MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halanaerobium praevalens DSM 2228 chromosome

Total Repeats: 8329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017455	T	7	7	1203366	1203372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017455	A	6	6	1203403	1203408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017455	TAA	2	6	1203417	1203422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017455	ATA	2	6	1203431	1203436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017455	TA	3	6	1203455	1203460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017455	TAT	2	6	1203513	1203518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017455	TG	3	6	1203531	1203536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017455	TTGAA	2	10	1203555	1203564	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017455	A	6	6	1203575	1203580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017455	GGAAGT	2	12	1203581	1203592	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017455	T	7	7	1205230	1205236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017455	TAA	2	6	1208546	1208551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017455	TATT	2	8	1208563	1208570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017455	AATA	2	8	1208603	1208610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017455	ATTAT	2	10	1208625	1208634	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4019	NC_017455	CCT	2	6	1210587	1210592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_017455	ATT	2	6	1211549	1211554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017455	AAAG	2	8	1211562	1211569	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017455	TTTA	2	8	1211575	1211582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017455	TAA	2	6	1212899	1212904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017455	TCC	2	6	1212906	1212911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_017455	A	7	7	1215403	1215409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017455	TAA	2	6	1215410	1215415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017455	TTTA	2	8	1215420	1215427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017455	TA	3	6	1215435	1215440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017455	AT	3	6	1215444	1215449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4031	NC_017455	ATT	2	6	1215490	1215495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017455	A	6	6	1215497	1215502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017455	A	6	6	1215517	1215522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017455	CCT	2	6	1215523	1215528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4041	NC_017455	TA	3	6	1217829	1217834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017455	A	6	6	1217865	1217870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4044	NC_017455	TAT	2	6	1219268	1219273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017455	ATT	2	6	1219319	1219324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017455	ATT	2	6	1219372	1219377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017455	A	7	7	1219378	1219384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4049	NC_017455	T	6	6	1220681	1220686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4055	NC_017455	AAT	2	6	1228758	1228763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4057	NC_017455	A	7	7	1228844	1228850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4059	NC_017455	TG	3	6	1228887	1228892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4063	NC_017455	A	7	7	1231312	1231318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017455	ACTA	2	8	1231320	1231327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_017455	T	6	6	1231356	1231361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017455	TCC	2	6	1232727	1232732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4068	NC_017455	A	7	7	1233963	1233969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017455	CTT	2	6	1233976	1233981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4072	NC_017455	AAT	2	6	1234017	1234022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017455	TAA	2	6	1235505	1235510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_017455	TTA	2	6	1235646	1235651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4080	NC_017455	AAAT	2	8	1235709	1235716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_017455	TTAAA	2	10	1235726	1235735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4086	NC_017455	ATTA	2	8	1235884	1235891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017455	TA	3	6	1235890	1235895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017455	T	7	7	1235921	1235927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4093	NC_017455	TAAT	2	8	1236412	1236419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4098	NC_017455	ATT	2	6	1237410	1237415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4101	NC_017455	TC	3	6	1242204	1242209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_017455	ATTA	2	8	1242816	1242823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017455	ATTT	2	8	1242824	1242831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017455	TAA	2	6	1242854	1242859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017455	A	7	7	1242858	1242864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017455	ATT	3	9	1242879	1242887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017455	TTA	2	6	1242888	1242893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_017455	TAA	2	6	1242937	1242942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4112	NC_017455	AAT	2	6	1245278	1245283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017455	CTA	2	6	1245325	1245330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017455	A	6	6	1245456	1245461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017455	TATT	2	8	1248454	1248461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017455	AAT	2	6	1248474	1248479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017455	ATT	2	6	1248493	1248498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017455	AAAT	2	8	1248511	1248518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017455	CTT	2	6	1248525	1248530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_017455	TAA	2	6	1248541	1248546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017455	TAAA	2	8	1248554	1248561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017455	TCC	2	6	1249405	1249410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4124	NC_017455	ATT	2	6	1249436	1249441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017455	CTC	2	6	1250676	1250681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4127	NC_017455	T	7	7	1250701	1250707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017455	ATTAT	2	10	1250721	1250730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017455	AAT	3	9	1250733	1250741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017455	TAAA	2	8	1250773	1250780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017455	A	6	6	1250795	1250800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017455	AAATT	2	10	1250814	1250823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017455	TAAAAA	2	12	1250837	1250848	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4135	NC_017455	TAACT	2	10	1252809	1252818	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4260	NC_017455	TATAT	2	10	1286256	1286265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_017455	A	7	7	1286269	1286275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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