MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 17334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017459	TAT	2	6	719744	719749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017459	ATC	2	6	719771	719776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_017459	AGTATG	2	12	719796	719807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017459	TGAT	2	8	720420	720427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017459	TTAC	2	8	720432	720439	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_017459	ATC	2	6	722786	722791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_017459	TAA	2	6	724646	724651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017459	TCC	2	6	724676	724681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_017459	GGA	3	9	724692	724700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017459	CAG	2	6	724743	724748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_017459	AT	3	6	724751	724756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017459	TCT	2	6	724762	724767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_017459	TC	3	6	724774	724779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_017459	ACACTA	2	12	724800	724811	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_017459	CAGA	2	8	724817	724824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_017459	TCG	2	6	725159	725164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_017459	T	6	6	725165	725170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017459	TGA	2	6	726029	726034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017459	ATT	2	6	726045	726050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017459	CGA	2	6	726053	726058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_017459	TAA	2	6	726063	726068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_017459	TTAT	2	8	726085	726092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_017459	CAC	2	6	726138	726143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_017459	CA	3	6	728387	728392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_017459	CT	3	6	728396	728401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_017459	CAAA	2	8	730374	730381	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3527	NC_017459	TAC	2	6	730397	730402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_017459	ATT	2	6	730442	730447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_017459	GTTG	2	8	730459	730466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_017459	ACT	2	6	730539	730544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_017459	TTTA	2	8	732519	732526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017459	CGT	2	6	732550	732555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_017459	AAT	2	6	732586	732591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_017459	CTGT	2	8	732611	732618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3535	NC_017459	GA	3	6	732634	732639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_017459	T	6	6	732677	732682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_017459	AC	3	6	733348	733353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_017459	ATTA	2	8	733390	733397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017459	TTC	2	6	733474	733479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_017459	CCG	2	6	733575	733580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_017459	CCG	2	6	733630	733635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_017459	CCG	2	6	733689	733694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_017459	TG	3	6	733701	733706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_017459	ATA	2	6	733785	733790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_017459	CGTC	2	8	733799	733806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_017459	GAC	2	6	733813	733818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_017459	CCT	2	6	733892	733897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_017459	AC	3	6	733917	733922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_017459	GTC	2	6	734089	734094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_017459	TCG	2	6	734103	734108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_017459	CAATTC	2	12	734118	734129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_017459	AT	3	6	734163	734168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_017459	CT	3	6	734179	734184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_017459	CGAA	2	8	734254	734261	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_017459	TGA	2	6	734308	734313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_017459	TGA	2	6	734344	734349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_017459	ATA	2	6	734391	734396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_017459	AGACTA	2	12	734422	734433	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3559	NC_017459	TGA	2	6	736246	736251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017459	TGAGAC	4	24	736349	736372	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3561	NC_017459	CTG	2	6	736391	736396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_017459	CAT	2	6	736426	736431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_017459	GTC	2	6	736471	736476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_017459	ACATC	3	15	736493	736507	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3565	NC_017459	TTGAT	2	10	736532	736541	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017459	AT	4	8	738945	738952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017459	T	6	6	738995	739000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017459	TA	3	6	739061	739066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_017459	CATT	2	8	739622	739629	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3570	NC_017459	TTCC	2	8	739636	739643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_017459	TAT	2	6	739697	739702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_017459	ATA	2	6	739707	739712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_017459	CCGC	2	8	739724	739731	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3574	NC_017459	TATT	2	8	739759	739766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_017459	A	6	6	740008	740013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_017459	CAT	2	6	740017	740022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_017459	ATA	2	6	740081	740086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_017459	TAT	2	6	740087	740092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_017459	CAC	2	6	740128	740133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_017459	CAGAC	2	10	740152	740161	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3581	NC_017459	A	7	7	741217	741223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_017459	ATA	2	6	741225	741230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_017459	CTA	2	6	742819	742824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_017459	CGG	2	6	742832	742837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_017459	TG	3	6	742857	742862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_017459	ATC	2	6	742927	742932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3588	NC_017459	ATG	2	6	742978	742983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_017459	TC	3	6	742985	742990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_017459	CTT	2	6	743028	743033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_017459	TGA	2	6	743626	743631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3594	NC_017459	CGTC	2	8	743713	743720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_017459	TG	3	6	743772	743777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_017459	CCA	2	6	743812	743817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_017459	CGG	2	6	743909	743914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_017459	TCG	2	6	743952	743957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_017459	AGC	2	6	743984	743989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_017459	TCG	2	6	744004	744009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_017459	GGA	2	6	744028	744033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017459	TGT	2	6	744073	744078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017459	CTA	3	9	744166	744174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_017459	TGG	2	6	744210	744215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017459	ATG	2	6	744221	744226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017459	AAAAT	2	10	744232	744241	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017459	GCCG	2	8	744276	744283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_017459	ACC	2	6	744333	744338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_017459	TGC	2	6	744345	744350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_017459	TCTCT	2	10	744422	744431	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3611	NC_017459	TG	3	6	744438	744443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017459	TCGTCA	2	12	744529	744540	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_017459	ATA	2	6	744553	744558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017459	TAA	2	6	744566	744571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_017459	A	6	6	744600	744605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_017459	GAA	2	6	744606	744611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017459	ACG	2	6	744613	744618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_017459	AG	3	6	744637	744642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017459	CGA	2	6	744644	744649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_017459	TAT	2	6	745766	745771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017459	CGGA	2	8	745778	745785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_017459	TG	4	8	745801	745808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017459	GAC	2	6	745822	745827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_017459	CTG	2	6	745837	745842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_017459	ATA	3	9	748600	748608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_017459	TTCA	2	8	756388	756395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3627	NC_017459	GTAT	2	8	756404	756411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_017459	TAT	2	6	756416	756421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_017459	TC	3	6	756462	756467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_017459	A	6	6	756538	756543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_017459	ATA	2	6	756555	756560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_017459	GAA	2	6	757684	757689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_017459	TTA	2	6	757783	757788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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