MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter cinaedi PAGU611

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017761	AAAATA	2	12	21533	21544	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017761	GCAATG	2	12	22098	22109	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017761	TGAAAG	2	12	25384	25395	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017761	TCAGAT	2	12	27481	27492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017761	AAGATT	2	12	62844	62855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017761	TTTTGC	2	12	83331	83342	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017761	GAATCT	2	12	94398	94409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017761	CTTTTA	2	12	114964	114975	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017761	TGGCGT	2	12	153559	153570	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017761	GTTTAA	2	12	160637	160648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017761	CTTAAA	2	12	185574	185585	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017761	GCAATG	2	12	221519	221530	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017761	ATTCTT	2	12	246207	246218	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017761	CTTTTT	2	12	250644	250655	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017761	TAAAAT	2	12	250668	250679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017761	GCCCAA	2	12	262303	262314	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017761	TATTTT	2	12	266392	266403	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017761	TTATAA	2	12	290817	290828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017761	GTTTAT	2	12	311938	311949	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017761	CCTTAT	2	12	403203	403214	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017761	TATAAG	2	12	425825	425836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017761	TAAACT	2	12	445344	445355	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017761	TATCTT	2	12	468341	468352	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017761	ATGCAA	2	12	509922	509933	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017761	GTTTAA	2	12	544495	544506	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017761	AGGATA	2	12	596556	596567	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017761	GCCAAA	2	12	619308	619319	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017761	AAATAA	2	12	656104	656115	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017761	ATTTAT	2	12	733224	733235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017761	TGTGCT	2	12	737677	737688	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017761	AAGAGA	2	12	763868	763879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017761	GTTTTT	2	12	785363	785374	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017761	CGCTCA	2	12	786082	786093	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017761	GATTTT	2	12	794121	794132	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017761	GAAAAA	2	12	852256	852267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017761	AATCTG	2	12	902602	902613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017761	ATCTTT	2	12	966723	966734	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017761	CTAAAA	2	12	989657	989668	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017761	TAATGC	2	12	1014064	1014075	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017761	GAAATT	2	12	1039731	1039742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017761	TATAAG	2	12	1039850	1039861	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017761	CTAAGA	2	12	1061102	1061113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017761	TATTAA	2	12	1098907	1098918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017761	ATGCTT	2	12	1195258	1195269	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017761	TTAAAT	2	12	1202934	1202945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017761	TAGAGA	2	12	1207972	1207983	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017761	TAAAAT	2	12	1295596	1295607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017761	TTAATA	2	12	1330559	1330570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017761	TTTGTT	2	12	1345690	1345701	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017761	TTTTTG	2	12	1346045	1346056	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017761	TAAGTA	2	12	1367612	1367623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017761	TAAATT	2	12	1387971	1387982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017761	TTGTCT	2	12	1404428	1404439	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017761	AAGAGT	2	12	1412394	1412405	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017761	TATGAA	2	12	1440492	1440503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017761	CAAAAA	2	12	1455989	1456000	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017761	TTTTAT	2	12	1480918	1480929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017761	TCCGTT	2	12	1586668	1586679	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017761	CAAAAG	2	12	1600747	1600758	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017761	CACAAA	2	12	1603547	1603558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017761	TAAAAA	2	12	1676493	1676504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017761	TAATTT	2	12	1693939	1693950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017761	TAATTT	2	12	1694050	1694061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017761	GTTTTA	2	12	1740331	1740342	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017761	AACTCT	2	12	1754818	1754829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017761	AGGGGG	2	12	1761503	1761514	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017761	TAAATT	2	12	1841799	1841810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017761	GCACCC	2	12	1868119	1868130	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017761	AAACTT	2	12	1871220	1871231	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017761	CACTCT	2	12	1921725	1921736	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017761	TTATTT	2	12	1922869	1922880	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017761	GCGTGG	2	12	1950084	1950095	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017761	ATTTTG	2	12	1957357	1957368	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017761	TATGTT	2	12	1984102	1984113	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017761	AAAACG	2	12	1987540	1987551	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017761	TAATCA	2	12	1991242	1991253	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017761	TTTGTG	2	12	2014462	2014473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.