MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 705

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017668	AAAAT	2	10	21	30	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017668	TAAAA	2	10	3343	3352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017668	ATATT	2	10	18884	18893	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017668	GAACA	2	10	19138	19147	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017668	AAAGA	2	10	23471	23480	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017668	AAGAA	2	10	23485	23494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017668	AATGA	2	10	24334	24343	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017668	GTTAT	2	10	37194	37203	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017668	ATGAT	2	10	41274	41283	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017668	TCGTG	2	10	42524	42533	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017668	TCCGG	2	10	45440	45449	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017668	TGAGA	2	10	46001	46010	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017668	TGTTA	2	10	58220	58229	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017668	AAAGA	2	10	61098	61107	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017668	AGCTT	2	10	78638	78647	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017668	ATGAT	2	10	98611	98620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017668	TCGTG	2	10	99861	99870	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017668	TCCGG	2	10	102777	102786	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017668	TGAGA	2	10	103338	103347	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017668	AATAT	2	10	103585	103594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017668	TTTGA	2	10	103917	103926	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017668	TCGTG	2	10	105816	105825	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017668	TCCGG	2	10	108732	108741	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017668	TGAGA	2	10	109293	109302	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017668	AGAAA	2	10	110429	110438	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017668	GAAGG	2	10	115285	115294	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017668	ATAAA	2	10	120337	120346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017668	AATTA	2	10	129159	129168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017668	TAAAG	2	10	130309	130318	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017668	TGTAA	2	10	142091	142100	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017668	AGAAA	2	10	152499	152508	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017668	TTATA	2	10	162233	162242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017668	ATGAT	2	10	170102	170111	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017668	TCGTG	2	10	171352	171361	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017668	TCCGG	2	10	174516	174525	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017668	TGAGA	2	10	175077	175086	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017668	TAAAT	2	10	176067	176076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017668	TGAAT	2	10	179495	179504	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017668	TAAAA	2	10	182954	182963	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017668	ATCGT	2	10	185613	185622	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017668	CGTTA	2	10	186970	186979	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017668	TTTTA	2	10	189605	189614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017668	CTTTT	2	10	193660	193669	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017668	CGTTA	2	10	194887	194896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017668	AGGTG	2	10	200762	200771	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017668	TTATT	2	10	212466	212475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017668	CCTTA	2	10	212517	212526	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017668	GAAAT	2	10	221440	221449	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017668	TTTCC	2	10	221941	221950	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017668	ATAAA	2	10	238999	239008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017668	TAAAG	2	10	240719	240728	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017668	CATTT	2	10	253130	253139	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017668	TTTGG	2	10	262871	262880	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017668	GAAGG	2	10	279292	279301	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017668	TAAAA	2	10	284960	284969	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017668	TATAA	2	10	284973	284982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017668	AAAGA	2	10	293462	293471	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017668	CTATG	2	10	305077	305086	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017668	TATAA	2	10	308593	308602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017668	ACCTA	2	10	322349	322358	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017668	AAAAC	2	10	327091	327100	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017668	AAAGA	2	10	327433	327442	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017668	GTTGG	2	10	329437	329446	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017668	ATCAT	2	10	339046	339055	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017668	AGAGA	2	10	344849	344858	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017668	GCCAA	2	10	344898	344907	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017668	CTTTT	2	10	347021	347030	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017668	TAAGG	2	10	354802	354811	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017668	TGGAC	2	10	368057	368066	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017668	TTAGT	2	10	376237	376246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017668	AAATC	2	10	386687	386696	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017668	TTAAA	2	10	406202	406211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017668	ATATT	2	10	406291	406300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017668	ATTTT	2	10	406799	406808	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017668	TCGTG	2	10	408849	408858	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017668	TCCGG	2	10	411765	411774	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017668	TGAGA	2	10	412326	412335	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017668	GTATC	2	10	419124	419133	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017668	CTTTT	2	10	426948	426957	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017668	TACTT	2	10	434210	434219	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017668	ATGAC	2	10	438789	438798	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017668	TATAG	2	10	446192	446201	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017668	CGCTC	2	10	447413	447422	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_017668	GTTGC	2	10	447990	447999	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017668	GAACG	2	10	458029	458038	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017668	CTTTT	2	10	467132	467141	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017668	AATCC	2	10	471516	471525	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017668	TGTAC	2	10	479718	479727	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017668	CTTTT	2	10	493484	493493	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017668	AAAGT	2	10	493785	493794	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017668	TATAA	2	10	493901	493910	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017668	TAAAA	2	10	497353	497362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017668	AAGGA	2	10	503972	503981	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017668	GGAGA	2	10	509938	509947	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017668	TTGAA	2	10	512901	512910	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017668	CTGCC	2	10	521828	521837	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_017668	CGTTA	2	10	525718	525727	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017668	TTTTA	2	10	526257	526266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017668	TATAG	2	10	528962	528971	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017668	TTTTC	2	10	531609	531618	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017668	GAAAA	2	10	532602	532611	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017668	TGGAC	2	10	551675	551684	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017668	CCAAC	2	10	559220	559229	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_017668	AAGTT	2	10	559623	559632	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017668	ATATT	2	10	577998	578007	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017668	AATTC	2	10	579217	579226	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017668	TAATT	2	10	586506	586515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017668	CGCTC	2	10	586911	586920	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_017668	CAGTC	2	10	586948	586957	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017668	ATAAA	2	10	587385	587394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017668	CATTA	2	10	588725	588734	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017668	TAGGA	2	10	618439	618448	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017668	GCTAG	2	10	618612	618621	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017668	TAACG	2	10	618709	618718	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017668	GTTTA	2	10	627125	627134	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017668	ATTTG	2	10	627172	627181	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017668	TAAGA	2	10	631670	631679	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017668	TAAAA	2	10	639308	639317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017668	ATGTA	2	10	641877	641886	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017668	ATAAA	2	10	642348	642357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017668	CAGTA	2	10	645917	645926	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017668	TTTTG	2	10	652599	652608	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017668	CTCTT	2	10	658266	658275	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017668	CTTTA	2	10	668172	668181	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017668	AATTT	2	10	668996	669005	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017668	AAAGG	2	10	670858	670867	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017668	TAAAG	2	10	672673	672682	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017668	ATTGA	2	10	673076	673085	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017668	AAAAT	2	10	683332	683341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017668	AATGA	2	10	691397	691406	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017668	GTAAA	2	10	691428	691437	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017668	ATTAG	2	10	700532	700541	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017668	TATTT	2	10	701559	701568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017668	AGGGA	2	10	709346	709355	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017668	CGCTC	2	10	714649	714658	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_017668	CAGTC	2	10	714686	714695	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017668	GGGGA	2	10	734180	734189	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017668	ATAAA	2	10	740905	740914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017668	GAAAA	2	10	742155	742164	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017668	TTTTC	2	10	742190	742199	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017668	CTTTA	2	10	744192	744201	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017668	AAGTC	2	10	748261	748270	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017668	GATTT	2	10	756608	756617	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017668	CGCTC	2	10	756932	756941	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_017668	AATTA	2	10	770393	770402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017668	CCCGG	2	10	770487	770496	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
147	NC_017668	AGGAG	2	10	786253	786262	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_017668	TAAAG	2	10	2373303	2373312	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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