MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter cetorum MIT 00-7128 chromosome

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017737	ATTAAA	2	12	10113	10124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017737	ATTTTT	2	12	11614	11625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017737	TAGATG	2	12	12143	12154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017737	TATGTG	2	12	46737	46748	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017737	TTGCTA	2	12	49236	49247	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017737	TATAAT	2	12	63086	63097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017737	AAGAAA	2	12	73237	73248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017737	AAAAAC	2	12	84792	84803	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017737	CTAAGT	2	12	115887	115898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017737	TTAAAA	2	12	115929	115940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017737	ATTTAA	2	12	141537	141548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017737	CTAAGT	2	12	162388	162399	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017737	TTAAAA	2	12	162430	162441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017737	CTATTT	2	12	165117	165128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017737	AAAAAC	2	12	199085	199096	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017737	TGTCCT	2	12	201517	201528	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017737	ATAAAG	2	12	243122	243133	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017737	TAAAAA	2	12	248550	248561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017737	TTTTTA	2	12	259649	259660	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017737	AAAATG	2	12	262883	262894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017737	ATCTTT	2	12	282314	282325	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017737	AAATTA	2	12	286817	286828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017737	TTTATG	2	12	286961	286972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017737	TAAAAT	2	12	289333	289344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017737	TAAGAG	2	12	292772	292783	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017737	TATCAA	2	12	349849	349860	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017737	TAAAAT	2	12	354351	354362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017737	CTAATA	2	12	379690	379701	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017737	AGTTTA	2	12	380860	380871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017737	AGTTTT	2	12	405010	405021	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017737	GGAGAT	2	12	406851	406862	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017737	ACTTAG	6	36	415631	415666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017737	ACTTAG	4	24	417597	417620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017737	TTGCAT	2	12	420241	420252	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017737	ATGCTA	2	12	443317	443328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017737	TTTTGA	2	12	444183	444194	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017737	TTTGAT	2	12	444628	444639	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017737	TAAAAT	2	12	464123	464134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017737	ATCTAA	2	12	464376	464387	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017737	GTATTT	2	12	482946	482957	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017737	AGGTAG	7	42	507380	507421	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017737	TTTTTA	2	12	562516	562527	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017737	AGAATT	2	12	562617	562628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017737	TTTTGT	2	12	602734	602745	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017737	AAAAAG	2	12	602792	602803	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017737	GATTAA	2	12	639165	639176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017737	TATCAA	2	12	654574	654585	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017737	TGGTTT	2	12	658510	658521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017737	ATCCTT	5	30	687022	687051	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017737	TTTTTA	2	12	687973	687984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017737	TGCATT	2	12	694017	694028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017737	TTGAAA	2	12	703825	703836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017737	AAAAGT	2	12	723679	723690	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017737	AGGGGG	2	12	742750	742761	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017737	AAAAAC	2	12	744570	744581	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017737	TTTTAA	2	12	749030	749041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017737	ATAAAA	2	12	803751	803762	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017737	AAAATT	2	12	818163	818174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017737	GATAAG	2	12	830176	830187	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017737	ATTGTT	2	12	832867	832878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017737	AATAAG	2	12	841787	841798	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017737	ATTAGA	2	12	852397	852408	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017737	ATTTTT	2	12	852646	852657	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017737	TAAAAA	2	12	860675	860686	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017737	AGATTA	2	12	869554	869565	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017737	CAAAAA	2	12	870423	870434	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017737	GAATTT	2	12	873161	873172	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017737	ATATCT	2	12	877043	877054	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017737	ACAAAA	2	12	891320	891331	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017737	AATTAA	2	12	896414	896425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017737	ATGTGT	7	42	958257	958298	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017737	ATCAAA	2	12	974017	974028	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017737	AACAAA	2	12	990259	990270	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017737	GGGGTG	2	12	1003648	1003659	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017737	AAATTA	2	12	1009911	1009922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017737	TAAAAT	2	12	1030984	1030995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017737	TTTTTC	2	12	1058427	1058438	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017737	AATTTC	2	12	1058462	1058473	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017737	TAAAAA	2	12	1100226	1100237	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017737	AAAAGA	2	12	1157107	1157118	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017737	CTAAAG	2	12	1157145	1157156	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017737	ACAAAA	2	12	1276619	1276630	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017737	TTTTTA	2	12	1282033	1282044	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017737	ATGTAA	16	96	1295002	1295097	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017737	TAAAAA	2	12	1323145	1323156	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017737	CATTTA	16	96	1323535	1323630	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017737	ATTTTA	2	12	1349297	1349308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017737	CTTAAA	2	12	1358454	1358465	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017737	TTTTTG	2	12	1380182	1380193	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017737	AAAACA	2	12	1398912	1398923	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017737	AAAAAT	2	12	1434412	1434423	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017737	TATGTG	2	12	1442882	1442893	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017737	TGTATT	15	90	1445111	1445200	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017737	TTTCTT	2	12	1454576	1454587	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017737	AAAAAC	2	12	1454888	1454899	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017737	TTATCA	2	12	1469450	1469461	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017737	GCACCT	2	12	1501072	1501083	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017737	AAAAAT	2	12	1501649	1501660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017737	TTTGAT	2	12	1539668	1539679	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017737	TTTGAT	2	12	1549826	1549837	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017737	AAGAGA	2	12	1564282	1564293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017737	AATTAC	2	12	1574079	1574090	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017737	TTTAAA	2	12	1577070	1577081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017737	ATTAGA	2	12	1631966	1631977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017737	AATTAA	2	12	1653387	1653398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017737	TAAAAA	2	12	1667722	1667733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017737	ATTAAA	2	12	1705091	1705102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017737	TTGGTT	2	12	1706292	1706303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017737	ATAATG	2	12	1713221	1713232	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017737	ATTATA	2	12	1746611	1746622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017737	TACAAA	2	12	1750712	1750723	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017737	TTAGTT	2	12	1814006	1814017	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017737	TTGATA	2	12	1833756	1833767	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017737	AAAAAG	2	12	1837923	1837934	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017737	AATTTA	2	12	1854012	1854023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017737	TAAAAA	2	12	1914229	1914240	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017737	TTTAAT	2	12	1915213	1915224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017737	AATCTA	2	12	1927842	1927853	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017737	TCTTGC	2	12	1933580	1933591	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017737	CAAAAA	2	12	1946228	1946239	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.