MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halanaerobium praevalens DSM 2228 chromosome

Total Repeats: 8329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017455	A	7	7	1451858	1451864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017455	TAAATT	2	12	1451869	1451880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017455	ATA	3	9	1451888	1451896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017455	TAAA	2	8	1451912	1451919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017455	AAC	2	6	1451944	1451949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_017455	ATTTAT	2	12	1451965	1451976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017455	TATT	2	8	1452705	1452712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017455	TAT	2	6	1452728	1452733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017455	AT	3	6	1452735	1452740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017455	ATT	2	6	1454858	1454863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017455	AACTA	2	10	1454865	1454874	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5013	NC_017455	AAT	2	6	1454904	1454909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017455	CCT	2	6	1457551	1457556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_017455	A	6	6	1457569	1457574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017455	T	6	6	1457595	1457600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017455	TAA	2	6	1457611	1457616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017455	AAT	2	6	1457697	1457702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017455	AT	3	6	1457734	1457739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017455	AT	3	6	1457741	1457746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017455	ATA	2	6	1457781	1457786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017455	AT	3	6	1457792	1457797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017455	CAT	2	6	1457801	1457806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_017455	TA	3	6	1457811	1457816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017455	GTAAAT	2	12	1457822	1457833	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017455	T	6	6	1457841	1457846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017455	T	6	6	1457854	1457859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017455	ATT	2	6	1457868	1457873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017455	T	7	7	1457897	1457903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017455	T	6	6	1457956	1457961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017455	TTA	2	6	1457974	1457979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017455	T	6	6	1457989	1457994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017455	ATTA	2	8	1458019	1458026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017455	ATA	2	6	1459952	1459957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017455	TAA	2	6	1459962	1459967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017455	CTT	2	6	1459978	1459983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017455	AGA	2	6	1459987	1459992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017455	CTT	4	12	1460021	1460032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_017455	GT	3	6	1460043	1460048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017455	A	6	6	1460053	1460058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017455	TA	3	6	1460064	1460069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017455	CAG	2	6	1460210	1460215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_017455	AGGTA	2	10	1460235	1460244	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017455	AT	3	6	1460250	1460255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017455	AAT	2	6	1460301	1460306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017455	TAT	2	6	1460321	1460326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017455	ATTGCA	2	12	1460350	1460361	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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5049	NC_017455	CTC	2	6	1460411	1460416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_017455	ATG	2	6	1460457	1460462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017455	GCT	2	6	1460494	1460499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_017455	AG	3	6	1460511	1460516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017455	TAA	2	6	1460522	1460527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017455	CTA	2	6	1460543	1460548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_017455	CTAA	2	8	1460563	1460570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_017455	ATT	2	6	1460599	1460604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017455	ATT	2	6	1460677	1460682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017455	T	7	7	1460692	1460698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017455	AAT	2	6	1460724	1460729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017455	TCC	2	6	1460742	1460747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_017455	AAAT	2	8	1460799	1460806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017455	ACC	2	6	1460813	1460818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_017455	CTG	3	9	1460848	1460856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_017455	T	6	6	1460860	1460865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017455	CTTTTT	2	12	1460866	1460877	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5066	NC_017455	T	6	6	1460894	1460899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017455	TTA	2	6	1460907	1460912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017455	ATT	2	6	1460913	1460918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017455	TAT	2	6	1460921	1460926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017455	T	7	7	1460926	1460932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017455	TTTA	2	8	1460963	1460970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017455	ATT	2	6	1460996	1461001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5074	NC_017455	TTA	2	6	1461038	1461043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5076	NC_017455	TAT	2	6	1461085	1461090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_017455	TTA	2	6	1462335	1462340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017455	CCT	2	6	1463336	1463341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5082	NC_017455	TA	5	10	1463433	1463442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017455	TAA	2	6	1463446	1463451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5087	NC_017455	AATA	2	8	1465501	1465508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017455	AAT	2	6	1465550	1465555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017455	TTTA	2	8	1466173	1466180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017455	TAA	2	6	1466205	1466210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_017455	A	7	7	1466293	1466299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017455	ATT	2	6	1466301	1466306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017455	ATT	2	6	1466316	1466321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017455	T	7	7	1466331	1466337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017455	TTA	2	6	1466344	1466349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017455	TATT	2	8	1466350	1466357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017455	TA	4	8	1466363	1466370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017455	AAATT	2	10	1466375	1466384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017455	TAC	2	6	1468254	1468259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_017455	TAG	2	6	1468270	1468275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017455	T	6	6	1468290	1468295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017455	TTTAT	2	10	1468298	1468307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017455	ATT	2	6	1469617	1469622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017455	TTTTA	2	10	1469639	1469648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017455	ATA	3	9	1469655	1469663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017455	T	6	6	1470122	1470127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017455	T	7	7	1472282	1472288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017455	AATTT	2	10	1472297	1472306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017455	TAT	2	6	1472320	1472325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017455	A	6	6	1472331	1472336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017455	A	8	8	1472375	1472382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017455	CTT	2	6	1472386	1472391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_017455	TTTTA	2	10	1472750	1472759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017455	TA	3	6	1472767	1472772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017455	TAAAT	2	10	1473766	1473775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017455	A	6	6	1473975	1473980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017455	A	6	6	1476188	1476193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017455	TCA	2	6	1476203	1476208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_017455	TAATT	2	10	1476229	1476238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017455	TAA	2	6	1476255	1476260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017455	ATT	2	6	1476277	1476282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017455	A	6	6	1476295	1476300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017455	TAA	2	6	1476303	1476308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017455	CTAA	2	8	1476334	1476341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5127	NC_017455	T	6	6	1476350	1476355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017455	T	6	6	1476545	1476550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017455	T	6	6	1476554	1476559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017455	TA	3	6	1476608	1476613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_017455	CCT	2	6	1477999	1478004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5132	NC_017455	A	6	6	1478044	1478049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_017455	T	6	6	1478514	1478519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5404	NC_017455	TA	3	6	1521136	1521141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5405	NC_017455	TTTA	2	8	1521296	1521303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5406	NC_017455	TAA	2	6	1521310	1521315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5407	NC_017455	AAAT	2	8	1521325	1521332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5408	NC_017455	CTCTTT	2	12	1521339	1521350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5410	NC_017455	TAA	2	6	1521428	1521433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5411	NC_017455	TAT	2	6	1521440	1521445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5412	NC_017455	T	7	7	1521550	1521556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5413	NC_017455	AT	4	8	1521591	1521598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5414	NC_017455	T	6	6	1521611	1521616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5415	NC_017455	T	7	7	1521645	1521651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5416	NC_017455	TTA	2	6	1521679	1521684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5418	NC_017455	ACACT	2	10	1521715	1521724	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5421	NC_017455	T	6	6	1521883	1521888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5422	NC_017455	AGA	2	6	1521915	1521920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5429	NC_017455	CTT	2	6	1522155	1522160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5435	NC_017455	ATT	2	6	1522420	1522425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5436	NC_017455	ACTT	2	8	1522427	1522434	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5437	NC_017455	A	7	7	1522445	1522451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5438	NC_017455	TA	3	6	1522479	1522484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5439	NC_017455	AT	3	6	1522519	1522524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5442	NC_017455	TTA	2	6	1523236	1523241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5444	NC_017455	AGTT	2	8	1523394	1523401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5445	NC_017455	ATG	2	6	1524587	1524592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5450	NC_017455	CTATA	2	10	1524681	1524690	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5451	NC_017455	AT	3	6	1524743	1524748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5452	NC_017455	TA	3	6	1524758	1524763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5465	NC_017455	AT	3	6	1525245	1525250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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