MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori XZ274 chromosome

Total Repeats: 8126

< Previous12...567891011121314151617Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017926	TAT	2	6	1614094	1614099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_017926	T	7	7	1614124	1614130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017926	TC	3	6	1614133	1614138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8004	NC_017926	A	7	7	1614159	1614165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017926	TG	3	6	1614948	1614953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017926	AC	3	6	1618330	1618335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8007	NC_017926	TAA	2	6	1621481	1621486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017926	AAT	2	6	1621534	1621539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017926	TTTA	2	8	1622344	1622351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017926	GCC	2	6	1623041	1623046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8011	NC_017926	GTGGG	2	10	1623096	1623105	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017926	GAA	2	6	1623218	1623223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_017926	GTG	2	6	1623236	1623241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_017926	GTT	2	6	1624374	1624379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017926	TTG	2	6	1624404	1624409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017926	A	6	6	1624416	1624421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017926	AAAC	2	8	1624433	1624440	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8018	NC_017926	ATT	2	6	1624506	1624511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017926	ATG	2	6	1624698	1624703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017926	AG	3	6	1624709	1624714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017926	AAT	2	6	1624731	1624736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017926	ATCACC	2	12	1624737	1624748	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
8023	NC_017926	T	6	6	1624855	1624860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017926	GGT	2	6	1624865	1624870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_017926	ATT	2	6	1624875	1624880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_017926	TCA	2	6	1624961	1624966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_017926	CGCT	2	8	1626179	1626186	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8028	NC_017926	TAATGA	2	12	1626256	1626267	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017926	A	6	6	1626287	1626292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017926	TAAAA	2	10	1626302	1626311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017926	GTT	2	6	1626370	1626375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_017926	TGCAAA	2	12	1626399	1626410	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8033	NC_017926	TGG	2	6	1626421	1626426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_017926	A	6	6	1626503	1626508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_017926	T	7	7	1626517	1626523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_017926	A	6	6	1626568	1626573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_017926	C	7	7	1626578	1626584	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8038	NC_017926	A	7	7	1626592	1626598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017926	AACA	2	8	1626649	1626656	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8040	NC_017926	TA	3	6	1626675	1626680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_017926	ATGA	2	8	1626681	1626688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_017926	AAT	2	6	1626738	1626743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_017926	A	6	6	1626787	1626792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017926	CAC	2	6	1626834	1626839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_017926	TGA	2	6	1626849	1626854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017926	GAT	2	6	1626855	1626860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_017926	TCT	2	6	1626922	1626927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_017926	A	6	6	1626928	1626933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017926	AAC	2	6	1626949	1626954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_017926	A	7	7	1626961	1626967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_017926	A	6	6	1626969	1626974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_017926	AGAA	2	8	1627023	1627030	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017926	C	6	6	1627041	1627046	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8054	NC_017926	ATG	2	6	1627065	1627070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_017926	TTA	2	6	1627084	1627089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017926	T	6	6	1627113	1627118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017926	TTTTG	2	10	1627204	1627213	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017926	TAT	2	6	1627216	1627221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017926	TGA	2	6	1627236	1627241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017926	ATT	2	6	1627293	1627298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_017926	ATAAA	2	10	1627299	1627308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_017926	CAA	2	6	1629049	1629054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_017926	ACC	2	6	1629075	1629080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_017926	AAGTTT	2	12	1630132	1630143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_017926	T	6	6	1630141	1630146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017926	TTC	2	6	1630153	1630158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_017926	TG	3	6	1630219	1630224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017926	TGA	2	6	1630254	1630259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_017926	GTG	2	6	1630301	1630306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_017926	GAA	3	9	1630333	1630341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017926	GAA	2	6	1630387	1630392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_017926	ATTT	2	8	1630414	1630421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_017926	A	6	6	1630450	1630455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_017926	A	7	7	1630479	1630485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_017926	A	6	6	1630498	1630503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_017926	TAA	2	6	1630526	1630531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_017926	TAA	2	6	1630550	1630555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_017926	T	6	6	1630560	1630565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_017926	GGT	2	6	1630593	1630598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_017926	TTAAA	2	10	1630630	1630639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_017926	TTTA	2	8	1630683	1630690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_017926	GAA	2	6	1630710	1630715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_017926	AAT	2	6	1630818	1630823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_017926	A	6	6	1630839	1630844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_017926	AAC	2	6	1630856	1630861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_017926	TTA	2	6	1630909	1630914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_017926	GTT	2	6	1631735	1631740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_017926	T	6	6	1631776	1631781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017926	GTT	2	6	1631797	1631802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_017926	GTT	2	6	1631809	1631814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_017926	TGGT	2	8	1631818	1631825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_017926	A	7	7	1631837	1631843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_017926	A	6	6	1631853	1631858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_017926	ATGAAG	2	12	1631879	1631890	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_017926	TAT	2	6	1631907	1631912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_017926	TTTA	2	8	1631926	1631933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_017926	GGC	2	6	1631956	1631961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_017926	CCAA	2	8	1632037	1632044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8099	NC_017926	GCCA	2	8	1632049	1632056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_017926	T	7	7	1632069	1632075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_017926	T	8	8	1632120	1632127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_017926	C	8	8	1632173	1632180	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8103	NC_017926	TTGT	2	8	1632216	1632223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_017926	TTA	2	6	1632238	1632243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_017926	T	6	6	1632285	1632290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_017926	AGCA	2	8	1632324	1632331	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8107	NC_017926	TCAA	2	8	1632340	1632347	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8108	NC_017926	AGA	2	6	1632357	1632362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017926	CA	3	6	1632391	1632396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8110	NC_017926	TTC	2	6	1632474	1632479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_017926	AT	3	6	1632516	1632521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_017926	TTG	2	6	1632530	1632535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017926	TTC	2	6	1632546	1632551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_017926	ATTC	2	8	1632552	1632559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8115	NC_017926	TCA	2	6	1632574	1632579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_017926	CAAA	2	8	1632593	1632600	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8117	NC_017926	T	6	6	1632738	1632743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_017926	AC	3	6	1632775	1632780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8119	NC_017926	TAA	2	6	1632817	1632822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_017926	GAT	2	6	1632850	1632855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_017926	AGAT	2	8	1632895	1632902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_017926	T	6	6	1632929	1632934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017926	CCT	2	6	1632980	1632985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8124	NC_017926	A	8	8	1633216	1633223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_017926	ATT	2	6	1633988	1633993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_017926	TTA	2	6	1634014	1634019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...567891011121314151617Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.