MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 1933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017944	TGA	2	6	384954	384959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017944	AAT	2	6	389731	389736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017944	GTC	2	6	391075	391080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_017944	ACC	2	6	391093	391098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_017944	CGAC	2	8	391099	391106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_017944	CGAC	2	8	391137	391144	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_017944	CGA	2	6	391160	391165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_017944	CAA	2	6	391708	391713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_017944	TAAT	2	8	391714	391721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017944	GTCG	2	8	393556	393563	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_017944	GCG	2	6	393625	393630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_017944	TA	3	6	396221	396226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017944	CGTGT	2	10	396229	396238	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1514	NC_017944	GCT	2	6	396908	396913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_017944	GAC	2	6	396930	396935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_017944	AGTG	2	8	396940	396947	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017944	TATT	2	8	396967	396974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017944	GC	3	6	397767	397772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_017944	CAC	2	6	397775	397780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_017944	ATA	2	6	397781	397786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017944	GCC	2	6	397967	397972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_017944	GC	3	6	397999	398004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_017944	AAT	2	6	398012	398017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017944	CCT	2	6	398034	398039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_017944	CGT	3	9	398080	398088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_017944	CCAG	2	8	398174	398181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_017944	CTG	2	6	398210	398215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_017944	ATCTC	2	10	398242	398251	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1529	NC_017944	A	6	6	398303	398308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017944	AT	3	6	398319	398324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017944	TCA	2	6	399225	399230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017944	ACG	2	6	399235	399240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_017944	GAT	2	6	399248	399253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017944	ACGG	2	8	399263	399270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_017944	ATG	2	6	400554	400559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017944	AAG	2	6	400562	400567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017944	TTAT	2	8	400654	400661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017944	GGAAC	2	10	401331	401340	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1539	NC_017944	ACT	2	6	401492	401497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_017944	TCG	2	6	402063	402068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_017944	TAT	2	6	402118	402123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017944	AT	3	6	402130	402135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017944	CAG	2	6	402260	402265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017944	TTC	2	6	402308	402313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_017944	CACCT	2	10	402866	402875	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1546	NC_017944	GAA	2	6	402973	402978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017944	ACG	2	6	402999	403004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_017944	AGG	2	6	403006	403011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017944	GGT	2	6	403023	403028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017944	TAG	2	6	403037	403042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017944	GGT	2	6	403056	403061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017944	TAG	2	6	403070	403075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017944	GAC	2	6	403161	403166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_017944	CGA	2	6	403187	403192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_017944	CTTG	2	8	403215	403222	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_017944	GTC	2	6	403242	403247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_017944	AGA	2	6	403267	403272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017944	CA	3	6	403292	403297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_017944	CTC	2	6	403302	403307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_017944	GCA	2	6	403330	403335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017944	AGCG	2	8	403409	403416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_017944	CGT	2	6	403743	403748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_017944	GTC	2	6	403765	403770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_017944	AT	3	6	403784	403789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017944	GACT	2	8	403859	403866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_017944	TCGTG	2	10	403995	404004	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1567	NC_017944	CTGG	2	8	404158	404165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_017944	ATTT	2	8	404176	404183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017944	GTT	2	6	404227	404232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017944	CGT	2	6	404651	404656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_017944	TCG	2	6	404694	404699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_017944	TA	3	6	404779	404784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017944	ACG	2	6	404789	404794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_017944	CTAT	2	8	404823	404830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_017944	CAA	2	6	404881	404886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_017944	ACG	2	6	404887	404892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_017944	CCCTC	2	10	405367	405376	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1578	NC_017944	CGA	2	6	405999	406004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1581	NC_017944	T	6	6	407522	407527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017944	AG	3	6	407547	407552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017944	CTAT	2	8	407626	407633	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_017944	GAC	2	6	407666	407671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_017944	G	6	6	407701	407706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017944	GTC	2	6	409338	409343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_017944	GGGA	2	8	409400	409407	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017944	CTG	2	6	409415	409420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_017944	TCCG	2	8	409464	409471	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_017944	AGA	2	6	409502	409507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017944	GGA	2	6	410407	410412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017944	GTTA	2	8	411190	411197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017944	CGA	2	6	411231	411236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_017944	AATTC	2	10	411242	411251	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1595	NC_017944	ACG	2	6	411368	411373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_017944	TGT	2	6	413124	413129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017944	TTC	2	6	413141	413146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_017944	GA	3	6	413179	413184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017944	GA	3	6	413197	413202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017944	CGC	2	6	413203	413208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_017944	GCC	2	6	413222	413227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_017944	GTC	2	6	413233	413238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017944	CGTCA	2	10	413248	413257	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1604	NC_017944	TCG	2	6	413260	413265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_017944	GGC	2	6	413273	413278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_017944	TGAA	2	8	417040	417047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017944	TAAA	2	8	418305	418312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017944	TAC	2	6	418325	418330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_017944	TGG	2	6	418373	418378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017944	TA	3	6	418409	418414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017944	CGA	2	6	419434	419439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_017944	TGT	2	6	419456	419461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017944	GTG	3	9	419462	419470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017944	TAC	2	6	419499	419504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017944	AT	3	6	419609	419614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017944	ACGA	2	8	420329	420336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_017944	CG	3	6	420337	420342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_017944	CTT	2	6	420364	420369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_017944	CGTC	2	8	420376	420383	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_017944	GA	3	6	420432	420437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017944	GAT	2	6	420499	420504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017944	CAT	2	6	421301	421306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_017944	T	6	6	421306	421311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017944	AAC	2	6	421333	421338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_017944	CT	3	6	421369	421374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_017944	A	6	6	421407	421412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017944	TC	3	6	421428	421433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_017944	TAT	2	6	421482	421487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017944	ATT	2	6	422032	422037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017944	TGG	2	6	422689	422694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017944	ACG	2	6	422705	422710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_017944	GTCA	2	8	422713	422720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_017944	ACTC	2	8	422726	422733	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_017944	TG	3	6	422744	422749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_017944	TAAC	2	8	423389	423396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1906	NC_017944	CGT	2	6	493717	493722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1907	NC_017944	ACG	2	6	493731	493736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1908	NC_017944	ACA	2	6	494642	494647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1909	NC_017944	AT	3	6	494670	494675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1910	NC_017944	CAC	2	6	494822	494827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1911	NC_017944	AGT	3	9	498337	498345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1912	NC_017944	AATT	2	8	498887	498894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1913	NC_017944	TGT	2	6	498979	498984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1914	NC_017944	TAAGG	2	10	499030	499039	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_017944	CGA	2	6	499040	499045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1917	NC_017944	GGAG	2	8	499165	499172	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1918	NC_017944	CAA	2	6	499186	499191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1919	NC_017944	CAG	2	6	499670	499675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1920	NC_017944	TAG	2	6	499760	499765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1921	NC_017944	ACC	2	6	502309	502314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1922	NC_017944	GCT	2	6	502700	502705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1923	NC_017944	AG	3	6	502725	502730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1924	NC_017944	TC	3	6	502774	502779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1925	NC_017944	TAG	2	6	503434	503439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1927	NC_017944	ACA	2	6	503565	503570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1928	NC_017944	GGAG	2	8	503596	503603	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1929	NC_017944	AAT	2	6	504409	504414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1930	NC_017944	CGA	2	6	504449	504454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1931	NC_017944	CAAT	2	8	504472	504479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1932	NC_017944	CT	3	6	504553	504558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1933	NC_017944	CCACTC	2	12	504611	504622	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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