MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 17334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017459	TAG	2	6	340066	340071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017459	TAA	2	6	340076	340081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017459	TGA	2	6	341125	341130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017459	TC	3	6	341145	341150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_017459	ATT	2	6	341190	341195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017459	ACCGAA	2	12	342807	342818	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_017459	GA	3	6	342896	342901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017459	ATATC	2	10	343015	343024	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1509	NC_017459	TC	3	6	343023	343028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_017459	AGC	2	6	343088	343093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_017459	GAA	2	6	343146	343151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017459	GCA	2	6	343161	343166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_017459	CGT	2	6	343171	343176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_017459	CGCGA	2	10	343190	343199	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1515	NC_017459	AATT	2	8	343206	343213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017459	AGA	2	6	343354	343359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017459	TCC	2	6	343597	343602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_017459	CA	3	6	343630	343635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_017459	CAT	3	9	343668	343676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017459	ATA	2	6	343684	343689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017459	TAT	2	6	343764	343769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017459	AGC	2	6	343783	343788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_017459	GA	3	6	344316	344321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017459	GCT	2	6	344372	344377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_017459	AAC	2	6	344396	344401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_017459	AT	3	6	344432	344437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017459	TGT	2	6	345603	345608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017459	CATCAA	2	12	345627	345638	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_017459	ATCAAC	2	12	345640	345651	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_017459	TCACC	2	10	345736	345745	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1531	NC_017459	CTT	2	6	345802	345807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017459	CGA	2	6	345818	345823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_017459	CGT	2	6	345847	345852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_017459	AAC	2	6	346001	346006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_017459	TCCACT	5	30	346028	346057	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_017459	CAG	2	6	346083	346088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_017459	AACT	2	8	346120	346127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_017459	TG	3	6	346142	346147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017459	TG	3	6	346209	346214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017459	TAA	2	6	346253	346258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017459	CAT	2	6	347742	347747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017459	TGT	2	6	347748	347753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017459	CATCAA	2	12	347778	347789	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017459	TCG	2	6	347808	347813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_017459	GA	3	6	347840	347845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017459	TC	3	6	347918	347923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_017459	GAT	2	6	347925	347930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017459	CT	3	6	347952	347957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_017459	GTG	2	6	347972	347977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017459	TGA	2	6	347992	347997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017459	ATA	2	6	348160	348165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017459	TTC	2	6	348219	348224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_017459	TGA	2	6	348225	348230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017459	TGA	3	9	348323	348331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017459	TTTA	2	8	348343	348350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017459	TCGA	2	8	349124	349131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_017459	ATAA	2	8	349217	349224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017459	CAAA	2	8	349233	349240	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_017459	GTA	2	6	349871	349876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017459	GAT	2	6	349925	349930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017459	GTA	2	6	349947	349952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017459	ATC	2	6	349964	349969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_017459	TA	3	6	350438	350443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017459	TA	3	6	350454	350459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017459	ATT	2	6	350473	350478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017459	TTC	2	6	350523	350528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_017459	CCA	2	6	351426	351431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_017459	TCC	2	6	351446	351451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_017459	A	7	7	353412	353418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017459	ACA	2	6	354007	354012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_017459	CAGA	2	8	354044	354051	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_017459	ATT	2	6	354102	354107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017459	ATTT	2	8	354146	354153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017459	CAA	2	6	354186	354191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_017459	ATA	2	6	354199	354204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017459	GGT	2	6	354233	354238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017459	AAT	2	6	354252	354257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017459	TCC	3	9	354263	354271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_017459	GTA	2	6	354276	354281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017459	AGA	2	6	354288	354293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017459	GGT	2	6	354298	354303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017459	AGT	2	6	354326	354331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017459	TC	3	6	354332	354337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_017459	TTG	2	6	354371	354376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017459	TAT	2	6	354433	354438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017459	ATC	2	6	355136	355141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_017459	TGA	2	6	355146	355151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017459	TAA	2	6	355161	355166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017459	TAA	2	6	355188	355193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017459	TAT	2	6	355197	355202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017459	ATT	2	6	355211	355216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017459	TACA	2	8	355276	355283	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_017459	CG	3	6	355325	355330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_017459	AAT	2	6	355391	355396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1596	NC_017459	TAT	2	6	355964	355969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017459	TA	3	6	355986	355991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017459	TC	3	6	357660	357665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_017459	TCA	2	6	357702	357707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_017459	TCT	2	6	357726	357731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_017459	GCAG	2	8	358138	358145	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_017459	AT	3	6	358226	358231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017459	GAA	2	6	358267	358272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017459	ATG	2	6	358280	358285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017459	GTC	2	6	358362	358367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_017459	ACC	2	6	358424	358429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_017459	ACC	2	6	358511	358516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_017459	TAGTG	2	10	358533	358542	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017459	AT	3	6	358546	358551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017459	GA	3	6	358580	358585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017459	GATAT	2	10	358596	358605	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017459	CAG	2	6	358716	358721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_017459	GCC	2	6	358733	358738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_017459	AGGCT	2	10	358745	358754	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1615	NC_017459	AT	3	6	358766	358771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017459	ATGCA	2	10	359289	359298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1617	NC_017459	CGT	2	6	359349	359354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_017459	ACG	2	6	359363	359368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_017459	ATG	2	6	361441	361446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017459	ACT	2	6	361473	361478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_017459	GA	3	6	361490	361495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017459	CTT	2	6	361507	361512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_017459	AT	3	6	361967	361972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017459	ATCC	2	8	361997	362004	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_017459	CTA	2	6	362021	362026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_017459	ATA	2	6	362040	362045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017459	CA	3	6	363445	363450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_017459	GAT	2	6	363475	363480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017459	ATT	2	6	363502	363507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017459	TCC	2	6	363546	363551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_017459	CA	3	6	363557	363562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_017459	TAT	2	6	364267	364272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017459	GAG	2	6	364365	364370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1635	NC_017459	ATTTT	2	10	364460	364469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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