MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi169 chromosome

Total Repeats: 4030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017740	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017740	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017740	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017740	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017740	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017740	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017740	ACT	2	6	1862	1867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017740	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017740	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017740	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017740	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017740	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017740	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017740	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017740	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017740	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017740	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017740	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017740	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017740	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017740	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017740	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017740	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017740	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017740	TGG	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017740	GTG	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017740	ACC	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017740	GGT	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017740	A	7	7	4575	4581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017740	T	8	8	4595	4602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017740	AAT	2	6	4616	4621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017740	GAAAC	2	10	4645	4654	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017740	TAAA	2	8	4685	4692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017740	A	6	6	4690	4695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017740	TGT	2	6	4745	4750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017740	CA	3	6	4904	4909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017740	G	6	6	4965	4970	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017740	TAC	2	6	4976	4981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017740	A	6	6	5041	5046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017740	A	7	7	5112	5118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017740	A	6	6	5213	5218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017740	TAAAA	2	10	5248	5257	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017740	ATAAA	2	10	5267	5276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017740	T	6	6	5278	5283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017740	TTA	2	6	5324	5329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017740	TGGA	2	8	5336	5343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017740	TAA	2	6	7088	7093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017740	ATAA	2	8	7476	7483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017740	TAA	2	6	7566	7571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017740	ATT	2	6	7585	7590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017740	TTA	2	6	7611	7616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017740	T	6	6	7662	7667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017740	ATTC	2	8	7679	7686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017740	ACA	2	6	7696	7701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017740	GAA	2	6	7714	7719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017740	GCTTT	2	10	11397	11406	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017740	T	6	6	11404	11409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017740	T	7	7	11466	11472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017740	ATA	2	6	11476	11481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017740	TTAA	2	8	11495	11502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017740	AGTT	2	8	14441	14448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017740	CA	3	6	14502	14507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017740	CTG	2	6	14523	14528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017740	A	6	6	14658	14663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017740	A	6	6	16097	16102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017740	AAACAC	2	12	16132	16143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017740	ATCA	2	8	20547	20554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017740	CTCC	2	8	20614	20621	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_017740	CTT	2	6	22961	22966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017740	GATT	2	8	22974	22981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017740	ATTA	2	8	23070	23077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017740	A	18	18	23096	23113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017740	GTT	2	6	23173	23178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017740	A	6	6	23196	23201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017740	G	8	8	23202	23209	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017740	TGT	2	6	23234	23239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017740	AG	3	6	23276	23281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017740	T	6	6	23296	23301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017740	GGC	2	6	23375	23380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017740	TTAA	2	8	23426	23433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017740	A	6	6	24788	24793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017740	T	6	6	24823	24828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017740	A	6	6	24866	24871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017740	TA	3	6	24885	24890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017740	T	6	6	26225	26230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017740	A	6	6	26257	26262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017740	TCA	2	6	27806	27811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017740	T	6	6	27854	27859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017740	GGTT	2	8	27941	27948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017740	TAA	2	6	36575	36580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017740	A	6	6	36585	36590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017740	AG	3	6	36595	36600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017740	ATT	2	6	40193	40198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017740	GC	3	6	40239	40244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017740	T	6	6	40260	40265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017740	ATC	2	6	40266	40271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017740	T	7	7	40280	40286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017740	TAGACT	2	12	40345	40356	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017740	AG	3	6	40383	40388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017740	TAA	2	6	46496	46501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017740	ATC	2	6	46512	46517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017740	TCAA	2	8	46576	46583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017740	T	7	7	46614	46620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017740	TCTTTG	2	12	46675	46686	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017740	GTA	2	6	46711	46716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017740	CTTT	2	8	46766	46773	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017740	TGA	2	6	46833	46838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017740	CT	3	6	46865	46870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017740	ATCC	2	8	46874	46881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017740	TTG	2	6	46924	46929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017740	TGT	2	6	46987	46992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017740	TAA	2	6	47012	47017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017740	CAT	2	6	47022	47027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017740	ATG	2	6	47050	47055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017740	TAAA	2	8	47110	47117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017740	GTTG	2	8	47136	47143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017740	TGAAAT	2	12	47175	47186	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017740	A	6	6	47210	47215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017740	AAT	2	6	47223	47228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017740	AAG	2	6	47258	47263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017740	A	6	6	47276	47281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017740	TGC	2	6	47298	47303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017740	A	6	6	47314	47319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017740	GAGCGG	2	12	47354	47365	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017740	A	7	7	47368	47374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017740	CT	3	6	47480	47485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017740	GC	3	6	47508	47513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017740	GCTTT	2	10	47543	47552	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017740	AC	3	6	47590	47595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017740	CAA	2	6	47632	47637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017740	CAA	2	6	47686	47691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017740	T	6	6	47702	47707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017740	CT	3	6	47797	47802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017740	A	6	6	47820	47825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017740	TGA	2	6	47836	47841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017740	GA	3	6	47877	47882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017740	T	6	6	48049	48054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017740	AAG	2	6	50253	50258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017740	TTGA	2	8	50264	50271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017740	GTT	2	6	50279	50284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017740	T	6	6	50408	50413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017740	TTTA	2	8	55713	55720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017740	GCGG	2	8	55751	55758	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017740	T	6	6	55784	55789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017740	TAAT	2	8	55813	55820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017740	TAA	3	9	55919	55927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017740	AGCTT	2	10	55956	55965	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017740	TTAAA	2	10	55982	55991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017740	A	6	6	56001	56006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017740	ACAAA	2	10	56011	56020	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017740	AGG	2	6	56249	56254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017740	G	7	7	56264	56270	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017740	TAA	2	6	154631	154636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_017740	A	6	6	160344	160349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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