MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 295

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017941	C	6	6	7126	7131	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_017941	A	6	6	23554	23559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017941	T	6	6	26149	26154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017941	T	6	6	26902	26907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017941	A	6	6	26983	26988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017941	A	6	6	49874	49879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017941	T	6	6	53147	53152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017941	C	6	6	59286	59291	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_017941	A	6	6	59359	59364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017941	A	6	6	86953	86958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017941	C	6	6	87726	87731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_017941	A	8	8	99364	99371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017941	T	6	6	115917	115922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017941	C	6	6	119212	119217	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_017941	A	6	6	142085	142090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017941	A	6	6	147973	147978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017941	A	6	6	168145	168150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017941	T	6	6	188031	188036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017941	T	6	6	204077	204082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017941	A	6	6	206667	206672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017941	G	6	6	226078	226083	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017941	G	6	6	229513	229518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017941	T	6	6	234016	234021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017941	G	6	6	236875	236880	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017941	A	6	6	263580	263585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017941	A	6	6	270153	270158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017941	C	7	7	293578	293584	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_017941	G	6	6	296395	296400	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017941	T	6	6	297373	297378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017941	C	7	7	299112	299118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_017941	T	6	6	323790	323795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017941	C	6	6	330349	330354	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_017941	T	6	6	351463	351468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017941	A	6	6	351508	351513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017941	G	6	6	375040	375045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017941	A	6	6	381008	381013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017941	T	6	6	385448	385453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017941	G	6	6	386294	386299	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017941	G	6	6	396530	396535	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017941	A	6	6	403517	403522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017941	G	6	6	424585	424590	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017941	A	6	6	426835	426840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017941	C	6	6	433200	433205	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_017941	T	6	6	435937	435942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017941	T	6	6	450480	450485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017941	C	7	7	462649	462655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_017941	A	6	6	466893	466898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017941	T	6	6	547379	547384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017941	T	6	6	550328	550333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017941	C	6	6	553095	553100	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_017941	A	6	6	555115	555120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017941	C	6	6	576267	576272	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_017941	C	6	6	576325	576330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_017941	G	6	6	588044	588049	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017941	C	6	6	650859	650864	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_017941	A	6	6	680129	680134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017941	C	6	6	690274	690279	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_017941	A	6	6	710035	710040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017941	T	7	7	731805	731811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017941	A	6	6	733690	733695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017941	A	6	6	752671	752676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017941	G	6	6	765506	765511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017941	A	7	7	771500	771506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017941	A	7	7	778680	778686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017941	G	6	6	778961	778966	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017941	A	6	6	801691	801696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017941	A	6	6	814749	814754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017941	T	6	6	828582	828587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017941	T	6	6	836849	836854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017941	G	9	9	849266	849274	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017941	C	6	6	849308	849313	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_017941	G	6	6	849506	849511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017941	T	6	6	863284	863289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017941	C	6	6	864982	864987	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_017941	T	6	6	865190	865195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017941	C	6	6	874177	874182	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_017941	G	6	6	874183	874188	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017941	G	6	6	874196	874201	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017941	C	6	6	874202	874207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_017941	T	6	6	879503	879508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017941	T	6	6	879512	879517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017941	T	7	7	879584	879590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017941	T	6	6	879757	879762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017941	G	6	6	881969	881974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017941	C	6	6	897891	897896	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_017941	T	6	6	900604	900609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017941	T	6	6	932070	932075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017941	A	6	6	942667	942672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017941	G	6	6	974960	974965	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017941	G	6	6	980634	980639	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017941	G	6	6	982309	982314	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017941	A	6	6	995372	995377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017941	G	6	6	1001978	1001983	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017941	T	6	6	1002153	1002158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017941	G	6	6	1014743	1014748	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017941	G	6	6	1025104	1025109	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017941	T	6	6	1059610	1059615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017941	G	6	6	1097503	1097508	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017941	A	7	7	1105140	1105146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017941	A	8	8	1107067	1107074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017941	C	6	6	1117476	1117481	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_017941	T	6	6	1118039	1118044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017941	A	6	6	1118888	1118893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017941	A	6	6	1120567	1120572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017941	T	6	6	1128873	1128878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017941	C	6	6	1135324	1135329	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_017941	A	6	6	1135501	1135506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017941	G	6	6	1171893	1171898	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017941	G	6	6	1193890	1193895	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017941	A	6	6	1194836	1194841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017941	C	6	6	1208251	1208256	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_017941	C	6	6	1225796	1225801	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_017941	G	8	8	1229367	1229374	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017941	A	6	6	1245672	1245677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017941	C	6	6	1259007	1259012	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_017941	G	6	6	1259013	1259018	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017941	G	6	6	1259021	1259026	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017941	C	6	6	1259798	1259803	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_017941	A	6	6	1261291	1261296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017941	T	6	6	1265417	1265422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017941	A	6	6	1291168	1291173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017941	G	6	6	1295408	1295413	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017941	G	6	6	1298571	1298576	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017941	G	6	6	1300808	1300813	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017941	C	6	6	1312544	1312549	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_017941	A	6	6	1325145	1325150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017941	A	7	7	1340757	1340763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017941	G	7	7	1353393	1353399	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017941	G	6	6	1364731	1364736	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017941	C	6	6	1375655	1375660	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_017941	C	7	7	1385804	1385810	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
132	NC_017941	A	6	6	1388322	1388327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017941	G	7	7	1392311	1392317	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017941	T	6	6	1411527	1411532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017941	G	6	6	1415128	1415133	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017941	C	6	6	1451726	1451731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_017941	C	6	6	1464522	1464527	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
138	NC_017941	G	6	6	1469771	1469776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017941	T	6	6	1493401	1493406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017941	T	6	6	1504888	1504893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017941	T	6	6	1512882	1512887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017941	T	6	6	1514962	1514967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017941	T	6	6	1525064	1525069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017941	G	6	6	1533849	1533854	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017941	A	6	6	1539024	1539029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017941	G	6	6	1539060	1539065	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017941	G	6	6	1543388	1543393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017941	G	8	8	1545144	1545151	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017941	A	6	6	1570737	1570742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017941	A	6	6	1571169	1571174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017941	G	6	6	1586299	1586304	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.