MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter cinaedi PAGU611

Total Repeats: 3903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017761	GTTT	2	8	1333	1340	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017761	TTTAA	2	10	1363	1372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017761	GT	3	6	1378	1383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017761	ATT	2	6	1386	1391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017761	GTAGT	2	10	1410	1419	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017761	ATG	2	6	5682	5687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017761	T	6	6	8559	8564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017761	AAT	2	6	8567	8572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017761	T	6	6	8572	8577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017761	GTT	2	6	10049	10054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017761	GAG	2	6	10076	10081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017761	TG	3	6	10104	10109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017761	ATAA	2	8	10119	10126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017761	AAG	2	6	10180	10185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017761	TCT	2	6	10439	10444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017761	CA	3	6	10445	10450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017761	TTC	2	6	10456	10461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017761	GTG	2	6	21368	21373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017761	T	6	6	21475	21480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017761	GAT	2	6	21492	21497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017761	AAAATA	2	12	21533	21544	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017761	A	8	8	21577	21584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017761	TTAG	2	8	21595	21602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017761	T	8	8	21637	21644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017761	CAA	2	6	21703	21708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017761	A	6	6	21715	21720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017761	T	6	6	21747	21752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017761	A	15	15	21754	21768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017761	GCAATG	2	12	22098	22109	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017761	TC	4	8	22115	22122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017761	TTG	2	6	22126	22131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017761	CTT	2	6	22165	22170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017761	GTT	2	6	22176	22181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017761	TTGCT	2	10	22223	22232	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017761	T	7	7	23211	23217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017761	CTT	2	6	23397	23402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017761	GATT	2	8	24048	24055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017761	CA	3	6	24236	24241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017761	T	6	6	24248	24253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017761	T	6	6	24268	24273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017761	T	6	6	24475	24480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017761	CCA	2	6	24610	24615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017761	CGC	2	6	24666	24671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017761	TAA	2	6	24843	24848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017761	A	6	6	24911	24916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017761	A	6	6	24928	24933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017761	A	6	6	24976	24981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017761	TA	4	8	25000	25007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017761	GT	3	6	25015	25020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017761	ATAA	2	8	25053	25060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017761	ATT	2	6	25066	25071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017761	TAT	2	6	25076	25081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017761	ACT	2	6	25084	25089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017761	TAG	2	6	25169	25174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017761	T	6	6	25188	25193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017761	A	7	7	25195	25201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017761	TTCTC	2	10	25202	25211	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017761	AT	3	6	25220	25225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017761	AT	3	6	25250	25255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017761	T	6	6	25294	25299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017761	TGAAAG	2	12	25384	25395	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017761	GTG	2	6	25406	25411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017761	ACC	2	6	25429	25434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017761	A	7	7	25487	25493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017761	T	6	6	25577	25582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017761	TAG	2	6	25603	25608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017761	TTG	2	6	25621	25626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017761	T	6	6	25714	25719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017761	TA	3	6	25722	25727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017761	ATT	2	6	25762	25767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017761	AAG	2	6	26047	26052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017761	A	6	6	26574	26579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017761	GT	3	6	26585	26590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017761	CTC	2	6	26612	26617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017761	CGA	2	6	26621	26626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017761	GAA	2	6	26632	26637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017761	TCAGAT	2	12	27481	27492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017761	CA	3	6	27647	27652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017761	T	6	6	27662	27667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017761	TCT	2	6	27672	27677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017761	CT	3	6	27676	27681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017761	TAC	2	6	27795	27800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017761	AGCAT	2	10	33392	33401	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017761	TGT	2	6	33444	33449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017761	A	6	6	33508	33513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017761	TCAAA	2	10	33547	33556	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017761	ATTTG	2	10	36774	36783	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017761	TCAA	2	8	36825	36832	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017761	TA	3	6	38370	38375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017761	AC	3	6	38434	38439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017761	TACAA	2	10	38468	38477	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017761	GAT	2	6	39849	39854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017761	A	6	6	39932	39937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017761	TGA	2	6	39938	39943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017761	ATC	2	6	39960	39965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017761	TCC	2	6	39974	39979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017761	AAC	2	6	40004	40009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017761	CAA	2	6	40019	40024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017761	AAAAC	2	10	40027	40036	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017761	A	6	6	40358	40363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017761	AGAC	2	8	42613	42620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017761	TCC	2	6	43317	43322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017761	TTA	2	6	45544	45549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017761	ACAA	2	8	45555	45562	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017761	TTA	2	6	45566	45571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017761	A	6	6	45575	45580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017761	TG	3	6	45584	45589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017761	TAAA	2	8	45613	45620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017761	TAA	2	6	45667	45672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017761	A	6	6	45671	45676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017761	TGT	2	6	51250	51255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017761	GT	3	6	51254	51259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017761	TAT	2	6	51383	51388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017761	T	6	6	51404	51409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017761	TA	3	6	51416	51421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017761	CA	3	6	51450	51455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017761	GTTG	2	8	52742	52749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017761	TTA	2	6	52772	52777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017761	GAAT	2	8	54528	54535	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017761	GAAT	2	8	59526	59533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017761	ATTTG	2	10	59538	59547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017761	TAAAA	2	10	59574	59583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017761	T	6	6	59612	59617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017761	A	6	6	59620	59625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017761	A	7	7	59707	59713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017761	GTT	2	6	60009	60014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017761	CTTGT	2	10	62762	62771	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017761	TG	3	6	62788	62793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017761	TAT	2	6	62803	62808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017761	TCAC	2	8	62817	62824	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017761	AAGATT	2	12	62844	62855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017761	T	7	7	62861	62867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017761	TTGCT	2	10	62889	62898	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017761	AG	3	6	63006	63011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017761	T	6	6	64405	64410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017761	A	6	6	64422	64427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017761	TGAA	2	8	65523	65530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017761	AAAT	2	8	67459	67466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017761	GT	3	6	76397	76402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017761	T	6	6	77291	77296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017761	A	6	6	79564	79569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017761	T	6	6	79587	79592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017761	CTT	2	6	79594	79599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017761	ACA	2	6	82084	82089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017761	GT	3	6	82108	82113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017761	TTTA	2	8	83315	83322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017761	TTTTGC	2	12	83331	83342	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_017761	T	6	6	84420	84425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017761	CTTA	2	8	86267	86274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017761	TTG	2	6	89199	89204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017761	T	6	6	89782	89787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017761	GA	3	6	89806	89811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017761	TTGGA	2	10	93685	93694	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017761	GA	4	8	93719	93726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017761	GAATCT	2	12	94398	94409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_017761	GTTT	2	8	94458	94465	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017761	AAT	2	6	95015	95020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017761	ATG	2	6	96825	96830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017761	ATTT	2	8	96833	96840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017761	T	6	6	96911	96916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017761	AAT	2	6	99938	99943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017761	AAG	2	6	99952	99957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_017761	TA	3	6	100671	100676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017761	T	8	8	100715	100722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017761	AT	4	8	101461	101468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017761	TAT	3	9	101475	101483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_017761	TGCAA	2	10	102246	102255	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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174	NC_017761	A	7	7	102424	102430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017761	A	6	6	102433	102438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017761	ACA	2	6	106494	106499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_017761	TG	3	6	114958	114963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_017761	GGA	2	6	115071	115076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_017761	T	6	6	122123	122128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017761	TTA	2	6	122159	122164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017761	AAG	2	6	122197	122202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_017761	TG	3	6	126422	126427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
193	NC_017761	T	6	6	127981	127986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_017761	A	6	6	131830	131835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_017761	GGT	2	6	131889	131894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_017761	GGT	2	6	156750	156755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017761	CCA	2	6	156807	156812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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291	NC_017761	T	6	6	156853	156858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_017761	TAA	2	6	207567	207572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_017761	TGT	2	6	207592	207597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_017761	GTT	2	6	207696	207701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_017761	GGT	2	6	212103	212108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017761	TTTA	2	8	212154	212161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_017761	CAC	2	6	221723	221728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
472	NC_017761	ACC	2	6	221821	221826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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485	NC_017761	TTAT	2	8	222217	222224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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