3	6	135004	135009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_019779	TGA	2	6	135024	135029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_019779	A	7	7	135424	135430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_019779	CTC	2	6	135460	135465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_019779	GTT	2	6	135478	135483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_019779	CAA	2	6	135532	135537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_019779	A	7	7	135536	135542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_019779	AGG	2	6	135841	135846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_019779	TCAT	2	8	135857	135864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_019779	CTA	2	6	135865	135870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_019779	AAT	2	6	135942	135947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_019779	GAA	2	6	137542	137547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_019779	CTG	2	6	138539	138544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_019779	GAAA	2	8	138574	138581	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_019779	TC	3	6	138582	138587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_019779	GCA	2	6	138600	138605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_019779	ATG	2	6	139708	139713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_019779	AGAA	2	8	139740	139747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_019779	GAAA	2	8	139765	139772	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_019779	T	6	6	139822	139827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_019779	ACT	2	6	139846	139851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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538	NC_019779	ATT	2	6	139880	139885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_019779	TAA	2	6	139887	139892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_019779	CT	4	8	139912	139919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_019779	CTT	2	6	143726	143731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_019779	A	8	8	143775	143782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_019779	AAT	2	6	143809	143814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_019779	TCTCT	2	10	143829	143838	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
545	NC_019779	T	6	6	143845	143850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_019779	TAT	2	6	143868	143873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_019779	TGA	2	6	143876	143881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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549	NC_019779	CAT	2	6	143965	143970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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551	NC_019779	AATT	2	8	144008	144015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_019779	TAA	3	9	144043	144051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_019779	CTT	2	6	144248	144253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_019779	TGAC	2	8	144257	144264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_019779	GGTTG	2	10	144282	144291	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019779	T	6	6	144356	144361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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558	NC_019779	CAT	2	6	144480	144485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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560	NC_019779	ATT	2	6	144594	144599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_019779	CTA	2	6	144658	144663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_019779	CAA	2	6	144728	144733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_019779	CAA	3	9	144762	144770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_019779	TCT	2	6	144805	144810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_019779	ATC	2	6	144880	144885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_019779	TTA	2	6	144921	144926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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570	NC_019779	TGATGT	2	12	145133	145144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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572	NC_019779	ATTT	2	8	145216	145223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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575	NC_019779	AAT	2	6	145260	145265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_019779	GA	3	6	146001	146006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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583	NC_019779	ATT	2	6	148272	148277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_019779	TCA	2	6	149038	149043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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608	NC_019779	AG	3	6	155848	155853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_019779	GCTG	2	8	155859	155866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
610	NC_019779	AACA	3	12	155884	155895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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615	NC_019779	CT	4	8	156296	156303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_019779	A	7	7	156326	156332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_019779	CCAAA	2	10	156360	156369	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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621	NC_019779	GCT	3	9	156540	156548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_019779	CAG	2	6	156589	156594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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625	NC_019779	TTTA	2	8	156646	156653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_019779	CA	3	6	157289	157294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_019779	TAA	2	6	157340	157345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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