MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 3589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019563	T	6	6	137117	137122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019563	GC	3	6	137203	137208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_019563	A	6	6	137287	137292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_019563	GTGTGA	2	12	139514	139525	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_019563	T	6	6	139615	139620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_019563	ACA	2	6	139672	139677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_019563	CTTT	2	8	140383	140390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
508	NC_019563	TTC	2	6	140395	140400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_019563	AATT	2	8	140448	140455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_019563	TAA	2	6	140460	140465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_019563	TG	3	6	141342	141347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_019563	T	6	6	143550	143555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_019563	T	6	6	147855	147860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_019563	AAT	2	6	147886	147891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_019563	ATA	2	6	147915	147920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019563	T	7	7	147922	147928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_019563	TTTA	2	8	148726	148733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_019563	AAT	2	6	148770	148775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_019563	CAAT	2	8	151379	151386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_019563	CAA	2	6	151450	151455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_019563	T	7	7	155990	155996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_019563	T	6	6	157431	157436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_019563	CAG	2	6	157572	157577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_019563	TG	3	6	157593	157598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_019563	TAA	2	6	160585	160590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_019563	A	6	6	160608	160613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_019563	CT	3	6	160623	160628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_019563	A	6	6	160670	160675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_019563	TGT	2	6	160718	160723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_019563	CAT	2	6	160789	160794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_019563	A	6	6	160810	160815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_019563	AAGA	3	12	160820	160831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_019563	T	6	6	160873	160878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_019563	ATT	2	6	160888	160893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_019563	AAT	2	6	160912	160917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_019563	C	6	6	160922	160927	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
537	NC_019563	TTAAA	2	10	162009	162018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_019563	CAT	2	6	162019	162024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_019563	AAG	2	6	162028	162033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_019563	CAT	2	6	162051	162056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_019563	AAT	2	6	162062	162067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_019563	T	6	6	162100	162105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_019563	A	6	6	166597	166602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_019563	T	6	6	166973	166978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_019563	T	6	6	166985	166990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_019563	GC	3	6	167083	167088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
547	NC_019563	A	6	6	167107	167112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_019563	T	7	7	167151	167157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_019563	G	6	6	168592	168597	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
550	NC_019563	TTA	2	6	170831	170836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_019563	GA	3	6	170857	170862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_019563	TAA	2	6	170910	170915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_019563	AAAATA	2	12	170916	170927	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_019563	AAT	2	6	170931	170936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_019563	TAA	2	6	170953	170958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019563	T	6	6	172150	172155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_019563	AGT	2	6	172237	172242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_019563	TTTTA	2	10	172251	172260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_019563	ATA	2	6	172643	172648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_019563	AATAT	2	10	173252	173261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_019563	GAAAG	2	10	179990	179999	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
562	NC_019563	TAG	2	6	183188	183193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_019563	T	6	6	183201	183206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_019563	GAT	3	9	183712	183720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_019563	TTGG	2	8	186184	186191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_019563	CAA	2	6	186237	186242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_019563	GCA	2	6	186280	186285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_019563	AAC	2	6	186300	186305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_019563	ATG	2	6	186338	186343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_019563	T	7	7	186345	186351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_019563	TTTA	2	8	186382	186389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_019563	A	6	6	186394	186399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_019563	T	12	12	186403	186414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_019563	ATT	2	6	186415	186420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_019563	TA	3	6	186455	186460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_019563	ATTT	2	8	186466	186473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_019563	T	6	6	190469	190474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_019563	CAA	2	6	190525	190530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_019563	CCT	2	6	192958	192963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_019563	ATT	2	6	192975	192980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_019563	AGT	2	6	192991	192996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_019563	TA	11	22	192998	193019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_019563	TTA	2	6	193037	193042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_019563	CT	3	6	193045	193050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_019563	T	6	6	193050	193055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_019563	TAT	2	6	193068	193073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019563	AATAA	2	10	193084	193093	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_019563	TAT	2	6	200817	200822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_019563	ATTG	2	8	201947	201954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_019563	TA	3	6	201961	201966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_019563	TGAT	2	8	201967	201974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
592	NC_019563	TTTC	2	8	202030	202037	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_019563	TGT	3	9	202043	202051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_019563	TGT	2	6	202119	202124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_019563	ATA	2	6	202130	202135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_019563	A	7	7	202146	202152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_019563	GGC	2	6	202214	202219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_019563	GAT	2	6	202341	202346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_019563	TTG	2	6	202412	202417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_019563	AC	3	6	202474	202479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_019563	GCA	2	6	202514	202519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_019563	AGC	2	6	202553	202558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_019563	CGC	2	6	202561	202566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_019563	GGA	2	6	202569	202574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_019563	AGA	2	6	202609	202614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_019563	CAG	2	6	202657	202662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_019563	AGTC	2	8	202730	202737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_019563	ACT	2	6	202780	202785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_019563	AGGT	2	8	202803	202810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_019563	CTG	2	6	202874	202879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_019563	GATG	2	8	202957	202964	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_019563	GTT	2	6	202968	202973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_019563	TC	3	6	202985	202990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_019563	GAA	2	6	203113	203118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_019563	GA	3	6	203139	203144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_019563	TGC	2	6	203194	203199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_019563	GTC	2	6	203206	203211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_019563	TCGTG	2	10	203215	203224	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
619	NC_019563	AGG	3	9	203315	203323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_019563	GAC	2	6	203332	203337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_019563	TCA	2	6	203344	203349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_019563	AC	3	6	203370	203375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_019563	CA	4	8	203611	203618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_019563	CCT	2	6	203674	203679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_019563	CTT	2	6	203742	203747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_019563	TCTT	2	8	203777	203784	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_019563	T	6	6	203783	203788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_019563	CTT	2	6	203790	203795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_019563	TTCT	2	8	203807	203814	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
630	NC_019563	TTGT	2	8	203862	203869	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
631	NC_019563	TTGA	2	8	203918	203925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_019563	TTGA	2	8	204013	204020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_019563	GCTT	2	8	204056	204063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
634	NC_019563	TTGT	2	8	204065	204072	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
635	NC_019563	TGTT	2	8	204083	204090	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
636	NC_019563	CTT	2	6	204142	204147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_019563	TTTTA	2	10	204250	204259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_019563	TTGA	2	8	204331	204338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
639	NC_019563	AGCG	2	8	204682	204689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
640	NC_019563	CTTT	2	8	204781	204788	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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642	NC_019563	A	7	7	206138	206144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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