MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017944	GA	3	6	1425	1430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017944	TA	3	6	1576	1581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017944	AC	3	6	1588	1593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017944	TA	3	6	1750	1755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017944	TC	3	6	1853	1858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017944	AT	3	6	5365	5370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017944	TC	4	8	6121	6128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017944	CT	3	6	7438	7443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017944	AG	3	6	8006	8011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017944	TA	3	6	9491	9496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017944	CG	3	6	11432	11437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017944	CA	3	6	12353	12358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017944	AC	3	6	16693	16698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017944	AT	3	6	21112	21117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017944	AC	3	6	21118	21123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017944	CT	3	6	21129	21134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017944	AT	3	6	22850	22855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017944	TC	3	6	25099	25104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017944	TG	3	6	25291	25296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017944	GC	3	6	25391	25396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017944	CG	3	6	25517	25522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017944	CT	3	6	25526	25531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017944	CA	3	6	30911	30916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017944	TG	3	6	31161	31166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017944	GA	3	6	31677	31682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017944	AT	3	6	34632	34637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017944	TG	3	6	34940	34945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017944	AT	3	6	35015	35020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017944	GA	3	6	35386	35391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017944	GC	3	6	38207	38212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017944	GA	3	6	41225	41230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017944	CG	3	6	43617	43622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017944	TC	3	6	43899	43904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017944	CA	3	6	45373	45378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017944	TG	4	8	45491	45498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017944	TC	3	6	46953	46958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017944	AC	3	6	47135	47140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017944	AG	3	6	47313	47318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017944	CA	3	6	47361	47366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017944	GT	3	6	47381	47386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017944	TA	3	6	49061	49066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017944	AT	3	6	49100	49105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017944	CT	3	6	50052	50057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017944	CT	3	6	50765	50770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017944	GA	3	6	51811	51816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017944	GT	3	6	51974	51979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017944	AC	3	6	52026	52031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017944	AG	3	6	52825	52830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017944	TG	3	6	52831	52836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017944	CG	3	6	52877	52882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017944	GT	3	6	54415	54420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017944	CA	3	6	54715	54720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017944	TG	3	6	54774	54779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017944	AT	3	6	55278	55283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017944	TG	3	6	56606	56611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017944	AT	3	6	56647	56652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017944	CT	3	6	56738	56743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017944	AT	3	6	58027	58032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017944	TC	4	8	58089	58096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017944	AG	3	6	62581	62586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017944	CT	3	6	62626	62631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017944	TG	3	6	62657	62662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017944	GT	3	6	66988	66993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017944	GC	3	6	69971	69976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017944	CA	3	6	70401	70406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017944	TC	3	6	70451	70456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017944	TA	3	6	70463	70468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017944	CG	3	6	70730	70735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017944	CT	3	6	71400	71405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017944	AG	3	6	71835	71840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017944	TG	3	6	72323	72328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017944	GT	3	6	73124	73129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017944	AT	3	6	73146	73151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017944	TA	3	6	73162	73167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017944	TC	4	8	87758	87765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017944	TG	3	6	88646	88651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017944	TG	3	6	89750	89755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017944	CT	3	6	91572	91577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017944	GA	3	6	95849	95854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017944	TG	3	6	97957	97962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017944	GT	3	6	98607	98612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017944	AG	3	6	98957	98962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017944	AG	3	6	101517	101522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017944	GA	3	6	105316	105321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017944	AC	3	6	106022	106027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017944	AT	3	6	108840	108845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017944	TC	3	6	110013	110018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017944	GA	3	6	110395	110400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017944	AC	3	6	110478	110483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017944	TC	3	6	110856	110861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017944	CT	4	8	111293	111300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017944	CG	3	6	111893	111898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017944	TC	3	6	112656	112661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017944	GA	3	6	112859	112864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017944	CT	3	6	115303	115308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017944	CA	3	6	115423	115428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017944	GC	3	6	117558	117563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017944	CG	3	6	117620	117625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017944	GA	3	6	127675	127680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017944	GT	3	6	127782	127787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017944	GT	3	6	127804	127809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017944	GA	3	6	127861	127866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017944	CG	3	6	128731	128736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017944	CA	3	6	129843	129848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017944	GT	3	6	130945	130950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017944	GC	4	8	131139	131146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017944	TA	3	6	131160	131165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017944	GA	3	6	136704	136709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017944	TC	3	6	136784	136789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017944	AC	3	6	137219	137224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017944	CA	3	6	137228	137233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017944	CA	3	6	137251	137256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017944	GA	3	6	140138	140143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017944	TA	3	6	147264	147269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017944	TG	3	6	147282	147287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017944	CG	3	6	147290	147295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017944	GA	3	6	147355	147360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017944	GA	3	6	147435	147440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017944	AG	3	6	152003	152008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017944	GA	3	6	152113	152118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017944	AT	3	6	154183	154188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017944	GC	4	8	163511	163518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017944	CG	3	6	164074	164079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017944	CA	3	6	166845	166850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017944	CA	3	6	167646	167651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017944	AG	3	6	167698	167703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017944	GT	3	6	169974	169979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017944	AG	3	6	173889	173894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017944	AT	3	6	174289	174294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017944	TA	3	6	174432	174437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017944	GA	3	6	174530	174535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017944	TC	3	6	174541	174546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017944	GA	3	6	177399	177404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017944	AT	3	6	179761	179766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017944	GA	3	6	179838	179843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017944	TA	4	8	182705	182712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017944	AC	3	6	190522	190527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017944	GT	3	6	192514	192519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017944	AC	3	6	192569	192574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017944	CA	3	6	192844	192849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017944	TA	3	6	194238	194243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017944	CA	3	6	194282	194287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017944	GA	3	6	194333	194338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017944	TC	3	6	197595	197600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017944	TG	3	6	203001	203006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017944	GT	3	6	203184	203189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017944	TA	3	6	204817	204822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017944	GA	3	6	204922	204927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017944	TC	3	6	206211	206216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017944	GT	3	6	207659	207664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017944	AG	3	6	212177	212182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017944	AT	3	6	215386	215391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017944	AT	3	6	217737	217742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017944	AT	3	6	217854	217859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017944	AC	3	6	218820	218825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_017944	AT	3	6	218894	218899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.