MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 17334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017459	T	6	6	1124748	1124753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017459	AACT	2	8	1124858	1124865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_017459	GTCA	2	8	1125249	1125256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_017459	ATA	2	6	1125286	1125291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017459	AC	3	6	1125294	1125299	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_017459	ACT	2	6	1125322	1125327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_017459	AGCAA	2	10	1125329	1125338	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5508	NC_017459	CAT	2	6	1126036	1126041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_017459	TAT	2	6	1126060	1126065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017459	TCA	2	6	1126107	1126112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_017459	ATC	2	6	1126143	1126148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_017459	ATT	2	6	1126243	1126248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017459	TGAGT	2	10	1126265	1126274	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017459	ATT	2	6	1126301	1126306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_017459	TA	3	6	1126311	1126316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017459	TCT	2	6	1126359	1126364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_017459	AAT	2	6	1126389	1126394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017459	ATT	2	6	1126446	1126451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_017459	AT	3	6	1126456	1126461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_017459	TGA	2	6	1126596	1126601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_017459	AGTT	2	8	1126623	1126630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_017459	ATA	2	6	1126657	1126662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017459	AAAT	2	8	1129084	1129091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017459	GAT	2	6	1129117	1129122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_017459	CGG	2	6	1129234	1129239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_017459	CAA	2	6	1129246	1129251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_017459	CTAG	2	8	1129315	1129322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5528	NC_017459	CCA	2	6	1129380	1129385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_017459	ACA	2	6	1129435	1129440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_017459	GAT	2	6	1129500	1129505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_017459	GAA	2	6	1129517	1129522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017459	TC	3	6	1129548	1129553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_017459	ACT	2	6	1129567	1129572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_017459	ACG	2	6	1129579	1129584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_017459	CCA	2	6	1129596	1129601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_017459	GAA	2	6	1129605	1129610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_017459	TC	3	6	1129659	1129664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5538	NC_017459	CGA	2	6	1129667	1129672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_017459	CGA	2	6	1129776	1129781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_017459	CGTT	2	8	1129830	1129837	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5541	NC_017459	CCA	2	6	1130898	1130903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_017459	CGT	2	6	1130923	1130928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_017459	TGC	2	6	1130955	1130960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_017459	ACA	2	6	1131089	1131094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_017459	ACC	2	6	1131143	1131148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_017459	G	6	6	1131204	1131209	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017459	GT	3	6	1131272	1131277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017459	CAGCG	2	10	1131319	1131328	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5549	NC_017459	GGA	2	6	1131364	1131369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017459	ATA	2	6	1131385	1131390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_017459	TC	3	6	1131391	1131396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_017459	TTA	2	6	1131417	1131422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017459	AACC	2	8	1131499	1131506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_017459	AC	3	6	1132251	1132256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_017459	GTG	2	6	1132335	1132340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017459	TCA	2	6	1132469	1132474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_017459	TTA	2	6	1132508	1132513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017459	TAT	2	6	1132524	1132529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017459	AGGAT	2	10	1132582	1132591	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017459	AAT	2	6	1133492	1133497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_017459	TAT	2	6	1133529	1133534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017459	A	6	6	1133561	1133566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017459	TAAC	2	8	1133643	1133650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5564	NC_017459	TTAA	2	8	1133671	1133678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_017459	ATA	2	6	1133697	1133702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_017459	TTAATA	2	12	1133703	1133714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_017459	ATT	2	6	1133787	1133792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_017459	TAT	2	6	1133820	1133825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017459	ATA	2	6	1134298	1134303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_017459	AT	3	6	1134332	1134337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_017459	AT	3	6	1134601	1134606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_017459	ATATG	2	10	1134624	1134633	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017459	ATT	2	6	1134659	1134664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_017459	TCA	2	6	1134674	1134679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_017459	TAGA	2	8	1134694	1134701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_017459	TCA	2	6	1134734	1134739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_017459	GTTT	2	8	1135587	1135594	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_017459	ATA	2	6	1135623	1135628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_017459	ACG	2	6	1138023	1138028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_017459	ATA	2	6	1140224	1140229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_017459	AATG	2	8	1141788	1141795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_017459	ACT	2	6	1141811	1141816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_017459	ATGA	2	8	1141841	1141848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_017459	AGCG	2	8	1142073	1142080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5585	NC_017459	CAA	2	6	1142084	1142089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_017459	TAT	2	6	1142114	1142119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_017459	ATA	2	6	1142233	1142238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_017459	ATC	2	6	1142266	1142271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_017459	AAAG	2	8	1142361	1142368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_017459	TTG	2	6	1142378	1142383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_017459	CTACC	2	10	1142402	1142411	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5592	NC_017459	TGA	2	6	1142502	1142507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_017459	CCA	2	6	1142526	1142531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_017459	TGT	2	6	1142592	1142597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_017459	TTC	2	6	1142625	1142630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_017459	GCG	2	6	1142631	1142636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_017459	ACA	2	6	1142672	1142677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_017459	GT	3	6	1142705	1142710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_017459	GTG	2	6	1142834	1142839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_017459	CTC	2	6	1142879	1142884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_017459	TG	3	6	1142942	1142947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_017459	CTT	2	6	1142973	1142978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_017459	TC	3	6	1143036	1143041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5604	NC_017459	GTC	3	9	1143079	1143087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_017459	GCA	2	6	1143185	1143190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_017459	CAG	2	6	1143195	1143200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_017459	TCG	2	6	1143287	1143292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_017459	AAG	2	6	1143355	1143360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_017459	GAA	2	6	1143414	1143419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_017459	CGAA	2	8	1143451	1143458	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_017459	TGG	2	6	1143545	1143550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_017459	CGT	2	6	1143573	1143578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_017459	TCGG	2	8	1143671	1143678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5614	NC_017459	GTC	2	6	1143697	1143702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_017459	TCC	2	6	1143714	1143719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5616	NC_017459	CTT	2	6	1143745	1143750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_017459	C	7	7	1143765	1143771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5618	NC_017459	GTA	2	6	1143813	1143818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_017459	AAT	2	6	1143858	1143863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_017459	ATC	2	6	1144399	1144404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_017459	ACAA	2	8	1144434	1144441	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5622	NC_017459	CAA	2	6	1144469	1144474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_017459	TCAC	2	8	1144493	1144500	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5624	NC_017459	GA	3	6	1144508	1144513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_017459	TGC	2	6	1144752	1144757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_017459	CAC	2	6	1144849	1144854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5627	NC_017459	CGA	2	6	1144895	1144900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_017459	TAC	2	6	1144923	1144928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_017459	CATC	2	8	1144936	1144943	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5630	NC_017459	TGA	2	6	1146706	1146711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_017459	GATTCT	2	12	1146717	1146728	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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5757	NC_017459	ATA	2	6	1168956	1168961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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