MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 3589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019563	TTAAT	2	10	604502	604511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1503	NC_019563	ATA	2	6	605327	605332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_019563	T	6	6	605372	605377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_019563	AGT	2	6	605400	605405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_019563	T	6	6	605411	605416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_019563	T	6	6	605725	605730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_019563	TAT	2	6	605739	605744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_019563	GT	3	6	605786	605791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_019563	A	6	6	607598	607603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_019563	TGAT	2	8	607626	607633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_019563	T	6	6	607666	607671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_019563	AAT	2	6	607688	607693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_019563	AAAT	2	8	607697	607704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_019563	CTTT	2	8	607761	607768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_019563	TC	3	6	607778	607783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_019563	AAT	2	6	607807	607812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_019563	ATC	2	6	608597	608602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1520	NC_019563	ATA	2	6	608623	608628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1522	NC_019563	AAC	2	6	608777	608782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_019563	TA	5	10	608812	608821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_019563	T	6	6	608840	608845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_019563	ACC	2	6	608856	608861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_019563	T	6	6	608877	608882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1529	NC_019563	TAG	2	6	610561	610566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1531	NC_019563	ATA	2	6	611937	611942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_019563	TTTA	2	8	611987	611994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_019563	AG	3	6	612012	612017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_019563	AGA	2	6	612034	612039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_019563	T	6	6	612066	612071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1542	NC_019563	A	6	6	615756	615761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_019563	A	9	9	615831	615839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_019563	TAA	2	6	615862	615867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1550	NC_019563	TAT	2	6	620188	620193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_019563	TTTC	2	8	623710	623717	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1553	NC_019563	ATT	2	6	625638	625643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1555	NC_019563	AACA	2	8	625668	625675	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_019563	A	6	6	631537	631542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1560	NC_019563	T	6	6	636394	636399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_019563	T	6	6	638423	638428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_019563	ATT	2	6	638429	638434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1571	NC_019563	TTA	2	6	639979	639984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1573	NC_019563	TAG	2	6	640751	640756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1575	NC_019563	AATCA	2	10	640822	640831	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1586	NC_019563	TTTA	2	8	644394	644401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1596	NC_019563	ATT	3	9	655076	655084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_019563	AAT	2	6	655092	655097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_019563	T	6	6	655117	655122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1603	NC_019563	AT	3	6	659949	659954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1605	NC_019563	TTC	2	6	660887	660892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_019563	AAC	2	6	662142	662147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1609	NC_019563	CCT	2	6	665080	665085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_019563	A	7	7	665132	665138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1612	NC_019563	GTTT	2	8	665159	665166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_019563	ATTGG	2	10	665168	665177	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_019563	A	6	6	665213	665218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_019563	TTGA	2	8	665234	665241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_019563	T	6	6	665283	665288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_019563	TTG	2	6	665291	665296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_019563	AAAT	2	8	665312	665319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_019563	ATC	2	6	672649	672654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_019563	GTTT	2	8	672669	672676	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_019563	TA	3	6	672685	672690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_019563	ATA	2	6	672699	672704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_019563	T	6	6	672713	672718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_019563	CACC	2	8	672761	672768	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1625	NC_019563	GC	3	6	672777	672782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_019563	T	7	7	672920	672926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_019563	T	6	6	672931	672936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_019563	TAA	2	6	672953	672958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_019563	AGT	2	6	672968	672973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_019563	GTGG	2	8	673033	673040	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_019563	ATT	3	9	673071	673079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_019563	CTT	2	6	673203	673208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1634	NC_019563	CTT	2	6	673222	673227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_019563	TGA	2	6	673229	673234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_019563	T	6	6	678264	678269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_019563	AAAGC	2	10	678315	678324	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1639	NC_019563	GTT	2	6	679114	679119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_019563	A	14	14	862599	862612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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