MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 290

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018939	GA	11	22	7221	7242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018939	CA	3	6	16681	16686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018939	GC	3	6	23091	23096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018939	GT	3	6	25516	25521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018939	TA	3	6	27502	27507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018939	AG	3	6	40629	40634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018939	GT	3	6	44299	44304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018939	GT	3	6	44343	44348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018939	AG	4	8	44457	44464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018939	CT	3	6	44924	44929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018939	TC	3	6	62122	62127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018939	TA	4	8	81806	81813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018939	TC	3	6	84143	84148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018939	AG	3	6	88749	88754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018939	AG	3	6	88777	88782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018939	AG	3	6	97173	97178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018939	TA	3	6	97221	97226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018939	TA	3	6	100507	100512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018939	TA	3	6	129149	129154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018939	TA	4	8	130816	130823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018939	AT	3	6	132282	132287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018939	CA	3	6	139419	139424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018939	AG	3	6	140383	140388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018939	GA	4	8	141698	141705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018939	GA	3	6	146752	146757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018939	TG	3	6	168840	168845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018939	CT	3	6	169847	169852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018939	TG	3	6	170070	170075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018939	TC	3	6	172459	172464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018939	CT	3	6	173269	173274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018939	AC	3	6	181851	181856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018939	AT	3	6	187933	187938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018939	GA	3	6	187939	187944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018939	AG	3	6	193163	193168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018939	CT	3	6	193181	193186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018939	CT	3	6	193197	193202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018939	TA	3	6	208492	208497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018939	GC	3	6	216146	216151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018939	TG	3	6	230964	230969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018939	CT	3	6	233674	233679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018939	AG	3	6	234958	234963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018939	GT	3	6	238603	238608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018939	GA	3	6	244461	244466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018939	TG	3	6	244712	244717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018939	AT	3	6	270964	270969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018939	GA	3	6	297974	297979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018939	AG	3	6	331803	331808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018939	TG	3	6	334262	334267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018939	AG	3	6	340782	340787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018939	TC	3	6	349372	349377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018939	TC	4	8	351526	351533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018939	TC	4	8	351536	351543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018939	AT	3	6	380881	380886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018939	AC	3	6	380917	380922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018939	CT	3	6	395104	395109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018939	TA	3	6	397621	397626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018939	GA	3	6	399885	399890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018939	AG	3	6	445370	445375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018939	AG	3	6	445490	445495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018939	AT	3	6	446174	446179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018939	TG	3	6	446386	446391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018939	AT	3	6	446626	446631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018939	TG	3	6	447734	447739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018939	AC	3	6	448055	448060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018939	TG	3	6	448158	448163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018939	AG	3	6	448279	448284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018939	AT	3	6	452267	452272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018939	TG	3	6	452581	452586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018939	GA	3	6	453597	453602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018939	GA	3	6	453791	453796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018939	CA	3	6	454062	454067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018939	AG	3	6	454150	454155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018939	CA	3	6	466600	466605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018939	AG	3	6	466781	466786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018939	AG	4	8	467576	467583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018939	AG	3	6	468334	468339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018939	AG	3	6	468372	468377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018939	TC	3	6	468454	468459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018939	AG	3	6	468513	468518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018939	GA	3	6	469834	469839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018939	AC	3	6	474079	474084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018939	AT	3	6	474349	474354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018939	GA	3	6	474534	474539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018939	AG	3	6	474811	474816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018939	TG	3	6	479559	479564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018939	AT	4	8	494162	494169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_018939	AG	3	6	508000	508005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018939	TA	3	6	509083	509088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018939	GA	3	6	530041	530046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018939	TA	3	6	530695	530700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018939	AT	3	6	530865	530870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018939	TG	3	6	537528	537533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018939	CT	3	6	538020	538025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018939	GA	3	6	547704	547709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018939	CA	3	6	547760	547765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018939	GA	3	6	564037	564042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018939	AG	4	8	564317	564324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018939	AG	3	6	565947	565952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018939	GA	3	6	567151	567156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018939	AC	3	6	567732	567737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018939	GA	3	6	568043	568048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018939	AC	4	8	579530	579537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018939	GT	3	6	579838	579843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018939	AG	3	6	583754	583759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018939	AG	3	6	583805	583810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018939	AG	3	6	583841	583846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018939	TC	3	6	584490	584495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018939	GA	4	8	591170	591177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018939	AG	3	6	591334	591339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018939	AC	3	6	591458	591463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018939	AC	3	6	596991	596996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018939	AT	3	6	600061	600066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018939	AG	3	6	605764	605769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018939	AT	3	6	629804	629809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018939	GC	3	6	648040	648045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018939	CA	3	6	651080	651085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018939	TG	4	8	651154	651161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018939	TC	3	6	652815	652820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018939	TC	3	6	653271	653276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018939	AG	3	6	653695	653700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018939	CT	3	6	684776	684781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018939	TA	3	6	699485	699490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018939	CT	3	6	700747	700752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018939	TA	3	6	715040	715045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018939	AG	3	6	716230	716235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018939	TA	3	6	739407	739412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_018939	TC	3	6	756814	756819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018939	CT	3	6	757213	757218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018939	AG	3	6	761276	761281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018939	AG	3	6	762580	762585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018939	AG	3	6	767616	767621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_018939	AG	3	6	799003	799008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018939	TG	3	6	799659	799664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018939	CT	9	18	799718	799735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018939	CA	3	6	800203	800208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018939	CA	3	6	800216	800221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018939	AG	3	6	808895	808900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018939	GA	3	6	834530	834535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018939	TC	3	6	839445	839450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018939	CG	3	6	846882	846887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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150	NC_018939	AT	3	6	938294	938299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018939	TA	3	6	938312	938317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018939	AC	3	6	938425	938430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018939	TC	3	6	938455	938460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.