MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 17334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017459	ATTT	2	8	962879	962886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_017459	CCG	2	6	962956	962961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_017459	TAT	2	6	963090	963095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_017459	CTATT	2	10	963135	963144	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4505	NC_017459	TCA	2	6	963154	963159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_017459	TTC	2	6	963164	963169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_017459	TC	3	6	963205	963210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_017459	CCG	2	6	964806	964811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_017459	TGAT	2	8	964889	964896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_017459	TTC	2	6	964897	964902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_017459	CTAT	2	8	965061	965068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_017459	CAGGG	2	10	965090	965099	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4513	NC_017459	CGA	2	6	965115	965120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_017459	GGC	2	6	965122	965127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_017459	CGGT	2	8	965176	965183	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_017459	AAC	2	6	965290	965295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_017459	CAG	2	6	965354	965359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_017459	CAG	2	6	965363	965368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_017459	ACTCG	2	10	965373	965382	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4520	NC_017459	CCA	2	6	965452	965457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4521	NC_017459	TCACGC	2	12	965459	965470	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_017459	TCC	2	6	965484	965489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4523	NC_017459	AGG	2	6	965504	965509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_017459	TTA	2	6	966060	966065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_017459	TTGA	2	8	968592	968599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_017459	TGAT	2	8	968636	968643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_017459	TCA	2	6	968669	968674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_017459	GTG	2	6	968695	968700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_017459	AGTC	2	8	970547	970554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4530	NC_017459	AATA	2	8	970628	970635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017459	TA	3	6	970637	970642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_017459	AGT	3	9	970722	970730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_017459	C	6	6	970743	970748	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4534	NC_017459	GAC	2	6	970817	970822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_017459	TTC	2	6	970843	970848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_017459	CATTT	2	10	970853	970862	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4537	NC_017459	TCACAC	2	12	970873	970884	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_017459	TTA	2	6	970915	970920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_017459	TC	3	6	971121	971126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_017459	TGA	2	6	971638	971643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_017459	AATTA	2	10	971775	971784	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017459	CATA	2	8	972044	972051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4543	NC_017459	GT	3	6	973078	973083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_017459	CTG	2	6	973084	973089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_017459	CTG	2	6	973093	973098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_017459	TAT	2	6	973110	973115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_017459	GTA	3	9	973148	973156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_017459	TGG	2	6	974418	974423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_017459	CAC	2	6	974439	974444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_017459	CATA	2	8	974457	974464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4551	NC_017459	TGAT	2	8	976055	976062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017459	ATCA	2	8	976119	976126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4553	NC_017459	ATG	2	6	976157	976162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017459	GAT	2	6	976179	976184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017459	AAT	2	6	976186	976191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017459	GGTG	2	8	976197	976204	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_017459	GTT	2	6	976222	976227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017459	AT	3	6	976236	976241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017459	TCTAT	2	10	976255	976264	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4560	NC_017459	ATA	2	6	976289	976294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017459	GGA	2	6	976353	976358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_017459	ATC	2	6	976391	976396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_017459	GGA	3	9	976418	976426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017459	TCGT	2	8	977310	977317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4565	NC_017459	GCAA	2	8	977464	977471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4566	NC_017459	TGG	2	6	977500	977505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_017459	CCA	2	6	977547	977552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_017459	AAG	2	6	977556	977561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_017459	GAC	2	6	977598	977603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_017459	GTT	3	9	977610	977618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017459	CGT	2	6	977727	977732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_017459	TG	3	6	977758	977763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_017459	TGT	2	6	977802	977807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_017459	TGA	2	6	977941	977946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017459	TGC	2	6	978146	978151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_017459	GACGAA	2	12	978257	978268	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4577	NC_017459	GAC	2	6	978269	978274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_017459	TTGT	2	8	978284	978291	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_017459	GTG	2	6	978402	978407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_017459	TAC	2	6	978425	978430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_017459	ACG	2	6	978437	978442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_017459	GAG	2	6	978482	978487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_017459	CA	3	6	978564	978569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_017459	AGT	2	6	978634	978639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_017459	GTT	2	6	978664	978669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_017459	TC	3	6	978682	978687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_017459	ACG	2	6	978756	978761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_017459	GAG	2	6	978813	978818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017459	TAA	2	6	981671	981676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_017459	GGTT	2	8	981704	981711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_017459	ACG	2	6	981727	981732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_017459	TCG	2	6	981742	981747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_017459	ATT	2	6	982034	982039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_017459	GTT	2	6	982140	982145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_017459	AT	3	6	982168	982173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_017459	GTC	2	6	982178	982183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_017459	CTT	2	6	982218	982223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_017459	GCG	2	6	982320	982325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_017459	ATC	2	6	982346	982351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_017459	CAA	2	6	982432	982437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_017459	GA	3	6	982471	982476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_017459	CTGA	2	8	982483	982490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4603	NC_017459	CTT	2	6	982513	982518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_017459	CTA	2	6	982526	982531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_017459	CA	3	6	982625	982630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_017459	CGA	2	6	982674	982679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_017459	GGC	2	6	982681	982686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_017459	ATC	2	6	982711	982716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_017459	CGGT	2	8	982734	982741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4610	NC_017459	GATGCA	2	12	982756	982767	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4611	NC_017459	AAC	2	6	982848	982853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_017459	TAGGAG	2	12	982880	982891	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_017459	CGG	2	6	982895	982900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_017459	CAG	2	6	982912	982917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_017459	AAC	2	6	982951	982956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_017459	CTGG	2	8	982971	982978	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_017459	GGTGGG	2	12	982985	982996	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_017459	TCC	2	6	983030	983035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_017459	GGA	3	9	983046	983054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_017459	AAAAC	2	10	983060	983069	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4621	NC_017459	GAT	2	6	985301	985306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_017459	AT	3	6	985335	985340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_017459	GA	3	6	985354	985359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_017459	TGC	2	6	985381	985386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_017459	ATT	2	6	985395	985400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_017459	ATG	2	6	985416	985421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_017459	TAT	2	6	985452	985457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_017459	GAAT	2	8	985503	985510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_017459	ATT	2	6	986424	986429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_017459	GACA	2	8	986438	986445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4631	NC_017459	TCA	2	6	986507	986512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_017459	TTA	2	6	989166	989171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_017459	TA	3	6	989187	989192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_017459	ACA	2	6	989195	989200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4765	NC_017459	TA	4	8	1020951	1020958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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