MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019560	TTTTA	2	10	2428	2437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019560	GAAAC	2	10	4642	4651	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019560	GCTTT	2	10	13333	13342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019560	GGCAT	2	10	22625	22634	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019560	TAATA	2	10	25018	25027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019560	ATTTT	2	10	42181	42190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019560	TTAAA	2	10	57474	57483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019560	TCTAC	2	10	64317	64326	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_019560	AATAT	2	10	64458	64467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019560	ATTTG	2	10	64832	64841	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019560	AAGAT	2	10	65068	65077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019560	TTTTA	2	10	75391	75400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019560	TTACA	2	10	77276	77285	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019560	TAAGA	2	10	92528	92537	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019560	TAAAA	2	10	92599	92608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019560	CAAAA	2	10	108642	108651	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019560	TTAAT	2	10	117840	117849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019560	CAAAT	2	10	158065	158074	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019560	TTTAA	2	10	182076	182085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019560	AGAGG	2	10	188630	188639	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019560	AAACA	2	10	206260	206269	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019560	TTTTA	2	10	219239	219248	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019560	AAAAC	2	10	224290	224299	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019560	CTTAA	2	10	230534	230543	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019560	CAAAA	2	10	239265	239274	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019560	AAATT	2	10	248567	248576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019560	CAATC	2	10	257676	257685	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_019560	CTCTT	2	10	262432	262441	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_019560	AAATA	2	10	274557	274566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019560	GTTTT	2	10	280177	280186	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019560	TTATA	2	10	321456	321465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019560	AAGTT	2	10	328032	328041	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019560	TATAA	2	10	342418	342427	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019560	TAACC	2	10	352019	352028	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019560	AAAAC	2	10	376374	376383	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019560	AATCA	2	10	399248	399257	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019560	AAAGG	2	10	411959	411968	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019560	TTAAT	2	10	413570	413579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019560	ATAAA	2	10	423764	423773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019560	AAAAT	2	10	423798	423807	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019560	ATGAA	2	10	436387	436396	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019560	TGCTA	2	10	436987	436996	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019560	TAATT	2	10	439223	439232	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019560	AACCT	2	10	439563	439572	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_019560	TTTTC	2	10	439702	439711	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019560	ACCCT	2	10	439752	439761	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_019560	CATGA	2	10	439905	439914	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019560	AATTT	2	10	440098	440107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019560	CTTTC	2	10	469387	469396	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_019560	TTTTG	2	10	479534	479543	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019560	AAAGC	2	10	481194	481203	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019560	TAACA	2	10	488800	488809	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019560	TAAAA	2	10	490279	490288	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019560	AAAAT	2	10	494921	494930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019560	GAATG	2	10	501866	501875	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019560	TATCC	2	10	503290	503299	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_019560	AGTTT	2	10	511487	511496	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019560	ATTTT	2	10	512929	512938	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019560	TAACT	2	10	516003	516012	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019560	AGGCT	2	10	525268	525277	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019560	TTTAT	2	10	530724	530733	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019560	TAAAA	2	10	531006	531015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019560	GCTAT	2	10	542002	542011	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019560	ATTTT	2	10	542035	542044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019560	TTGTA	2	10	546031	546040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019560	TAAGG	2	10	579744	579753	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019560	ATTTT	2	10	579971	579980	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019560	TTTGT	2	10	595118	595127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019560	TTTAT	2	10	631812	631821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019560	TTTAA	2	10	632359	632368	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019560	ATTTT	2	10	668110	668119	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019560	TAAAT	2	10	681231	681240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019560	AAAAC	2	10	684399	684408	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019560	TAAAA	2	10	684410	684419	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019560	TTCTA	2	10	694909	694918	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019560	ATCAA	2	10	708313	708322	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019560	TATTG	2	10	710408	710417	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019560	AATTT	2	10	716215	716224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019560	ACCAC	2	10	716716	716725	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_019560	TTGAT	2	10	719966	719975	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019560	TTCTA	2	10	727293	727302	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019560	TCTTT	2	10	751985	751994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019560	TTTTA	2	10	770344	770353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019560	TTTTA	2	10	779560	779569	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019560	TTTTA	2	10	785629	785638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019560	TAAGA	2	10	819736	819745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019560	ATTAA	2	10	823532	823541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019560	TTTAA	2	10	862532	862541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019560	ATTTT	2	10	867179	867188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019560	TATAA	2	10	878288	878297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019560	GATTG	2	10	892142	892151	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019560	TAAAA	2	10	898583	898592	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019560	TCAAG	2	10	929590	929599	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019560	TTCCT	2	10	952140	952149	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_019560	TTTCC	2	10	992991	993000	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_019560	TTCAA	2	10	1010023	1010032	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_019560	CTCAT	2	10	1010253	1010262	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_019560	TCACT	2	10	1011733	1011742	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_019560	TACTT	2	10	1012032	1012041	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019560	TAACT	2	10	1012221	1012230	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019560	TTAAA	2	10	1012482	1012491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019560	TTAAA	2	10	1012499	1012508	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019560	TTAAA	2	10	1012516	1012525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019560	TTAAA	2	10	1012533	1012542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019560	TTAAA	2	10	1012550	1012559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019560	TTAAA	2	10	1012567	1012576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019560	AAAAT	2	10	1035822	1035831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019560	AATTG	2	10	1053188	1053197	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019560	ATAAA	2	10	1057267	1057276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019560	TAAAA	2	10	1068211	1068220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019560	TGAAA	2	10	1082545	1082554	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019560	CTTTG	2	10	1082745	1082754	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019560	AAATC	2	10	1096266	1096275	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019560	TTTAA	2	10	1105741	1105750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019560	GTTTA	2	10	1111103	1111112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019560	TTTAA	2	10	1113163	1113172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019560	CAAAA	2	10	1128038	1128047	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_019560	TTGAT	2	10	1128645	1128654	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019560	TTCTT	2	10	1128990	1128999	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019560	TTTGT	2	10	1129116	1129125	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019560	ACTTG	2	10	1129298	1129307	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019560	GATTT	2	10	1131800	1131809	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019560	CACGA	2	10	1133247	1133256	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_019560	TTACC	2	10	1134045	1134054	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019560	TTAAA	2	10	1142518	1142527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019560	AAAAG	2	10	1144107	1144116	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019560	GATTT	2	10	1150866	1150875	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019560	TAAAA	2	10	1154527	1154536	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019560	TTAAT	2	10	1169228	1169237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019560	TATTT	2	10	1169264	1169273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019560	TTGTG	2	10	1169296	1169305	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019560	ATTTT	2	10	1171659	1171668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019560	AATCA	2	10	1175075	1175084	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_019560	AATCC	2	10	1201319	1201328	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_019560	CTAGA	2	10	1201872	1201881	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019560	ATAAA	2	10	1204020	1204029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019560	CCTCC	2	10	1204116	1204125	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
138	NC_019560	ATGAG	2	10	1231154	1231163	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019560	AACAA	2	10	1231179	1231188	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019560	TAAAT	2	10	1243583	1243592	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019560	TAAGC	2	10	1275284	1275293	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_019560	CCTTT	2	10	1294322	1294331	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_019560	TATAT	2	10	1301061	1301070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019560	TTATT	2	10	1301669	1301678	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019560	AATAA	2	10	1302062	1302071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019560	TATTT	2	10	1303469	1303478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_019560	TTAAA	2	10	1392769	1392778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_019560	ATAAA	2	10	1610625	1610634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_019560	TAAAA	2	10	1611940	1611949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_019560	TTAAA	2	10	1612370	1612379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_019560	AGTGA	2	10	1614277	1614286	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.