MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori HUP-B14 chromosome

Total Repeats: 298

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017733	TC	3	6	4969	4974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017733	GA	8	16	7164	7179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017733	CA	3	6	16558	16563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017733	GT	3	6	25368	25373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017733	TA	3	6	27295	27300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017733	AG	3	6	40449	40454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017733	GT	3	6	44158	44163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017733	CT	3	6	44724	44729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017733	CT	3	6	57899	57904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017733	CT	3	6	59078	59083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017733	AG	4	8	59507	59514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017733	GT	3	6	60794	60799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017733	AG	3	6	64891	64896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017733	TA	10	20	76073	76092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017733	TC	3	6	77115	77120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017733	GA	4	8	81690	81697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017733	AG	3	6	81730	81735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017733	AG	3	6	90255	90260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017733	TA	3	6	90303	90308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017733	CT	3	6	92687	92692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017733	TA	3	6	93583	93588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017733	TG	4	8	100344	100351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017733	CT	3	6	109105	109110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017733	CT	3	6	131101	131106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017733	GC	3	6	134379	134384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017733	GA	3	6	136204	136209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017733	AG	3	6	136262	136267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017733	CT	3	6	159276	159281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017733	TC	3	6	161593	161598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017733	TA	3	6	170614	170619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017733	AC	3	6	171030	171035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017733	AT	3	6	177111	177116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017733	GA	3	6	177117	177122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017733	AG	3	6	182351	182356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017733	CT	3	6	184074	184079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017733	TA	3	6	197691	197696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017733	AT	3	6	198494	198499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017733	GC	3	6	205530	205535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017733	AT	3	6	208418	208423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017733	TG	3	6	220770	220775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017733	AT	3	6	260967	260972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017733	TA	3	6	288137	288142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017733	AG	3	6	298420	298425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017733	AC	3	6	312122	312127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017733	AG	3	6	320552	320557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017733	TG	3	6	320767	320772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017733	AG	3	6	327185	327190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017733	AG	4	8	335259	335266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017733	TG	3	6	341372	341377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017733	CT	3	6	350624	350629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017733	TA	3	6	367940	367945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017733	AT	3	6	369863	369868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017733	AG	3	6	371549	371554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017733	GA	4	8	381059	381066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017733	TG	3	6	399414	399419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017733	AG	3	6	402235	402240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017733	GT	3	6	405760	405765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017733	AG	3	6	412009	412014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017733	AG	3	6	412135	412140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017733	AT	3	6	421462	421467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017733	TA	3	6	434270	434275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017733	GC	3	6	434362	434367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017733	GT	4	8	462561	462568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017733	AG	3	6	462579	462584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017733	GC	3	6	462601	462606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017733	TA	3	6	463688	463693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017733	AG	3	6	468671	468676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017733	GC	3	6	494696	494701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017733	AG	3	6	508542	508547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017733	AT	3	6	520117	520122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017733	TA	3	6	530101	530106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017733	GA	3	6	545402	545407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017733	GA	3	6	548069	548074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017733	GA	3	6	558137	558142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017733	TC	3	6	577315	577320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017733	CT	3	6	587869	587874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017733	AG	3	6	596682	596687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017733	CT	3	6	596747	596752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017733	AG	6	12	596991	597002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017733	CA	4	8	597050	597057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017733	TC	3	6	597723	597728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017733	TC	3	6	604424	604429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017733	CA	3	6	607973	607978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017733	AG	3	6	608036	608041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017733	AG	3	6	608285	608290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017733	AT	4	8	608573	608580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017733	AT	3	6	615671	615676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017733	AT	3	6	617288	617293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017733	TA	3	6	639739	639744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017733	CA	3	6	640055	640060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017733	GC	3	6	660845	660850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017733	CA	3	6	662381	662386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017733	GC	3	6	662630	662635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017733	GA	3	6	663055	663060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017733	GA	3	6	665916	665921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017733	GA	3	6	667088	667093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017733	TA	3	6	682277	682282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017733	TA	3	6	697848	697853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017733	TA	3	6	697855	697860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017733	GA	7	14	713571	713584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017733	AG	3	6	713592	713597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017733	CT	4	8	726945	726952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017733	TA	3	6	741343	741348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017733	TC	3	6	742407	742412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017733	TA	3	6	752501	752506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017733	TC	3	6	752589	752594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017733	GA	3	6	770957	770962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017733	CT	4	8	795953	795960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017733	TC	3	6	796001	796006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017733	TA	3	6	800536	800541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017733	CT	3	6	804758	804763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017733	CT	3	6	805483	805488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017733	AG	3	6	811614	811619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017733	CT	3	6	812101	812106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017733	GT	3	6	812676	812681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017733	AC	3	6	816142	816147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017733	AT	3	6	819799	819804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017733	TA	3	6	820321	820326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017733	CT	3	6	820427	820432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017733	AT	3	6	833193	833198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017733	AC	3	6	833398	833403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017733	CT	3	6	839277	839282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017733	AC	3	6	839325	839330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017733	CT	3	6	839598	839603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017733	CT	3	6	840036	840041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017733	TC	3	6	840482	840487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017733	GA	3	6	845755	845760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_017733	AG	3	6	847657	847662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017733	GA	3	6	848875	848880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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133	NC_017733	GA	3	6	849761	849766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017733	AT	3	6	850394	850399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017733	AC	4	8	861245	861252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017733	TA	3	6	861492	861497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_017733	AG	3	6	880729	880734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017733	CT	3	6	882161	882166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_017733	TA	3	6	901747	901752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.