MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 17334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017459	TCGAT	2	10	1217075	1217084	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6002	NC_017459	TA	3	6	1217167	1217172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017459	AT	3	6	1217201	1217206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_017459	CAA	2	6	1217207	1217212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_017459	TA	3	6	1217247	1217252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017459	ACT	2	6	1217255	1217260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_017459	AATG	2	8	1217291	1217298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_017459	ATT	2	6	1217318	1217323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_017459	GAT	2	6	1217468	1217473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_017459	TTG	2	6	1217567	1217572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_017459	ATCAA	2	10	1217627	1217636	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6012	NC_017459	C	6	6	1217639	1217644	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6013	NC_017459	CAT	2	6	1217804	1217809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_017459	TGA	2	6	1217834	1217839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017459	AGA	2	6	1217932	1217937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017459	ATCA	2	8	1217951	1217958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_017459	GA	3	6	1217989	1217994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017459	CATT	2	8	1218018	1218025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6019	NC_017459	AGTA	2	8	1218721	1218728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_017459	ATTA	2	8	1218997	1219004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_017459	TA	3	6	1219003	1219008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_017459	TCT	2	6	1219028	1219033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_017459	CT	3	6	1219125	1219130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_017459	AT	3	6	1219149	1219154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_017459	GT	3	6	1219205	1219210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_017459	AC	4	8	1219266	1219273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_017459	ATT	2	6	1219278	1219283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017459	TTA	2	6	1219292	1219297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_017459	TCC	2	6	1219343	1219348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_017459	CTTCC	2	10	1219352	1219361	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6031	NC_017459	TTC	2	6	1219380	1219385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_017459	ATAA	2	8	1219437	1219444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_017459	GGT	2	6	1219554	1219559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_017459	CT	3	6	1219562	1219567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_017459	GT	3	6	1219569	1219574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_017459	TCA	2	6	1219594	1219599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_017459	TCT	2	6	1219631	1219636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_017459	TCCTC	2	10	1219746	1219755	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6039	NC_017459	TC	3	6	1219767	1219772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6040	NC_017459	TAAT	2	8	1221515	1221522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017459	GA	3	6	1221535	1221540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017459	TA	3	6	1221552	1221557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_017459	ACTC	2	8	1222461	1222468	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_017459	TCG	2	6	1222490	1222495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_017459	AG	3	6	1222513	1222518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017459	TGA	2	6	1223315	1223320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_017459	AG	3	6	1223429	1223434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_017459	AT	3	6	1223525	1223530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_017459	CAT	2	6	1223563	1223568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_017459	CAT	2	6	1223576	1223581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_017459	CAG	2	6	1224084	1224089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_017459	ATAAA	2	10	1224104	1224113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_017459	GGA	2	6	1224131	1224136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_017459	GCG	2	6	1224178	1224183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_017459	CACGG	2	10	1224255	1224264	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6056	NC_017459	CGG	2	6	1224272	1224277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_017459	GAT	2	6	1224339	1224344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_017459	TCT	2	6	1224428	1224433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_017459	CAT	2	6	1224471	1224476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_017459	CAT	2	6	1224579	1224584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_017459	TGT	2	6	1224588	1224593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_017459	TTA	2	6	1225107	1225112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_017459	ATC	2	6	1225211	1225216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_017459	ATG	2	6	1225248	1225253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_017459	CTG	2	6	1225286	1225291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_017459	CA	3	6	1225319	1225324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_017459	GCT	2	6	1225409	1225414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_017459	ATA	2	6	1225452	1225457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_017459	AAC	2	6	1225459	1225464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_017459	CTAT	2	8	1225502	1225509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6071	NC_017459	A	7	7	1225613	1225619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_017459	TTGAT	2	10	1225634	1225643	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_017459	CGG	2	6	1226547	1226552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_017459	CT	3	6	1226605	1226610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_017459	ATT	2	6	1226900	1226905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_017459	ATG	2	6	1226921	1226926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_017459	TGT	2	6	1228634	1228639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_017459	TCA	2	6	1228657	1228662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_017459	AAAG	2	8	1228669	1228676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_017459	AGCA	2	8	1228685	1228692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6081	NC_017459	ATCTGA	2	12	1231192	1231203	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6082	NC_017459	TA	3	6	1231218	1231223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_017459	TCC	2	6	1232105	1232110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_017459	CAT	3	9	1232189	1232197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_017459	CTT	2	6	1232285	1232290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_017459	CGG	2	6	1232330	1232335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_017459	TTC	2	6	1232367	1232372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_017459	TTCAGT	2	12	1232388	1232399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6089	NC_017459	ATT	2	6	1232409	1232414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_017459	CACT	2	8	1232496	1232503	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_017459	AAT	2	6	1232520	1232525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_017459	TCG	2	6	1232580	1232585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_017459	TG	3	6	1232603	1232608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_017459	ATTC	2	8	1232641	1232648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6095	NC_017459	TC	4	8	1233557	1233564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_017459	GAC	2	6	1233575	1233580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_017459	TTAT	2	8	1233581	1233588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_017459	TGA	2	6	1233606	1233611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_017459	TCA	2	6	1233669	1233674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_017459	CT	3	6	1233700	1233705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6101	NC_017459	CAT	2	6	1233713	1233718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_017459	TG	3	6	1233723	1233728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017459	AAG	2	6	1233751	1233756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_017459	TGT	2	6	1233771	1233776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_017459	CGCCT	2	10	1233991	1234000	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6106	NC_017459	CGAG	2	8	1234001	1234008	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6107	NC_017459	CGAG	2	8	1234031	1234038	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6108	NC_017459	TGC	2	6	1234151	1234156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_017459	ATT	2	6	1234418	1234423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_017459	CTT	2	6	1234481	1234486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_017459	CGA	2	6	1234535	1234540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_017459	TA	3	6	1234623	1234628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_017459	TTG	2	6	1234671	1234676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_017459	ACA	2	6	1234677	1234682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_017459	TC	4	8	1234741	1234748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_017459	TAAT	2	8	1234979	1234986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_017459	GTAA	2	8	1235021	1235028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_017459	TTA	2	6	1235094	1235099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_017459	TCA	2	6	1235127	1235132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_017459	AAT	2	6	1235133	1235138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017459	ATG	2	6	1235166	1235171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_017459	TTAA	2	8	1236674	1236681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_017459	ATT	2	6	1237428	1237433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_017459	ATA	2	6	1237607	1237612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_017459	GCACT	2	10	1237711	1237720	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6126	NC_017459	GTT	2	6	1237771	1237776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_017459	TAC	2	6	1237819	1237824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_017459	TC	3	6	1237836	1237841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6129	NC_017459	CAA	2	6	1237890	1237895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_017459	GCGT	2	8	1237904	1237911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6131	NC_017459	AAT	2	6	1237916	1237921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_017459	TATCA	2	10	1241391	1241400	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6133	NC_017459	ATC	2	6	1241407	1241412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_017459	ATC	2	6	1241432	1241437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_017459	A	7	7	1241438	1241444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_017459	GAT	2	6	1241458	1241463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6138	NC_017459	ATC	2	6	1241503	1241508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6139	NC_017459	TA	3	6	1241542	1241547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6140	NC_017459	GTGA	2	8	1241566	1241573	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6142	NC_017459	TAA	2	6	1243097	1243102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6144	NC_017459	CAACT	2	10	1243223	1243232	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6146	NC_017459	CAA	2	6	1243273	1243278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6149	NC_017459	CAA	2	6	1244350	1244355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6164	NC_017459	ACTG	2	8	1248099	1248106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6165	NC_017459	ACT	2	6	1248113	1248118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6239	NC_017459	CA	4	8	1263728	1263735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6240	NC_017459	GAT	2	6	1264719	1264724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6242	NC_017459	AATC	2	8	1264729	1264736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6243	NC_017459	TCA	2	6	1264764	1264769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6245	NC_017459	AT	3	6	1265015	1265020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_017459	CTGG	2	8	1265048	1265055	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6247	NC_017459	GCTT	2	8	1265073	1265080	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6248	NC_017459	GGA	2	6	1265093	1265098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6250	NC_017459	GTGAT	2	10	1265190	1265199	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6251	NC_017459	TCA	2	6	1265227	1265232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6252	NC_017459	ATT	2	6	1265257	1265262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6253	NC_017459	ATCT	2	8	1265339	1265346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6254	NC_017459	TG	3	6	1265380	1265385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_017459	CAT	2	6	1265390	1265395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6256	NC_017459	TCA	2	6	1265431	1265436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6257	NC_017459	TTGAT	2	10	1265441	1265450	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_017459	TTG	2	6	1265480	1265485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6260	NC_017459	GTA	2	6	1266784	1266789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_017459	ATGT	2	8	1266805	1266812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6262	NC_017459	AT	3	6	1266831	1266836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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