MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halanaerobium praevalens DSM 2228 chromosome

Total Repeats: 8329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017455	AT	3	6	2221843	2221848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_017455	AGGA	2	8	2222190	2222197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017455	TTA	2	6	2222199	2222204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017455	TAT	2	6	2222266	2222271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017455	AGA	2	6	2222301	2222306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017455	A	6	6	2222323	2222328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017455	TTA	2	6	2222330	2222335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017455	TAT	2	6	2222385	2222390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017455	AAT	2	6	2222394	2222399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017455	AATAA	2	10	2222421	2222430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_017455	T	6	6	2222461	2222466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017455	ATA	2	6	2222503	2222508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_017455	A	6	6	2222512	2222517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_017455	GAT	2	6	2222538	2222543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017455	TTC	2	6	2222546	2222551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_017455	T	7	7	2222568	2222574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017455	T	6	6	2222584	2222589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_017455	ATT	2	6	2222606	2222611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017455	A	7	7	2222673	2222679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017455	TCT	2	6	2222724	2222729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_017455	ATT	2	6	2222734	2222739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017455	TA	3	6	2222799	2222804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017455	TTTTG	2	10	2222816	2222825	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017455	TTTTA	2	10	2222845	2222854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_017455	TTTAT	2	10	2222873	2222882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_017455	A	7	7	2222901	2222907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017455	T	6	6	2224938	2224943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017455	ATT	2	6	2224948	2224953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017455	T	6	6	2226032	2226037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017455	CTTAT	2	10	2226058	2226067	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8031	NC_017455	T	7	7	2226079	2226085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_017455	TTATT	2	10	2226109	2226118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017455	TAA	2	6	2226152	2226157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_017455	AGG	2	6	2226186	2226191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_017455	ACC	2	6	2226195	2226200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8036	NC_017455	AGG	2	6	2226202	2226207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_017455	CTT	2	6	2227502	2227507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_017455	TCC	2	6	2235317	2235322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8039	NC_017455	CTA	2	6	2235333	2235338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_017455	CTT	2	6	2235347	2235352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_017455	TTTA	2	8	2235371	2235378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_017455	CAA	2	6	2235384	2235389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_017455	TA	3	6	2235437	2235442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017455	TAAAA	2	10	2235943	2235952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017455	ATA	2	6	2235959	2235964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017455	AT	3	6	2236011	2236016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_017455	CAA	2	6	2236066	2236071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_017455	ATT	2	6	2236079	2236084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017455	T	6	6	2236136	2236141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017455	CTAA	2	8	2236179	2236186	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8051	NC_017455	A	7	7	2236217	2236223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_017455	ATT	2	6	2236229	2236234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017455	A	8	8	2236245	2236252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017455	TCC	2	6	2237384	2237389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8055	NC_017455	CTT	2	6	2237399	2237404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_017455	TTAA	2	8	2238618	2238625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017455	ATTT	2	8	2238640	2238647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017455	TAT	2	6	2239233	2239238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017455	TAG	2	6	2239239	2239244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017455	TTAA	2	8	2239247	2239254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_017455	TAGT	2	8	2239261	2239268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_017455	TACA	2	8	2239271	2239278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8063	NC_017455	AGA	2	6	2239293	2239298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_017455	CTTT	2	8	2239743	2239750	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8065	NC_017455	ATTT	2	8	2239765	2239772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017455	TA	3	6	2239784	2239789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_017455	T	6	6	2239824	2239829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017455	A	6	6	2239830	2239835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_017455	TAA	2	6	2239874	2239879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_017455	ACT	2	6	2239926	2239931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_017455	ATTATA	2	12	2239977	2239988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_017455	CAT	2	6	2240045	2240050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_017455	CTA	2	6	2240096	2240101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_017455	TTTTA	2	10	2240109	2240118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_017455	CAG	2	6	2240165	2240170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_017455	TTTA	2	8	2240196	2240203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_017455	TCA	2	6	2240290	2240295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_017455	CA	3	6	2240294	2240299	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8079	NC_017455	TAA	2	6	2240305	2240310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_017455	CAG	2	6	2240384	2240389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_017455	ATTTG	2	10	2240395	2240404	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_017455	TA	3	6	2240414	2240419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_017455	A	6	6	2240419	2240424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_017455	TATAA	2	10	2240466	2240475	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_017455	ATT	2	6	2240507	2240512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_017455	A	6	6	2240559	2240564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_017455	TAAAT	2	10	2240596	2240605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_017455	AGG	2	6	2240653	2240658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017455	TTAA	2	8	2241300	2241307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_017455	ATT	2	6	2241308	2241313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_017455	CT	3	6	2243218	2243223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8092	NC_017455	TAA	2	6	2243259	2243264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_017455	TTA	2	6	2243267	2243272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_017455	TAAT	2	8	2243321	2243328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_017455	TAA	2	6	2243335	2243340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_017455	ATT	2	6	2243414	2243419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_017455	AT	3	6	2243432	2243437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_017455	T	7	7	2243437	2243443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_017455	TTA	2	6	2243466	2243471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_017455	TCT	2	6	2243479	2243484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_017455	AGCT	2	8	2243489	2243496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8102	NC_017455	ACT	2	6	2243519	2243524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_017455	T	6	6	2243601	2243606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_017455	T	6	6	2243623	2243628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_017455	T	6	6	2243636	2243641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_017455	AGT	2	6	2243642	2243647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_017455	T	6	6	2243647	2243652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_017455	AAT	2	6	2243657	2243662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017455	CCA	2	6	2243676	2243681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8110	NC_017455	GCT	2	6	2243688	2243693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_017455	CTG	2	6	2243728	2243733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_017455	AAT	3	9	2243807	2243815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017455	TA	3	6	2243878	2243883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_017455	CAT	2	6	2243896	2243901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_017455	AAAG	2	8	2243904	2243911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_017455	TTC	2	6	2243924	2243929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_017455	T	7	7	2243934	2243940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_017455	GCAGTG	2	12	2244006	2244017	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8119	NC_017455	A	7	7	2244212	2244218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_017455	ATT	2	6	2244261	2244266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_017455	T	6	6	2244299	2244304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_017455	CAC	2	6	2244335	2244340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8123	NC_017455	TAT	2	6	2244349	2244354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_017455	T	7	7	2244360	2244366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_017455	ATT	2	6	2244368	2244373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_017455	T	6	6	2244393	2244398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_017455	TAT	2	6	2244416	2244421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017455	CT	3	6	2244530	2244535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8129	NC_017455	CCCTA	2	10	2244559	2244568	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8130	NC_017455	TA	3	6	2244570	2244575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_017455	TCTA	2	8	2244577	2244584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8132	NC_017455	TAATT	2	10	2244667	2244676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_017455	AAATA	2	10	2244677	2244686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8134	NC_017455	CAT	2	6	2244687	2244692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8135	NC_017455	TAT	2	6	2244696	2244701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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