MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 17334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017459	ACCAGT	2	12	204778	204789	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017459	TCAAA	2	10	205641	205650	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_017459	CA	3	6	205674	205679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_017459	TGG	2	6	205694	205699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017459	TAT	2	6	205788	205793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017459	GC	3	6	205834	205839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_017459	CGTT	2	8	207196	207203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_017459	GGA	2	6	207338	207343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017459	CAAT	2	8	207357	207364	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_017459	AT	3	6	208252	208257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017459	CA	3	6	208266	208271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_017459	AAT	2	6	208276	208281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017459	AT	3	6	208308	208313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017459	TTG	2	6	208353	208358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017459	CGCT	2	8	209044	209051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_017459	TAA	2	6	209063	209068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017459	ATG	2	6	209076	209081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017459	TGA	2	6	209085	209090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017459	AT	3	6	209109	209114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017459	CTGA	2	8	209123	209130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_017459	TC	3	6	209150	209155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_017459	CAG	2	6	209191	209196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017459	TCG	2	6	210073	210078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017459	ATT	2	6	210130	210135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017459	TC	3	6	210156	210161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_017459	GTC	2	6	211464	211469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017459	TC	3	6	211485	211490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_017459	AATCCA	2	12	211556	211567	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017459	ATGAAT	3	18	211583	211600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017459	ATAAAT	2	12	211601	211612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017459	ATT	2	6	211628	211633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017459	GAC	2	6	211642	211647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017459	AAT	3	9	211716	211724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017459	TAT	2	6	211757	211762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017459	ACT	2	6	212545	212550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017459	GAAA	2	8	212604	212611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017459	CT	3	6	213842	213847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_017459	AGT	2	6	213854	213859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017459	TAT	2	6	214022	214027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017459	GA	3	6	214039	214044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017459	GGA	2	6	214137	214142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017459	TCT	2	6	214157	214162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017459	TCG	2	6	214259	214264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_017459	TAA	2	6	214322	214327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017459	GAGT	2	8	214355	214362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017459	AGGG	2	8	214376	214383	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017459	CCG	2	6	214388	214393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_017459	ATC	2	6	214397	214402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017459	TCA	2	6	214455	214460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017459	GACT	2	8	214461	214468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_017459	ACCA	2	8	214480	214487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_017459	CACGG	2	10	214562	214571	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1053	NC_017459	TCAC	2	8	214799	214806	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_017459	ATA	2	6	214809	214814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017459	TGATAC	2	12	214900	214911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1056	NC_017459	GC	3	6	216155	216160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_017459	CT	3	6	216174	216179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_017459	AATC	2	8	216197	216204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_017459	ACA	2	6	216248	216253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017459	CA	3	6	216264	216269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_017459	CGG	2	6	217124	217129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017459	CAA	2	6	217246	217251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017459	GTTCTT	2	12	218130	218141	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1064	NC_017459	CGG	2	6	220285	220290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017459	A	6	6	220801	220806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017459	ACC	2	6	220833	220838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_017459	T	6	6	220881	220886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017459	CT	3	6	221388	221393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_017459	CAAA	2	8	222484	222491	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_017459	AAGAAA	2	12	222492	222503	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017459	ATT	2	6	224910	224915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017459	CAA	2	6	224931	224936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017459	ATC	2	6	226495	226500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_017459	CTC	2	6	226553	226558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_017459	AC	3	6	226579	226584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_017459	GAG	2	6	226639	226644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017459	AG	3	6	226643	226648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017459	GA	3	6	226666	226671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017459	GAT	2	6	226684	226689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017459	CGGA	2	8	226791	226798	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_017459	GTCG	2	8	226888	226895	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_017459	CAC	2	6	226924	226929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_017459	TCAG	2	8	226976	226983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_017459	TAA	2	6	228928	228933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017459	CAT	2	6	229016	229021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_017459	CAA	2	6	229062	229067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_017459	ATTT	2	8	229069	229076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017459	GAA	2	6	229099	229104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017459	CTG	2	6	229236	229241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_017459	TGG	2	6	229281	229286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017459	ACA	2	6	229303	229308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_017459	CGG	2	6	229343	229348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017459	CAG	2	6	229360	229365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_017459	AC	3	6	229393	229398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_017459	GGA	3	9	229481	229489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017459	AC	3	6	229514	229519	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_017459	CTCA	2	8	231277	231284	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_017459	TTGTAT	2	12	231317	231328	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017459	TCA	2	6	231354	231359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017459	TGG	2	6	231400	231405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017459	GTATTA	2	12	231432	231443	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017459	GC	3	6	231916	231921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_017459	A	7	7	231947	231953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017459	TTA	2	6	232007	232012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017459	ACA	2	6	232032	232037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017459	CAT	2	6	232142	232147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017459	GAT	2	6	232151	232156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017459	GTCA	2	8	232184	232191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_017459	AGAAC	2	10	234001	234010	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_017459	TATCA	2	10	234087	234096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1111	NC_017459	ATA	2	6	234134	234139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017459	CCGT	2	8	234148	234155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_017459	TAC	2	6	234163	234168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017459	TCC	3	9	234656	234664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_017459	ACTG	2	8	234718	234725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_017459	GGA	2	6	234749	234754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017459	GAG	2	6	234769	234774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017459	TAT	2	6	234791	234796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017459	ATA	2	6	234823	234828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017459	AATT	2	8	234838	234845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017459	GTGTA	2	10	236622	236631	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017459	GTG	2	6	236662	236667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017459	TATGA	2	10	236745	236754	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017459	AT	3	6	236770	236775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017459	ATA	2	6	236797	236802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017459	CAT	2	6	236811	236816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017459	TC	3	6	236868	236873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_017459	ATT	2	6	236939	236944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017459	TGTGT	2	10	236949	236958	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017459	AG	3	6	237982	237987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017459	CATA	2	8	238035	238042	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_017459	AT	3	6	238064	238069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017459	TAT	2	6	238077	238082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017459	TAT	2	6	238085	238090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017459	AAC	2	6	238112	238117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_017459	TTC	2	6	238135	238140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_017459	TAT	2	6	238172	238177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_017459	TGA	2	6	238275	238280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1141	NC_017459	AGAGAT	5	30	239431	239460	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1144	NC_017459	TAT	2	6	240245	240250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1161	NC_017459	TCA	2	6	245079	245084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1164	NC_017459	TCC	2	6	246421	246426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1262	NC_017459	GTA	2	6	283078	283083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1265	NC_017459	TGT	2	6	283244	283249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1271	NC_017459	TAA	2	6	283454	283459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1394	NC_017459	GAT	2	6	315416	315421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1397	NC_017459	ATTT	2	8	315967	315974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1399	NC_017459	ATA	2	6	316027	316032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1400	NC_017459	GACGAG	2	12	316073	316084	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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1402	NC_017459	TTG	2	6	316254	316259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1403	NC_017459	CCG	2	6	316287	316292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1404	NC_017459	CTC	2	6	316311	316316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1405	NC_017459	TCA	3	9	316431	316439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1408	NC_017459	AGA	2	6	319250	319255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_017459	TCC	2	6	319269	319274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1410	NC_017459	AGG	2	6	319285	319290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_017459	CTC	2	6	319443	319448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1412	NC_017459	GTTG	2	8	319474	319481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_017459	GGT	2	6	319494	319499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1424	NC_017459	TTA	2	6	325606	325611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1427	NC_017459	AT	3	6	326012	326017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_017459	TA	3	6	326176	326181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_017459	ATA	2	6	331224	331229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1450	NC_017459	TGTTA	3	15	331473	331487	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_017459	AT	3	6	331501	331506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_017459	CAAAC	2	10	331508	331517	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1454	NC_017459	GA	3	6	331585	331590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1459	NC_017459	ATAG	2	8	332462	332469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1462	NC_017459	CACT	2	8	332517	332524	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1465	NC_017459	GACT	2	8	332687	332694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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