MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi169 chromosome

Total Repeats: 316

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017740	CA	3	6	4904	4909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017740	CA	3	6	14502	14507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017740	AG	3	6	23276	23281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017740	TA	3	6	24885	24890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017740	AG	3	6	36595	36600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017740	GC	3	6	40239	40244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017740	AG	3	6	40383	40388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017740	CT	3	6	46865	46870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017740	CT	3	6	47480	47485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017740	GC	3	6	47508	47513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017740	AC	3	6	47590	47595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017740	CT	3	6	47797	47802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017740	GA	3	6	47877	47882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017740	TC	3	6	56543	56548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017740	AG	3	6	58274	58279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017740	TA	3	6	58486	58491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017740	GC	3	6	58547	58552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017740	AG	3	6	59122	59127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017740	GT	3	6	59200	59205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017740	AG	4	8	59607	59614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017740	CG	3	6	60494	60499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017740	AG	3	6	64071	64076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017740	TA	4	8	70403	70410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017740	TC	3	6	72230	72235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017740	AG	4	8	72303	72310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017740	AG	3	6	76777	76782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017740	AG	3	6	76804	76809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017740	TA	4	8	77799	77806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017740	TA	4	8	77809	77816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017740	AG	3	6	85126	85131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017740	AT	3	6	85172	85177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017740	TA	3	6	88446	88451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017740	GT	3	6	90537	90542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017740	TG	3	6	95420	95425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017740	CT	3	6	104152	104157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017740	TA	4	8	116697	116704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017740	AT	3	6	120687	120692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017740	AG	3	6	126272	126277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017740	TA	3	6	126311	126316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017740	CT	3	6	127282	127287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017740	GC	3	6	127583	127588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017740	GA	3	6	132599	132604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017740	AG	3	6	132641	132646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017740	TG	3	6	154669	154674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017740	TC	3	6	158077	158082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017740	AC	3	6	167492	167497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017740	AG	3	6	178205	178210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017740	AG	3	6	178356	178361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017740	AG	3	6	178407	178412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017740	GC	3	6	178416	178421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017740	TC	3	6	179434	179439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017740	GA	3	6	179537	179542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017740	TG	3	6	180777	180782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017740	CT	3	6	193540	193545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017740	CT	3	6	195813	195818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017740	AT	3	6	196492	196497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017740	AC	3	6	196648	196653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017740	GA	3	6	218522	218527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017740	AG	3	6	218534	218539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017740	TC	3	6	220756	220761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017740	TA	3	6	221163	221168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017740	TA	3	6	222973	222978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017740	CT	3	6	223953	223958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017740	CT	3	6	224796	224801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017740	TG	3	6	224922	224927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017740	CT	3	6	225980	225985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017740	AC	3	6	226184	226189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017740	CT	3	6	228239	228244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017740	CT	3	6	229113	229118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017740	TG	3	6	229119	229124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017740	CT	4	8	229468	229475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017740	CT	3	6	229611	229616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017740	AG	4	8	229796	229803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017740	TC	3	6	229868	229873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017740	TC	5	10	230016	230025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017740	CT	3	6	230090	230095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017740	AT	4	8	240125	240132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017740	TA	4	8	240145	240152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017740	TC	5	10	240155	240164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017740	AT	3	6	243423	243428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017740	TG	3	6	255401	255406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017740	CT	3	6	258249	258254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017740	GT	3	6	263127	263132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017740	AG	3	6	334650	334655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017740	AG	3	6	365182	365187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017740	AG	3	6	373915	373920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017740	CT	3	6	391567	391572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017740	AT	3	6	391668	391673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017740	AC	3	6	391692	391697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017740	TA	7	14	408807	408820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017740	AG	3	6	410565	410570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017740	AG	3	6	412021	412026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017740	AG	3	6	412195	412200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017740	GA	4	8	420601	420608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017740	GA	3	6	436867	436872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017740	GA	3	6	439008	439013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017740	TA	3	6	473371	473376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017740	GC	3	6	473463	473468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017740	AG	3	6	487491	487496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017740	AT	4	8	487971	487978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017740	AC	3	6	488877	488882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017740	AG	3	6	491275	491280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017740	GT	4	8	501770	501777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017740	TA	3	6	502871	502876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017740	TA	3	6	506342	506347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017740	GA	5	10	521954	521963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017740	CA	3	6	522022	522027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017740	CT	3	6	527932	527937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017740	CA	3	6	537624	537629	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017740	AG	4	8	553597	553604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017740	GA	3	6	555174	555179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017740	AG	3	6	555198	555203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017740	GT	3	6	556564	556569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017740	CT	3	6	557538	557543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017740	GT	3	6	557577	557582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017740	GA	3	6	558235	558240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017740	CT	4	8	568280	568287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017740	AC	4	8	569682	569689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017740	AC	4	8	569704	569711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017740	AG	3	6	573801	573806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017740	AT	3	6	573906	573911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017740	AC	3	6	580667	580672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017740	TA	3	6	584770	584775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017740	AC	3	6	586201	586206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017740	TA	3	6	590195	590200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017740	TC	3	6	614166	614171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017740	AT	3	6	615923	615928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017740	CA	3	6	633282	633287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017740	AT	3	6	644159	644164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017740	TC	3	6	644743	644748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017740	TA	3	6	702111	702116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017740	AG	3	6	703312	703317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017740	CT	3	6	706575	706580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017740	CT	3	6	706920	706925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017740	TA	3	6	726601	726606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017740	TA	3	6	726653	726658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017740	TA	3	6	727525	727530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017740	AT	11	22	735440	735461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017740	AG	3	6	752860	752865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017740	CT	3	6	756876	756881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017740	TA	3	6	756896	756901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017740	CA	3	6	763226	763231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017740	GA	3	6	778999	779004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017740	CT	3	6	786458	786463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017740	TC	3	6	806149	806154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017740	GT	3	6	820873	820878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017740	AT	3	6	821054	821059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017740	TC	3	6	825722	825727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017740	TC	3	6	834977	834982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017740	TG	3	6	839976	839981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017740	CT	3	6	851262	851267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017740	CA	3	6	851276	851281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017740	AT	3	6	862502	862507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017740	AT	3	6	862526	862531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.