MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 12639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019779	CAG	2	6	1623033	1623038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_019779	GGGT	2	8	1623094	1623101	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_019779	ATT	2	6	1623131	1623136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_019779	TTTCA	2	10	1623234	1623243	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5505	NC_019779	A	6	6	1623262	1623267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_019779	CAT	2	6	1623268	1623273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_019779	TCG	3	9	1623288	1623296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_019779	TTGA	2	8	1625696	1625703	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_019779	A	6	6	1625733	1625738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_019779	CAAA	2	8	1625750	1625757	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5511	NC_019779	TAAAA	2	10	1626442	1626451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_019779	CTT	2	6	1628745	1628750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_019779	ATG	2	6	1628755	1628760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_019779	A	8	8	1628772	1628779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_019779	TAA	2	6	1628813	1628818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_019779	GCT	2	6	1629437	1629442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_019779	TC	3	6	1629443	1629448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5518	NC_019779	GCA	2	6	1629455	1629460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_019779	CCT	2	6	1629506	1629511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_019779	TGC	2	6	1629519	1629524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_019779	TTA	2	6	1630353	1630358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_019779	A	6	6	1630376	1630381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_019779	CCT	2	6	1630399	1630404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_019779	CCA	2	6	1630408	1630413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_019779	GATAA	2	10	1630462	1630471	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_019779	ACTA	2	8	1630478	1630485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5527	NC_019779	TCA	2	6	1632225	1632230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_019779	AAC	2	6	1632326	1632331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_019779	TAA	2	6	1632339	1632344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_019779	TCTT	2	8	1632409	1632416	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5531	NC_019779	TAA	2	6	1632419	1632424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_019779	C	6	6	1632559	1632564	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5533	NC_019779	C	6	6	1632569	1632574	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5534	NC_019779	C	6	6	1632589	1632594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5535	NC_019779	C	6	6	1632598	1632603	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5536	NC_019779	G	6	6	1632612	1632617	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_019779	G	6	6	1632625	1632630	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_019779	GATG	2	8	1632691	1632698	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_019779	GTG	2	6	1632716	1632721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_019779	CG	3	6	1632725	1632730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_019779	AAC	2	6	1632765	1632770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_019779	CAA	2	6	1632771	1632776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_019779	AAG	2	6	1632816	1632821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_019779	A	6	6	1632866	1632871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_019779	GAA	2	6	1632883	1632888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_019779	GGA	2	6	1632895	1632900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_019779	TAA	2	6	1632904	1632909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_019779	AAAG	2	8	1635418	1635425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_019779	ACC	2	6	1635426	1635431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_019779	GGCAA	2	10	1635442	1635451	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5551	NC_019779	GGT	2	6	1635498	1635503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_019779	GAT	2	6	1635510	1635515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_019779	ACAGA	2	10	1635523	1635532	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5554	NC_019779	CGA	2	6	1635555	1635560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_019779	CCAG	2	8	1635628	1635635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_019779	GGTTG	2	10	1636661	1636670	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_019779	TTG	2	6	1636701	1636706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_019779	AAT	2	6	1636788	1636793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_019779	AG	3	6	1636895	1636900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_019779	T	6	6	1636906	1636911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_019779	CGA	2	6	1636952	1636957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_019779	ATGA	2	8	1636967	1636974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_019779	GTCT	2	8	1637104	1637111	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5564	NC_019779	CAC	2	6	1637167	1637172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_019779	A	7	7	1639540	1639546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_019779	ATT	2	6	1640273	1640278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_019779	A	6	6	1640304	1640309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_019779	TTC	2	6	1640318	1640323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_019779	GTT	2	6	1643422	1643427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_019779	T	7	7	1643440	1643446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_019779	TAG	2	6	1643483	1643488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5573	NC_019779	CTA	2	6	1643530	1643535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_019779	G	6	6	1643562	1643567	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_019779	GTC	2	6	1645265	1645270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5577	NC_019779	CTGGG	2	10	1645317	1645326	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5578	NC_019779	GTCAA	2	10	1648586	1648595	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5579	NC_019779	TCC	2	6	1648623	1648628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5580	NC_019779	TAGG	2	8	1648635	1648642	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5582	NC_019779	TTA	2	6	1648681	1648686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_019779	CTTC	2	8	1648687	1648694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_019779	ACCC	2	8	1648715	1648722	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5585	NC_019779	CTT	2	6	1648736	1648741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5587	NC_019779	A	6	6	1648774	1648779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_019779	ATG	2	6	1648878	1648883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5594	NC_019779	CA	3	6	1655434	1655439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_019779	GGA	2	6	1655459	1655464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5598	NC_019779	CTT	2	6	1656457	1656462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_019779	TGAGG	2	10	1657290	1657299	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_019779	GAA	2	6	1657338	1657343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_019779	TGA	2	6	1658948	1658953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_019779	TTG	2	6	1658966	1658971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_019779	TCT	2	6	1659031	1659036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_019779	TCAGA	2	10	1659707	1659716	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5605	NC_019779	T	6	6	1660582	1660587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_019779	TTC	2	6	1661278	1661283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5610	NC_019779	CTG	2	6	1663103	1663108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_019779	AGCC	2	8	1663146	1663153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5612	NC_019779	GCT	2	6	1663168	1663173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5615	NC_019779	CTT	2	6	1664834	1664839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_019779	TTTCT	2	10	1664897	1664906	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5622	NC_019779	AAGC	2	8	1667930	1667937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5623	NC_019779	T	6	6	1667964	1667969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_019779	TTTC	2	8	1667985	1667992	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5625	NC_019779	AT	3	6	1668003	1668008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_019779	AT	3	6	1668739	1668744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_019779	AAC	2	6	1670164	1670169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_019779	A	6	6	1672752	1672757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_019779	GAG	2	6	1672803	1672808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5631	NC_019779	ATA	2	6	1672863	1672868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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