MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori XZ274 chromosome

Total Repeats: 328

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017926	TTTGT	2	10	2519	2528	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017926	TTTTA	2	10	5009	5018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017926	AAGAA	2	10	7718	7727	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017926	GCTTT	2	10	13703	13712	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017926	AAAAG	2	10	23228	23237	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017926	ATTTG	2	10	29750	29759	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017926	AAATT	2	10	30257	30266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017926	ATTTA	2	10	46254	46263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017926	TGAAA	2	10	46431	46440	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017926	AACCC	2	10	55342	55351	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_017926	AATTG	2	10	55370	55379	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017926	TGCTT	2	10	72200	72209	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017926	GATAA	2	10	72447	72456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017926	TTAAA	2	10	79698	79707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017926	ACAAA	2	10	79727	79736	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017926	TATCC	2	10	81858	81867	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017926	TCATA	2	10	82414	82423	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017926	ATTGG	2	10	84447	84456	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017926	CAATA	2	10	84668	84677	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017926	GGTGG	2	10	87571	87580	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017926	TATCT	2	10	91290	91299	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017926	CAAAA	2	10	92427	92436	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017926	TTTTA	2	10	95388	95397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017926	TTACA	2	10	97272	97281	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017926	CAAGC	2	10	100305	100314	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017926	ATAAA	2	10	111600	111609	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017926	TAAGA	2	10	111642	111651	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017926	TAAAA	2	10	111713	111722	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017926	TTAAG	2	10	116681	116690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017926	AAAAG	2	10	118632	118641	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017926	GATTG	2	10	128281	128290	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017926	GAGCT	2	10	132366	132375	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017926	CGATC	2	10	132385	132394	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017926	ATTAA	2	10	137515	137524	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017926	TTTTG	2	10	146391	146400	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017926	ATCTA	2	10	162197	162206	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017926	TGGTT	2	10	163890	163899	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017926	CTTTT	2	10	164159	164168	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017926	ATTTT	2	10	165524	165533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017926	CAAAT	2	10	187913	187922	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017926	CAAAA	2	10	195164	195173	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017926	TTTAA	2	10	211979	211988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017926	TTCAA	2	10	225105	225114	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017926	AATGA	2	10	227764	227773	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017926	TTTTC	2	10	227837	227846	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017926	TTGAT	2	10	233739	233748	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017926	AAACA	2	10	236349	236358	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017926	AAACC	2	10	255074	255083	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017926	GTTTA	2	10	259309	259318	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017926	CTTAA	2	10	261549	261558	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017926	TCCAA	2	10	267907	267916	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017926	TAAAA	2	10	268826	268835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017926	CAAAA	2	10	270330	270339	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017926	AAATT	2	10	279681	279690	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017926	TCTTT	2	10	286983	286992	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017926	AGTTC	2	10	287066	287075	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017926	CAATC	2	10	288766	288775	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017926	CTCTT	2	10	293530	293539	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017926	CTTTT	2	10	298187	298196	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017926	GTTTT	2	10	311263	311272	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017926	TTAAT	2	10	320405	320414	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017926	TAAAA	2	10	332471	332480	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017926	ACGGG	2	10	333178	333187	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017926	AACAT	2	10	333501	333510	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017926	CAAAA	2	10	342806	342815	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017926	TTATA	2	10	352608	352617	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017926	AAGTT	2	10	359508	359517	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017926	AATTA	2	10	365336	365345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017926	TTATA	2	10	367979	367988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017926	GATTT	2	10	382373	382382	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017926	AAAAC	2	10	385273	385282	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017926	TGTTT	2	10	387388	387397	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017926	AATAA	2	10	388174	388183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017926	AACGC	2	10	388228	388237	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017926	TCAAA	2	10	389183	389192	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017926	AACTC	2	10	389846	389855	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017926	TCACA	2	10	393215	393224	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017926	CTTGT	2	10	393294	393303	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017926	CTTGT	2	10	406201	406210	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017926	TTTGA	2	10	406315	406324	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017926	CCACA	2	10	406948	406957	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_017926	TTGGT	2	10	407872	407881	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017926	GCATC	2	10	431482	431491	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017926	TTGAT	2	10	433047	433056	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017926	AAAGG	2	10	446803	446812	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017926	AGCCA	2	10	458166	458175	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017926	ATAAA	2	10	458546	458555	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017926	AAAAT	2	10	458579	458588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017926	GTTTT	2	10	466642	466651	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017926	TAGGA	2	10	467049	467058	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017926	TCTTT	2	10	470623	470632	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017926	AATAA	2	10	471473	471482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017926	AAAGC	2	10	471737	471746	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017926	TGATT	2	10	472260	472269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017926	TAACA	2	10	479352	479361	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017926	AATAA	2	10	480741	480750	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017926	AAAAT	2	10	485452	485461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017926	GAATG	2	10	492392	492401	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017926	TCTCA	2	10	495206	495215	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017926	TTACC	2	10	495928	495937	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017926	AAAAT	2	10	506494	506503	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017926	TTAAA	2	10	511208	511217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017926	TGTTT	2	10	512575	512584	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017926	GGAAT	2	10	512749	512758	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017926	GGAAA	2	10	529665	529674	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017926	TAAAA	2	10	534159	534168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017926	GCTTT	2	10	539320	539329	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017926	TTTAA	2	10	542568	542577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017926	AAATA	2	10	542843	542852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017926	TTAAT	2	10	550324	550333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017926	TTAAA	2	10	558807	558816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017926	CATGA	2	10	570146	570155	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017926	AAAGC	2	10	571343	571352	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017926	AACAA	2	10	586906	586915	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017926	ATAAA	2	10	592784	592793	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017926	TGAGA	2	10	592819	592828	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017926	TCGTA	2	10	595824	595833	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017926	TAAAA	2	10	602021	602030	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017926	TTATT	2	10	608869	608878	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017926	TATTG	2	10	612766	612775	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017926	CTAAA	2	10	613138	613147	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017926	TGTAG	2	10	630712	630721	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017926	TTAAA	2	10	630777	630786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017926	TAAAC	2	10	638653	638662	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017926	TTGTT	2	10	638819	638828	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017926	CATAG	2	10	639942	639951	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017926	TTGCT	2	10	641383	641392	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017926	TTTTC	2	10	641850	641859	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017926	CAATT	2	10	645558	645567	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017926	TAAAA	2	10	645663	645672	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017926	ATTTT	2	10	646699	646708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017926	TACAT	2	10	652774	652783	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017926	GATGC	2	10	657426	657435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017926	AAAGA	2	10	659863	659872	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017926	AAAGA	2	10	672854	672863	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017926	CTTTT	2	10	674908	674917	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017926	ATCCT	2	10	679602	679611	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017926	GTTTG	2	10	690476	690485	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017926	GGGTG	2	10	690585	690594	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017926	AAATC	2	10	691024	691033	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017926	TACTA	2	10	694512	694521	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017926	TAAAT	2	10	696367	696376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017926	TTGAT	2	10	704589	704598	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017926	TTTGC	2	10	712155	712164	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017926	TTTAT	2	10	717287	717296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017926	TAGAA	2	10	717341	717350	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017926	ATTAA	2	10	717444	717453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017926	AAAGC	2	10	724485	724494	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017926	GTTTT	2	10	727856	727865	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017926	TTAAT	2	10	733649	733658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017926	GATTT	2	10	749805	749814	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017926	GCTTT	2	10	750224	750233	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_017926	ATCTT	2	10	759478	759487	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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166	NC_017926	ATTTT	2	10	835006	835015	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_017926	AAGCA	2	10	1339637	1339646	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.