MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017457	GAT	2	6	56615	56620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017457	GAA	2	6	56628	56633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017457	CTTT	2	8	56925	56932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_017457	CTG	2	6	56970	56975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017457	CTA	2	6	57020	57025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017457	CCA	2	6	57073	57078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_017457	TA	3	6	57093	57098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017457	ATC	2	6	57717	57722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017457	AT	3	6	57761	57766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017457	AG	4	8	57793	57800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017457	AT	3	6	57832	57837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017457	ATC	2	6	57922	57927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017457	GA	3	6	57944	57949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017457	TGAC	2	8	57954	57961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
515	NC_017457	CTA	2	6	57975	57980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017457	AT	4	8	57990	57997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017457	TAG	2	6	58025	58030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017457	ATT	2	6	58042	58047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017457	GTTA	2	8	58048	58055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017457	TAT	2	6	58064	58069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017457	CAT	2	6	58156	58161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017457	ACT	2	6	59253	59258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017457	TAA	2	6	59290	59295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017457	TGA	2	6	59352	59357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017457	TAT	2	6	59420	59425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017457	AT	4	8	59432	59439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017457	TTA	2	6	59440	59445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017457	TCT	2	6	59446	59451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017457	CTAT	2	8	59455	59462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_017457	TAGA	2	8	60519	60526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017457	GATA	2	8	60803	60810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017457	TAA	2	6	60813	60818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017457	TGT	2	6	63389	63394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017457	TCT	2	6	63437	63442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017457	GACC	2	8	63443	63450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
536	NC_017457	TCA	2	6	63466	63471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017457	TAA	2	6	63500	63505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017457	CGATC	2	10	63532	63541	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
539	NC_017457	TTGA	2	8	63548	63555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017457	ATGAT	2	10	63643	63652	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017457	CTC	2	6	63687	63692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_017457	GT	3	6	63710	63715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017457	TTC	2	6	63723	63728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017457	ATA	2	6	64119	64124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017457	GACA	2	8	64161	64168	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
546	NC_017457	TA	3	6	64173	64178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017457	AAT	2	6	64195	64200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017457	TCT	2	6	64300	64305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017457	ATTTT	2	10	64369	64378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017457	AT	3	6	64467	64472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017457	ATA	2	6	64483	64488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017457	GAC	2	6	64616	64621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017457	GGCA	2	8	64729	64736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
554	NC_017457	GGTT	2	8	64766	64773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017457	TGA	2	6	64838	64843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017457	TC	3	6	64912	64917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_017457	ACA	2	6	64942	64947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017457	CGG	2	6	64957	64962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_017457	GTCG	2	8	65010	65017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_017457	CGT	2	6	65029	65034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017457	AG	3	6	65661	65666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017457	AGT	2	6	65679	65684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017457	TCTA	2	8	65699	65706	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
564	NC_017457	TCC	2	6	65709	65714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_017457	CTG	2	6	65720	65725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017457	A	6	6	65785	65790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017457	CGA	2	6	65920	65925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017457	AAG	2	6	65981	65986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017457	TTC	2	6	66008	66013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017457	AT	3	6	66094	66099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017457	CCT	2	6	66102	66107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_017457	ACCA	2	8	66153	66160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_017457	TGG	2	6	66230	66235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017457	TCA	2	6	66237	66242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017457	TTC	2	6	66253	66258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017457	TCA	2	6	66277	66282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_017457	ACT	2	6	66286	66291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_017457	ATC	2	6	69121	69126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017457	GTA	2	6	69153	69158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017457	AGG	2	6	69268	69273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017457	GCAG	2	8	69296	69303	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
582	NC_017457	ACGAG	2	10	69305	69314	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
583	NC_017457	ACT	2	6	74988	74993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017457	TAT	2	6	75038	75043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017457	ATC	2	6	75129	75134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_017457	GTT	2	6	75191	75196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017457	TGCT	2	8	75249	75256	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_017457	TTC	2	6	75304	75309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017457	CAC	2	6	75428	75433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_017457	GA	3	6	75437	75442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017457	TGA	2	6	75486	75491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017457	ATC	2	6	75562	75567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_017457	TTC	2	6	75648	75653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017457	TTC	2	6	75720	75725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017457	CTT	2	6	75765	75770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017457	GTC	2	6	75790	75795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017457	GTA	2	6	75846	75851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017457	CCG	2	6	75988	75993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_017457	AAG	2	6	76080	76085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017457	GAT	2	6	76149	76154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017457	TCT	2	6	76212	76217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017457	GGA	2	6	76383	76388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017457	GGT	3	9	76411	76419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017457	ATG	2	6	76441	76446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017457	TCG	2	6	76454	76459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017457	CTT	2	6	76463	76468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017457	A	6	6	76476	76481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017457	TCTGAT	2	12	76535	76546	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
609	NC_017457	CGGT	2	8	76574	76581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
610	NC_017457	CAA	2	6	76618	76623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017457	AAT	2	6	76721	76726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017457	AGG	2	6	76759	76764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017457	GTG	2	6	76798	76803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017457	A	6	6	76816	76821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017457	GAT	2	6	76836	76841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017457	AT	3	6	76874	76879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017457	CAG	2	6	76887	76892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017457	TTG	2	6	76912	76917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017457	ACA	2	6	76930	76935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017457	AAC	2	6	76974	76979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017457	T	6	6	77010	77015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017457	TGA	2	6	77032	77037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017457	TAT	2	6	77072	77077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017457	TGA	2	6	77111	77116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017457	ATCGG	2	10	77185	77194	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
626	NC_017457	TCTTAT	2	12	77266	77277	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
627	NC_017457	TAT	2	6	77334	77339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017457	AAATA	2	10	77342	77351	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017457	ATT	2	6	77369	77374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017457	ACT	2	6	77388	77393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017457	AACT	2	8	77404	77411	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_017457	TG	3	6	77421	77426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017457	T	6	6	77461	77466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017457	CTG	2	6	77512	77517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017457	CAGA	2	8	77531	77538	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_017457	T	6	6	77563	77568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017457	CGG	2	6	77917	77922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_017457	ATC	2	6	77998	78003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_017457	AGT	2	6	78006	78011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017457	TAA	2	6	78017	78022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_017457	TAC	2	6	78161	78166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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