MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 17197

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017668	A	9	9	1248994	1249002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017668	GCT	2	6	1249017	1249022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_017668	T	7	7	1249046	1249052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_017668	TAT	2	6	1249234	1249239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017668	A	6	6	1249279	1249284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017668	GAT	2	6	1251129	1251134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017668	T	6	6	1251162	1251167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017668	CTT	2	6	1251171	1251176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_017668	TAAT	2	8	1251190	1251197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017668	ATGA	2	8	1251240	1251247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017668	ATTC	2	8	1251250	1251257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5512	NC_017668	A	7	7	1251263	1251269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017668	TA	3	6	1252856	1252861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017668	AT	3	6	1252937	1252942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_017668	TGG	2	6	1252953	1252958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017668	CCA	2	6	1253064	1253069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_017668	CCG	2	6	1253073	1253078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_017668	AG	3	6	1253104	1253109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_017668	CTT	2	6	1253119	1253124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_017668	T	6	6	1253199	1253204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_017668	GCG	2	6	1253310	1253315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_017668	TGGAC	2	10	1253318	1253327	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5523	NC_017668	CGT	2	6	1253353	1253358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_017668	CTT	2	6	1253456	1253461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_017668	GAG	2	6	1253719	1253724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017668	AAG	2	6	1253738	1253743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_017668	CGT	2	6	1253789	1253794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_017668	CT	4	8	1253829	1253836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_017668	TAA	2	6	1253884	1253889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_017668	T	7	7	1253970	1253976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_017668	T	7	7	1253992	1253998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017668	ATCTT	2	10	1254568	1254577	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5533	NC_017668	ATT	2	6	1254583	1254588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_017668	AT	3	6	1254591	1254596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_017668	AGC	2	6	1254613	1254618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_017668	A	7	7	1254661	1254667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_017668	AAAT	2	8	1254670	1254677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017668	GGAAA	2	10	1254707	1254716	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017668	ATT	2	6	1254722	1254727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017668	TA	3	6	1254753	1254758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017668	ATT	2	6	1254866	1254871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_017668	GAT	2	6	1254899	1254904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017668	ATG	2	6	1254925	1254930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017668	TGA	2	6	1254964	1254969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017668	GAA	2	6	1254981	1254986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017668	CTCA	2	8	1255020	1255027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_017668	GTC	2	6	1255039	1255044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_017668	T	7	7	1255077	1255083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_017668	T	7	7	1255087	1255093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017668	TCC	2	6	1255591	1255596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_017668	GTA	2	6	1255759	1255764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017668	TTA	2	6	1255790	1255795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017668	TAT	2	6	1255820	1255825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_017668	AAG	2	6	1255835	1255840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017668	GCG	2	6	1255845	1255850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_017668	CCG	2	6	1255867	1255872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_017668	GAT	2	6	1255886	1255891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017668	TCC	2	6	1256771	1256776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_017668	TAT	2	6	1256801	1256806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017668	AAATGG	2	12	1256854	1256865	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_017668	AAG	2	6	1256932	1256937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017668	AGC	2	6	1256964	1256969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_017668	AGAA	2	8	1257654	1257661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017668	GGA	2	6	1257667	1257672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_017668	CCGT	2	8	1258230	1258237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_017668	T	7	7	1258245	1258251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_017668	A	7	7	1258319	1258325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_017668	AAGGA	2	10	1258337	1258346	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017668	GGAA	2	8	1258350	1258357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_017668	GT	3	6	1258361	1258366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_017668	CA	3	6	1265861	1265866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5575	NC_017668	T	6	6	1266711	1266716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_017668	GGA	2	6	1266789	1266794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_017668	TCC	2	6	1266803	1266808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5579	NC_017668	CCT	2	6	1266903	1266908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5580	NC_017668	ACT	2	6	1266963	1266968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_017668	TGT	2	6	1266995	1267000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_017668	AAG	2	6	1267064	1267069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_017668	CAC	2	6	1267117	1267122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_017668	TTG	2	6	1267171	1267176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_017668	AAAAG	2	10	1267190	1267199	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_017668	TGGA	2	8	1267205	1267212	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_017668	ATCC	2	8	1267217	1267224	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_017668	T	7	7	1267232	1267238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_017668	AT	3	6	1267327	1267332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_017668	TC	3	6	1267344	1267349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5592	NC_017668	ACG	2	6	1267506	1267511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_017668	GA	3	6	1267522	1267527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_017668	GTT	2	6	1267599	1267604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_017668	TCG	2	6	1267618	1267623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5598	NC_017668	AAT	2	6	1267709	1267714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_017668	A	7	7	1267735	1267741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_017668	CTG	2	6	1267752	1267757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_017668	A	7	7	1267787	1267793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_017668	AGC	2	6	1267796	1267801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_017668	GCT	2	6	1267817	1267822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_017668	T	6	6	1267825	1267830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_017668	GAT	2	6	1268704	1268709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_017668	GTTC	2	8	1268786	1268793	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5608	NC_017668	ATGA	2	8	1270073	1270080	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_017668	ATA	2	6	1270108	1270113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_017668	T	6	6	1271252	1271257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_017668	AGG	2	6	1271305	1271310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_017668	CAT	2	6	1272867	1272872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_017668	A	7	7	1272895	1272901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_017668	CCT	2	6	1274376	1274381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5615	NC_017668	T	6	6	1274420	1274425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_017668	A	7	7	1274469	1274475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_017668	ACCA	2	8	1274484	1274491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5618	NC_017668	CAA	2	6	1274534	1274539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_017668	ATT	2	6	1274549	1274554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_017668	ACG	2	6	1274616	1274621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5622	NC_017668	TGTT	2	8	1274845	1274852	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_017668	TAG	2	6	1274914	1274919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_017668	T	6	6	1275034	1275039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_017668	TA	3	6	1275043	1275048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_017668	TCCT	2	8	1275994	1276001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5627	NC_017668	AAG	2	6	1276040	1276045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5631	NC_017668	TTCGA	2	10	1276365	1276374	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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