MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halanaerobium praevalens DSM 2228 chromosome

Total Repeats: 8329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017455	CTA	2	6	1530752	1530757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_017455	A	6	6	1530757	1530762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017455	TTA	2	6	1530854	1530859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_017455	TCTG	2	8	1530989	1530996	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5505	NC_017455	TCT	2	6	1531052	1531057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_017455	T	6	6	1531057	1531062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017455	A	6	6	1531079	1531084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017455	GAA	2	6	1531204	1531209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017455	ATC	2	6	1531221	1531226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_017455	TTA	2	6	1531257	1531262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017455	GCTT	2	8	1531344	1531351	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5512	NC_017455	TGC	2	6	1531433	1531438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_017455	CTT	2	6	1531453	1531458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_017455	A	6	6	1531495	1531500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_017455	AT	3	6	1531574	1531579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017455	AAT	2	6	1531583	1531588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017455	ATT	3	9	1531641	1531649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017455	TTC	2	6	1531650	1531655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_017455	AGTT	2	8	1531665	1531672	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_017455	GAT	2	6	1531686	1531691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_017455	ATT	2	6	1531737	1531742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_017455	A	6	6	1531901	1531906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017455	TTC	2	6	1531916	1531921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_017455	AT	3	6	1532035	1532040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_017455	TTA	2	6	1532103	1532108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017455	AT	3	6	1532131	1532136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_017455	GCTT	2	8	1532262	1532269	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5529	NC_017455	TGC	2	6	1533915	1533920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_017455	TAA	2	6	1534013	1534018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_017455	TCAACT	2	12	1534041	1534052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_017455	TTC	2	6	1534116	1534121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_017455	CTA	2	6	1534216	1534221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5535	NC_017455	TTA	2	6	1534318	1534323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_017455	TCTG	2	8	1534453	1534460	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5537	NC_017455	TCT	2	6	1534516	1534521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_017455	T	6	6	1534521	1534526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017455	A	6	6	1534543	1534548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017455	GAA	2	6	1534668	1534673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017455	ATC	2	6	1534685	1534690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5543	NC_017455	GCTT	2	8	1534808	1534815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_017455	ATT	2	6	1535944	1535949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017455	TCC	2	6	1535950	1535955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_017455	GCTT	2	8	1536044	1536051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5547	NC_017455	TTA	2	6	1536063	1536068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5550	NC_017455	TCT	2	6	1536205	1536210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_017455	TCT	2	6	1536220	1536225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_017455	TCT	2	6	1536244	1536249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_017455	TAT	2	6	1536258	1536263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5555	NC_017455	ATC	2	6	1536300	1536305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_017455	CTT	2	6	1536362	1536367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_017455	TCT	2	6	1536379	1536384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_017455	T	6	6	1536384	1536389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017455	TAAAAA	2	12	1536434	1536445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017455	T	6	6	1536496	1536501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_017455	CT	3	6	1536502	1536507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5562	NC_017455	T	8	8	1536608	1536615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017455	TTTA	2	8	1536617	1536624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017455	ATG	2	6	1536669	1536674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5575	NC_017455	TAT	2	6	1538528	1538533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5584	NC_017455	CAT	2	6	1538815	1538820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5599	NC_017455	ATTT	2	8	1539687	1539694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_017455	AAT	2	6	1539708	1539713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5602	NC_017455	AAT	2	6	1539766	1539771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_017455	AGTT	2	8	1539791	1539798	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_017455	GAT	2	6	1539812	1539817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_017455	CTT	2	6	1539824	1539829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_017455	TCTCTT	2	12	1539833	1539844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5609	NC_017455	AT	3	6	1539955	1539960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_017455	AATAA	2	10	1539978	1539987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5612	NC_017455	A	10	10	1540008	1540017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_017455	AAATTT	2	12	1540078	1540089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_017455	GAAATT	2	12	1540090	1540101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5617	NC_017455	AAT	2	6	1541057	1541062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_017455	TAA	2	6	1541105	1541110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_017455	AATT	2	8	1541111	1541118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5621	NC_017455	A	6	6	1541139	1541144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_017455	ATT	2	6	1541164	1541169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_017455	TTAT	2	8	1541171	1541178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_017455	T	7	7	1541195	1541201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_017455	ATT	2	6	1541986	1541991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_017455	TAA	2	6	1542028	1542033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_017455	TAAA	2	8	1542068	1542075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_017455	A	6	6	1542100	1542105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_017455	ATT	2	6	1542136	1542141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_017455	ATTT	2	8	1542143	1542150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_017455	T	6	6	1542148	1542153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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