MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 3589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019563	GGCTT	2	10	312126	312135	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1002	NC_019563	TTTC	2	8	312249	312256	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_019563	C	6	6	312406	312411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1004	NC_019563	CAC	2	6	312421	312426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_019563	T	6	6	312489	312494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019563	TTTA	2	8	312539	312546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019563	AATG	2	8	314496	314503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019563	GATT	2	8	314534	314541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019563	AT	3	6	315375	315380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_019563	A	7	7	315389	315395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019563	TATAAT	2	12	315406	315417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_019563	ATT	2	6	318507	318512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019563	ATT	2	6	322194	322199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019563	TTTG	2	8	322203	322210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019563	T	6	6	322222	322227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019563	GTA	2	6	322228	322233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019563	TTA	2	6	322292	322297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_019563	CAA	2	6	322335	322340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_019563	T	6	6	322972	322977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019563	ATT	2	6	322985	322990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019563	ATT	2	6	323057	323062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019563	ATTT	2	8	323082	323089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_019563	TTA	2	6	323094	323099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_019563	TTA	2	6	327287	327292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_019563	AAC	2	6	327314	327319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_019563	T	7	7	327325	327331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019563	ATTAAA	2	12	327351	327362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019563	G	6	6	328494	328499	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019563	CT	3	6	328567	328572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_019563	T	6	6	328593	328598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019563	A	6	6	328609	328614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019563	AAAG	2	8	328702	328709	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019563	T	6	6	328711	328716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_019563	T	6	6	328731	328736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019563	TAA	2	6	328744	328749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019563	CT	3	6	329638	329643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_019563	AGA	2	6	329647	329652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019563	GA	3	6	329651	329656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_019563	A	7	7	329659	329665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019563	CCTT	2	8	331778	331785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_019563	A	13	13	331879	331891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019563	T	6	6	331904	331909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019563	AG	3	6	331925	331930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_019563	A	7	7	332035	332041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019563	TGT	2	6	333591	333596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019563	TAC	2	6	333602	333607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_019563	A	14	14	333650	333663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019563	TA	3	6	334234	334239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019563	A	7	7	335218	335224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019563	TTG	2	6	335234	335239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019563	A	8	8	335278	335285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019563	AG	3	6	335397	335402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019563	A	6	6	335537	335542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019563	TTCA	2	8	336305	336312	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_019563	TTTA	2	8	336332	336339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_019563	GT	3	6	336346	336351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_019563	A	7	7	336391	336397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019563	CTT	2	6	337870	337875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_019563	T	6	6	337936	337941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_019563	TGAT	2	8	337950	337957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019563	A	6	6	338036	338041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019563	TCA	2	6	338044	338049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_019563	TAA	2	6	344401	344406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_019563	C	6	6	348034	348039	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1065	NC_019563	T	6	6	348116	348121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019563	AG	3	6	348809	348814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_019563	AAATC	2	10	348840	348849	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1068	NC_019563	A	6	6	348853	348858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_019563	TAAA	2	8	348876	348883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_019563	T	6	6	348934	348939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_019563	ATT	2	6	348954	348959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019563	TCA	2	6	348990	348995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_019563	ATTT	2	8	350403	350410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_019563	AAAG	2	8	350413	350420	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019563	AG	3	6	352421	352426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_019563	TGG	2	6	353158	353163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_019563	TAA	2	6	353221	353226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_019563	AGG	2	6	353287	353292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_019563	CCT	2	6	355889	355894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_019563	TAT	2	6	357745	357750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_019563	A	6	6	357771	357776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_019563	TTG	2	6	357797	357802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_019563	T	6	6	357812	357817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019563	AAC	2	6	357829	357834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_019563	G	8	8	357868	357875	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_019563	TGAT	2	8	357912	357919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_019563	G	6	6	359630	359635	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_019563	T	7	7	361268	361274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_019563	G	6	6	361298	361303	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_019563	TTTG	2	8	363857	363864	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_019563	AGCG	2	8	363880	363887	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_019563	TAA	2	6	363915	363920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019563	AAAG	2	8	366824	366831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_019563	A	6	6	367195	367200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_019563	GA	3	6	367203	367208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_019563	ATT	2	6	367261	367266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_019563	TAG	2	6	367308	367313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_019563	GAAG	2	8	367347	367354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_019563	A	9	9	368246	368254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_019563	T	6	6	368257	368262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019563	GCAT	2	8	368327	368334	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_019563	ATT	2	6	368439	368444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_019563	GT	3	6	368896	368901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_019563	TAAA	2	8	369062	369069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019563	TTG	2	6	369113	369118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019563	GTT	2	6	370521	370526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_019563	TCAA	2	8	370579	370586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_019563	A	6	6	370585	370590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019563	T	6	6	370610	370615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_019563	T	6	6	370643	370648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019563	T	6	6	370674	370679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_019563	AG	3	6	370762	370767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_019563	ATA	2	6	373143	373148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019563	ATT	2	6	373181	373186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019563	TAT	2	6	373192	373197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_019563	CAT	2	6	373264	373269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_019563	A	6	6	373298	373303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_019563	TA	3	6	374155	374160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_019563	T	7	7	374163	374169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_019563	T	6	6	374176	374181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_019563	T	6	6	376829	376834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_019563	TAT	2	6	378045	378050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_019563	AACGA	2	10	378412	378421	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_019563	TAC	2	6	378430	378435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_019563	TGA	2	6	378909	378914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_019563	A	6	6	379618	379623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_019563	TAT	2	6	381400	381405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_019563	ACTCT	2	10	388332	388341	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1129	NC_019563	T	6	6	393153	393158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_019563	ATTTTA	2	12	393195	393206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_019563	A	6	6	393240	393245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_019563	ATTT	2	8	396192	396199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_019563	A	6	6	396255	396260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_019563	A	7	7	401150	401156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_019563	TTTA	2	8	401194	401201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_019563	GTTT	2	8	401208	401215	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_019563	T	6	6	402913	402918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_019563	AT	3	6	402922	402927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_019563	AGA	2	6	402937	402942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_019563	TAAGG	2	10	403054	403063	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1142	NC_019563	AAG	2	6	403135	403140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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