MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 1933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017944	AGT	2	6	253330	253335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017944	CTG	2	6	253357	253362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017944	GACAG	2	10	253367	253376	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1004	NC_017944	GCTC	2	8	253399	253406	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_017944	ACC	2	6	253542	253547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_017944	GAC	2	6	253555	253560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017944	ATA	2	6	254284	254289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017944	TCGAC	2	10	254310	254319	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1009	NC_017944	GGA	2	6	258475	258480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017944	GGA	2	6	258495	258500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017944	ACG	2	6	259606	259611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017944	AG	3	6	260726	260731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017944	TCT	2	6	262126	262131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017944	GAC	2	6	262134	262139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017944	AC	4	8	262227	262234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_017944	TCCG	2	8	262279	262286	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_017944	GTT	2	6	263381	263386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017944	C	6	6	263404	263409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1019	NC_017944	TGG	2	6	263412	263417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017944	CA	3	6	263468	263473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_017944	AC	4	8	263477	263484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_017944	AG	3	6	264538	264543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017944	AG	3	6	264547	264552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017944	GGA	2	6	264601	264606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017944	GGAC	2	8	264647	264654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_017944	AGCG	2	8	264658	264665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_017944	GTC	2	6	265008	265013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017944	CGG	2	6	265116	265121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017944	GAC	2	6	265152	265157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017944	CATT	2	8	265250	265257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_017944	T	6	6	265322	265327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017944	GA	3	6	265328	265333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017944	TGA	2	6	265341	265346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017944	TGA	2	6	265356	265361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017944	ATCG	2	8	265413	265420	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_017944	AGC	2	6	265441	265446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_017944	AC	3	6	265490	265495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_017944	CCG	2	6	266487	266492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_017944	A	6	6	266514	266519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017944	GGC	2	6	267006	267011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017944	AGA	2	6	267088	267093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017944	GTA	2	6	267125	267130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017944	AGT	2	6	267756	267761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017944	TAC	2	6	267771	267776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_017944	GAA	2	6	267848	267853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017944	AC	3	6	267857	267862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_017944	AG	3	6	267877	267882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017944	GAC	2	6	268241	268246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017944	TCAT	2	8	268306	268313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_017944	GT	3	6	270149	270154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017944	GTG	2	6	270220	270225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017944	ACA	3	9	270239	270247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_017944	GTA	2	6	270443	270448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017944	CAC	2	6	270456	270461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_017944	TTG	2	6	270511	270516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017944	GTCA	2	8	270522	270529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_017944	CGA	2	6	270672	270677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_017944	CGAC	2	8	271127	271134	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_017944	AACC	2	8	271697	271704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_017944	T	6	6	271742	271747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017944	AACC	2	8	271761	271768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_017944	GGGT	2	8	271838	271845	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017944	ACC	2	6	273132	273137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_017944	CTGTT	2	10	273154	273163	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1065	NC_017944	TA	3	6	273168	273173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017944	AC	3	6	273185	273190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_017944	AGTA	2	8	273233	273240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017944	CTAAT	2	10	273305	273314	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1069	NC_017944	AACT	2	8	273330	273337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_017944	AAC	2	6	273359	273364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017944	A	6	6	273371	273376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017944	TCG	2	6	273385	273390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017944	GTG	2	6	273426	273431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017944	TGG	2	6	273560	273565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017944	CAA	2	6	273575	273580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_017944	ACT	2	6	273679	273684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_017944	GTG	2	6	273717	273722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017944	TGG	2	6	273724	273729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017944	CAG	2	6	273738	273743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_017944	TTG	2	6	273769	273774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017944	A	6	6	274636	274641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017944	TC	3	6	274653	274658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_017944	AG	3	6	274673	274678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017944	CCTA	2	8	274699	274706	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_017944	GA	3	6	274810	274815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017944	CGC	2	6	275205	275210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_017944	GATG	2	8	275514	275521	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017944	TAG	2	6	275572	275577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017944	CTA	2	6	275646	275651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_017944	CTG	2	6	275673	275678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_017944	TAAC	2	8	275700	275707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_017944	ATCG	2	8	275771	275778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_017944	TTCT	2	8	276738	276745	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_017944	GTC	2	6	276818	276823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_017944	TAAG	2	8	276844	276851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017944	CGT	2	6	276884	276889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_017944	CTT	2	6	276919	276924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_017944	GGA	2	6	276949	276954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017944	TAG	2	6	277045	277050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017944	CTCG	2	8	277071	277078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_017944	CTA	2	6	277119	277124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017944	TGAA	2	8	277183	277190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017944	AAT	2	6	277248	277253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017944	TCG	2	6	277255	277260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017944	GTG	2	6	277311	277316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017944	TG	3	6	277343	277348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017944	TC	3	6	277698	277703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_017944	GTT	2	6	277783	277788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017944	ACTT	2	8	277789	277796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_017944	AG	3	6	277797	277802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017944	CGAG	2	8	277819	277826	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_017944	CGC	2	6	279448	279453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_017944	TGC	2	6	279545	279550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017944	A	6	6	280030	280035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017944	GA	3	6	280115	280120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017944	TGA	2	6	280147	280152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017944	CGGT	2	8	280232	280239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_017944	GT	3	6	280243	280248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017944	CTA	2	6	280264	280269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017944	ATTCG	2	10	280272	280281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1121	NC_017944	GGT	2	6	280292	280297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017944	GTC	2	6	280373	280378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017944	CGG	2	6	280394	280399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017944	GCC	2	6	285646	285651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_017944	TCC	2	6	285677	285682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_017944	CGC	2	6	288895	288900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_017944	GTTCT	2	10	288920	288929	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1128	NC_017944	CGG	2	6	288933	288938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_017944	TC	3	6	289001	289006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_017944	GTC	2	6	289041	289046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017944	TGAA	2	8	289119	289126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017944	CGAC	2	8	289801	289808	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_017944	GGT	2	6	289880	289885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017944	CCA	2	6	289907	289912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_017944	TTG	2	6	289919	289924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017944	CGCT	2	8	289974	289981	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_017944	AGGC	2	8	290073	290080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1270	NC_017944	G	6	6	323494	323499	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_017944	AGGA	2	8	323500	323507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1405	NC_017944	TGA	2	6	359042	359047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_017944	CCG	3	9	359119	359127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1409	NC_017944	CGGT	2	8	359163	359170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1410	NC_017944	GTC	2	6	359187	359192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_017944	GCG	2	6	359217	359222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_017944	TTC	2	6	359268	359273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_017944	AATC	2	8	359389	359396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1414	NC_017944	ACT	2	6	359402	359407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_017944	GGCG	2	8	359416	359423	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1416	NC_017944	ACTG	2	8	359569	359576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1422	NC_017944	CTGA	2	8	359888	359895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1423	NC_017944	TGA	2	6	359902	359907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_017944	CGC	2	6	359920	359925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1425	NC_017944	ATC	2	6	359940	359945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1430	NC_017944	CGT	2	6	360566	360571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1432	NC_017944	TCG	2	6	360629	360634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1433	NC_017944	TGG	2	6	360678	360683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_017944	GGA	2	6	360749	360754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_017944	GTCTG	2	10	360761	360770	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1436	NC_017944	TCT	2	6	360787	360792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1438	NC_017944	TG	3	6	362514	362519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_017944	CCT	2	6	362531	362536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1441	NC_017944	ATG	2	6	362609	362614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_017944	GTC	2	6	363989	363994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_017944	ACC	2	6	364029	364034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1444	NC_017944	GTAC	2	8	364049	364056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1445	NC_017944	TCG	4	12	364059	364070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1446	NC_017944	GAC	2	6	364107	364112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_017944	TCGGCG	2	12	365713	365724	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1452	NC_017944	CAC	2	6	365797	365802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1453	NC_017944	TCAC	2	8	365832	365839	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1454	NC_017944	GTG	2	6	365861	365866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_017944	TGCG	2	8	367533	367540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1461	NC_017944	TGTGT	2	10	368467	368476	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1462	NC_017944	TG	3	6	368482	368487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1482	NC_017944	TAC	2	6	373802	373807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1489	NC_017944	TA	3	6	374906	374911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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