MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 12639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019779	ATG	2	6	1467779	1467784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_019779	AGG	2	6	1467785	1467790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_019779	T	7	7	1467794	1467800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_019779	TTA	2	6	1471042	1471047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_019779	TAT	2	6	1472948	1472953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_019779	CTTT	2	8	1472959	1472966	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_019779	TTTG	2	8	1472970	1472977	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_019779	AAC	2	6	1472991	1472996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_019779	A	6	6	1473005	1473010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_019779	CTC	2	6	1473050	1473055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_019779	GAAGC	2	10	1475221	1475230	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5012	NC_019779	AAG	2	6	1475503	1475508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_019779	CG	3	6	1475526	1475531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_019779	AATC	2	8	1475596	1475603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5015	NC_019779	AGT	2	6	1475631	1475636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_019779	ATCA	2	8	1475676	1475683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_019779	A	7	7	1475690	1475696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_019779	CAT	2	6	1476772	1476777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_019779	ATTG	2	8	1476817	1476824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_019779	GCA	2	6	1476921	1476926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_019779	AAG	2	6	1476941	1476946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_019779	ATT	2	6	1477075	1477080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_019779	TTA	2	6	1478332	1478337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_019779	TTA	2	6	1478358	1478363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_019779	TTTC	2	8	1478374	1478381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_019779	ATTAA	2	10	1478686	1478695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_019779	TCA	2	6	1480180	1480185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_019779	CTT	2	6	1480220	1480225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_019779	C	6	6	1480226	1480231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5030	NC_019779	TCT	2	6	1480843	1480848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_019779	TAA	2	6	1480871	1480876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_019779	TGA	2	6	1480889	1480894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_019779	CAA	2	6	1480902	1480907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_019779	ATG	2	6	1480932	1480937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_019779	TTG	2	6	1481223	1481228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_019779	TAGCA	2	10	1481236	1481245	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5037	NC_019779	TTCT	2	8	1481251	1481258	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_019779	ATT	2	6	1481289	1481294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_019779	A	6	6	1481414	1481419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_019779	GA	3	6	1484296	1484301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_019779	GTT	2	6	1484874	1484879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_019779	AG	3	6	1484907	1484912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_019779	A	7	7	1484917	1484923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_019779	AACTT	2	10	1484928	1484937	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5045	NC_019779	A	6	6	1485269	1485274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_019779	GAA	2	6	1486923	1486928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_019779	TGA	2	6	1487737	1487742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_019779	T	6	6	1487765	1487770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_019779	TAA	2	6	1487815	1487820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_019779	A	6	6	1487940	1487945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_019779	GAT	2	6	1487966	1487971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_019779	AAT	2	6	1487979	1487984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_019779	TCTT	2	8	1489601	1489608	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_019779	C	6	6	1489627	1489632	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5055	NC_019779	T	7	7	1489644	1489650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_019779	CAC	2	6	1489666	1489671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_019779	TAA	2	6	1489679	1489684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_019779	C	6	6	1489726	1489731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5059	NC_019779	C	6	6	1489746	1489751	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5060	NC_019779	C	6	6	1489755	1489760	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5061	NC_019779	G	6	6	1489769	1489774	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_019779	G	6	6	1489782	1489787	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_019779	TGC	2	6	1489829	1489834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_019779	TGT	2	6	1489889	1489894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_019779	ATT	2	6	1492231	1492236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_019779	ATC	2	6	1492312	1492317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_019779	AACA	2	8	1493234	1493241	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_019779	TGCAA	2	10	1494080	1494089	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5069	NC_019779	TACTG	2	10	1496115	1496124	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5070	NC_019779	GTT	2	6	1497919	1497924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_019779	TGT	2	6	1497925	1497930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_019779	TTG	3	9	1497931	1497939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_019779	GTT	2	6	1497947	1497952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_019779	CTG	2	6	1497966	1497971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_019779	AAT	2	6	1498806	1498811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_019779	CTG	2	6	1498855	1498860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_019779	AAG	2	6	1498866	1498871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_019779	TTC	2	6	1500122	1500127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_019779	CCT	2	6	1502223	1502228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_019779	TGC	2	6	1502240	1502245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_019779	TA	3	6	1502250	1502255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_019779	T	7	7	1502285	1502291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_019779	CTG	2	6	1502321	1502326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_019779	TTG	2	6	1503226	1503231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_019779	GTC	2	6	1503247	1503252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_019779	TC	3	6	1504141	1504146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_019779	AAG	2	6	1504213	1504218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_019779	TCT	2	6	1504257	1504262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_019779	A	6	6	1504265	1504270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_019779	ACCG	2	8	1504319	1504326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_019779	TTC	2	6	1505123	1505128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_019779	AGGGT	2	10	1505202	1505211	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_019779	ATA	2	6	1505228	1505233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_019779	GAG	2	6	1505245	1505250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_019779	AATT	2	8	1505653	1505660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_019779	AGG	2	6	1505691	1505696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_019779	GTA	2	6	1505716	1505721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_019779	TGAT	2	8	1508679	1508686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_019779	GTTG	2	8	1508715	1508722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_019779	T	6	6	1508731	1508736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_019779	ATTT	2	8	1509645	1509652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_019779	TTA	2	6	1509711	1509716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_019779	TTC	2	6	1509724	1509729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_019779	ATT	2	6	1509775	1509780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_019779	TAGT	2	8	1510172	1510179	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_019779	AGAA	2	8	1510765	1510772	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_019779	A	7	7	1510779	1510785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_019779	TC	3	6	1510797	1510802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_019779	A	6	6	1510851	1510856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_019779	TTA	2	6	1512434	1512439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_019779	TA	3	6	1517858	1517863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_019779	T	7	7	1519649	1519655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_019779	TGC	2	6	1519778	1519783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_019779	GAT	2	6	1519801	1519806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_019779	TGC	3	9	1519918	1519926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_019779	GCT	2	6	1519943	1519948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_019779	ACC	2	6	1519976	1519981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_019779	ATC	2	6	1519994	1519999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_019779	AGG	2	6	1520064	1520069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_019779	CTT	2	6	1520076	1520081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_019779	CTG	2	6	1520112	1520117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_019779	CAGCC	2	10	1520145	1520154	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5123	NC_019779	GAT	2	6	1520176	1520181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_019779	GGTTG	2	10	1520198	1520207	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_019779	ATCGCG	2	12	1520225	1520236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_019779	A	7	7	1520387	1520393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_019779	T	6	6	1520454	1520459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_019779	CACT	2	8	1520478	1520485	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_019779	AAG	2	6	1520502	1520507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_019779	G	6	6	1520561	1520566	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_019779	AATG	2	8	1520662	1520669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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