MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017457	TG	3	6	43	48	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017457	CT	3	6	295	300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017457	TC	3	6	348	353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017457	TC	3	6	439	444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017457	AG	3	6	835	840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017457	CT	3	6	1193	1198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017457	GA	3	6	2242	2247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017457	GA	3	6	2250	2255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017457	TA	3	6	2279	2284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017457	TA	3	6	3619	3624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017457	TA	3	6	4226	4231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017457	TG	3	6	5730	5735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017457	AT	3	6	5923	5928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017457	GA	3	6	6509	6514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017457	AT	3	6	11438	11443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017457	TC	3	6	11969	11974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017457	TC	3	6	16384	16389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017457	AT	3	6	16826	16831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017457	CA	3	6	18368	18373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017457	AT	3	6	18724	18729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017457	AG	3	6	19487	19492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017457	GA	3	6	19566	19571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017457	TC	3	6	21433	21438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017457	AT	3	6	21454	21459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017457	GT	3	6	21504	21509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017457	TC	3	6	21554	21559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017457	GT	3	6	22223	22228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017457	CA	3	6	22351	22356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017457	AT	3	6	28667	28672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017457	AG	3	6	28899	28904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017457	AG	3	6	29127	29132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017457	GA	3	6	30039	30044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017457	AG	3	6	30107	30112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017457	CT	3	6	30132	30137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017457	AC	3	6	30529	30534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017457	TG	3	6	30699	30704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017457	CT	3	6	30711	30716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017457	AG	3	6	30768	30773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017457	CT	3	6	32601	32606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017457	AC	4	8	33466	33473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017457	AT	3	6	33524	33529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017457	GA	3	6	33642	33647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017457	AT	3	6	33906	33911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017457	AT	5	10	33930	33939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017457	AT	4	8	34882	34889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017457	AT	3	6	35035	35040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017457	TA	3	6	35110	35115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017457	TA	3	6	36707	36712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017457	TA	3	6	36840	36845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017457	TA	3	6	36882	36887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017457	TA	3	6	36924	36929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017457	TA	3	6	36966	36971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017457	TA	3	6	37018	37023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017457	AT	4	8	38370	38377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017457	AC	3	6	38871	38876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017457	AT	3	6	40267	40272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017457	CT	3	6	40278	40283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017457	CT	3	6	40494	40499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017457	CT	3	6	41860	41865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017457	GA	3	6	42657	42662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017457	AC	3	6	42897	42902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017457	TA	3	6	43046	43051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017457	AT	3	6	43053	43058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017457	GA	3	6	43096	43101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017457	AT	3	6	43173	43178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017457	AC	3	6	43274	43279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017457	GT	3	6	43436	43441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017457	GA	3	6	43716	43721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017457	TG	3	6	43755	43760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017457	AT	3	6	43808	43813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017457	GT	3	6	44385	44390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017457	AG	3	6	44950	44955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017457	GT	3	6	45949	45954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017457	TA	4	8	46367	46374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017457	CA	3	6	46721	46726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017457	TA	3	6	47625	47630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017457	TA	3	6	47760	47765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017457	AG	3	6	47967	47972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017457	AT	3	6	48388	48393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017457	AT	3	6	49634	49639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017457	AT	3	6	49694	49699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017457	GA	3	6	49775	49780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017457	TA	3	6	49951	49956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017457	TC	3	6	51072	51077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017457	AT	3	6	52044	52049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017457	AT	3	6	52292	52297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017457	AG	3	6	52836	52841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017457	TC	3	6	55360	55365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017457	TA	3	6	57093	57098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017457	AT	3	6	57761	57766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017457	AG	4	8	57793	57800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017457	AT	3	6	57832	57837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017457	GA	3	6	57944	57949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017457	AT	4	8	57990	57997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017457	AT	4	8	59432	59439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017457	GT	3	6	63710	63715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017457	TA	3	6	64173	64178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017457	AT	3	6	64467	64472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017457	TC	3	6	64912	64917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017457	AG	3	6	65661	65666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017457	AT	3	6	66094	66099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017457	GA	3	6	75437	75442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017457	AT	3	6	76874	76879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017457	TG	3	6	77421	77426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017457	GA	3	6	78526	78531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017457	TG	3	6	80440	80445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017457	TA	3	6	80588	80593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017457	AG	3	6	81579	81584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017457	TG	3	6	81744	81749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017457	CT	3	6	82816	82821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017457	CT	3	6	84326	84331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017457	TC	4	8	84438	84445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017457	GT	3	6	84456	84461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017457	TA	4	8	84520	84527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017457	TC	3	6	84529	84534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017457	AG	3	6	84637	84642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017457	TC	3	6	84699	84704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017457	CT	3	6	84766	84771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017457	TG	3	6	86133	86138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017457	GT	3	6	86159	86164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017457	TA	3	6	86182	86187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017457	AC	6	12	86188	86199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017457	GA	3	6	86223	86228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017457	TG	3	6	86273	86278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017457	TA	3	6	86385	86390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017457	AT	4	8	86402	86409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017457	GT	5	10	86511	86520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017457	TA	3	6	86523	86528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017457	AC	3	6	86546	86551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017457	AC	3	6	86574	86579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017457	TA	3	6	87123	87128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017457	TA	3	6	100247	100252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.