MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi417 chromosome

Total Repeats: 310

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017739	CA	3	6	4905	4910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017739	CA	3	6	14491	14496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017739	AG	3	6	23260	23265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017739	TA	3	6	24865	24870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017739	AG	3	6	40386	40391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017739	CT	3	6	56320	56325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017739	AG	4	8	56755	56762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017739	GC	3	6	57201	57206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017739	AG	3	6	57752	57757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017739	GT	3	6	58044	58049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017739	AG	3	6	59153	59158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017739	AG	4	8	59384	59391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017739	AG	3	6	67451	67456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017739	TA	5	10	73788	73797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017739	GC	3	6	74803	74808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017739	GA	3	6	75337	75342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017739	CA	3	6	77993	77998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017739	AG	3	6	80219	80224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017739	GA	3	6	80281	80286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017739	TA	4	8	81244	81251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017739	TA	4	8	81254	81261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017739	AG	3	6	88586	88591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017739	AT	3	6	88632	88637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017739	TA	3	6	91931	91936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017739	GT	3	6	94020	94025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017739	TG	4	8	98900	98907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017739	CT	3	6	107626	107631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017739	CT	3	6	111222	111227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017739	TA	4	8	120373	120380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017739	AT	3	6	124327	124332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017739	AG	3	6	129890	129895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017739	TA	3	6	129929	129934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017739	CT	3	6	130896	130901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017739	GC	3	6	131202	131207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017739	CA	3	6	139602	139607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017739	TG	3	6	158279	158284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017739	TC	3	6	161698	161703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017739	AC	3	6	171119	171124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017739	AG	3	6	181818	181823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017739	AG	3	6	182016	182021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017739	AG	3	6	182067	182072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017739	TA	3	6	182555	182560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017739	CT	3	6	197184	197189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017739	CT	3	6	198841	198846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017739	CT	3	6	199468	199473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017739	AT	3	6	200147	200152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017739	AC	3	6	200303	200308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017739	AT	3	6	207691	207696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017739	TG	3	6	219689	219694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017739	GC	3	6	222567	222572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017739	GT	3	6	227411	227416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017739	AT	3	6	259626	259631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017739	AG	3	6	297048	297053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017739	TC	3	6	298020	298025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017739	GC	3	6	298070	298075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017739	GC	3	6	298897	298902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017739	AG	3	6	298971	298976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017739	AG	3	6	325817	325822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017739	CT	3	6	334520	334525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017739	AG	3	6	334551	334556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017739	CT	3	6	352194	352199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017739	AT	3	6	352295	352300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017739	AC	3	6	352319	352324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017739	AT	3	6	369316	369321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017739	AG	3	6	371000	371005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017739	AG	3	6	372456	372461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017739	AG	3	6	372630	372635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017739	GA	4	8	381048	381055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017739	AT	3	6	418886	418891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017739	TA	3	6	431706	431711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017739	GC	3	6	431797	431802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017739	AT	4	8	446374	446381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017739	AG	3	6	449680	449685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017739	GT	4	8	460171	460178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017739	GA	3	6	460188	460193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017739	GA	5	10	480855	480864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017739	CA	3	6	480923	480928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017739	TG	3	6	486390	486395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017739	CT	3	6	486840	486845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017739	AG	4	8	512067	512074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017739	GA	3	6	513644	513649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017739	AG	3	6	513668	513673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017739	AG	3	6	514851	514856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017739	GA	3	6	515725	515730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017739	CT	3	6	516037	516042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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87	NC_017739	CT	3	6	516271	516276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017739	GA	3	6	516732	516737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017739	CT	4	8	526771	526778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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91	NC_017739	AC	4	8	528195	528202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017739	AG	3	6	532305	532310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017739	AC	3	6	538969	538974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017739	TA	3	6	543073	543078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017739	AC	3	6	544503	544508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017739	TC	3	6	572438	572443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017739	AT	3	6	574195	574200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017739	GT	3	6	579850	579855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017739	CA	3	6	591555	591560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017739	TC	3	6	603016	603021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017739	CA	3	6	620983	620988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017739	GA	3	6	621413	621418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017739	CA	3	6	621943	621948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017739	AG	3	6	622232	622237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017739	AG	3	6	622373	622378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017739	CT	3	6	630196	630201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017739	CT	5	10	630204	630213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017739	TC	4	8	630214	630221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017739	GA	4	8	644640	644647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017739	TA	3	6	660254	660259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017739	TC	3	6	674243	674248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017739	TA	3	6	681547	681552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017739	TA	3	6	681599	681604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017739	AT	14	28	687759	687786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017739	AG	3	6	705313	705318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017739	GA	9	18	709095	709112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017739	AG	3	6	709116	709121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017739	CT	3	6	709359	709364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017739	CA	3	6	715736	715741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017739	TA	3	6	726121	726126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017739	GA	3	6	729799	729804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017739	CT	3	6	737300	737305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017739	TG	3	6	757414	757419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017739	GA	3	6	772128	772133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017739	GA	3	6	774043	774048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017739	TC	3	6	777038	777043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017739	TG	3	6	791353	791358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017739	CT	3	6	800688	800693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017739	CA	3	6	800702	800707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017739	AT	3	6	811949	811954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017739	AT	3	6	811973	811978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017739	GA	3	6	823335	823340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017739	CT	3	6	823455	823460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017739	GA	3	6	833558	833563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017739	TG	3	6	839808	839813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017739	TC	3	6	845855	845860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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138	NC_017739	TA	3	6	875285	875290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017739	TA	3	6	875292	875297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017739	TG	3	6	879472	879477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017739	CT	3	6	882196	882201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017739	AT	3	6	882255	882260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017739	CA	3	6	892445	892450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017739	AT	3	6	907007	907012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017739	TC	3	6	931489	931494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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147	NC_017739	GT	4	8	935310	935317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017739	TA	3	6	939656	939661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_017739	CT	3	6	948308	948313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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302	NC_017739	TC	3	6	1636236	1636241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
303	NC_017739	AG	3	6	1636473	1636478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
304	NC_017739	CA	3	6	1636643	1636648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
305	NC_017739	GA	3	6	1636767	1636772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
306	NC_017739	TA	3	6	1637191	1637196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_017739	GA	6	12	1637257	1637268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
308	NC_017739	CT	4	8	1639991	1639998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
309	NC_017739	GC	3	6	1641517	1641522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
310	NC_017739	TG	3	6	1646894	1646899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.