MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017451	TAAG	2	8	2458	2465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017451	TAAA	2	8	3136	3143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017451	AATG	2	8	9168	9175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017451	TCTA	2	8	9206	9213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017451	AATT	2	8	10363	10370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017451	AATT	2	8	11952	11959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017451	AGCC	2	8	12514	12521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017451	TTTA	2	8	14984	14991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017451	CTTT	2	8	17477	17484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017451	CTTT	2	8	20111	20118	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017451	TAAA	2	8	20156	20163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017451	ATTT	2	8	23281	23288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017451	TTTA	2	8	31466	31473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017451	TTAA	2	8	37379	37386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017451	AATA	2	8	41118	41125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017451	CTAA	2	8	41215	41222	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017451	TTGA	2	8	49017	49024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017451	ATTT	2	8	54105	54112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017451	TATT	2	8	57978	57985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017451	CATT	2	8	60114	60121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017451	GATT	2	8	60156	60163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017451	AGTT	2	8	60353	60360	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017451	CAAA	2	8	71825	71832	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017451	TAAA	2	8	73069	73076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017451	ATAA	2	8	85281	85288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017451	GATT	2	8	86150	86157	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017451	GTAA	2	8	86768	86775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017451	AATA	2	8	87595	87602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017451	ATTA	2	8	97316	97323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017451	GTTT	2	8	97370	97377	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017451	TAAA	2	8	98643	98650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017451	CAAA	2	8	98798	98805	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017451	TAAT	2	8	104078	104085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017451	TATT	2	8	106440	106447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017451	GCTC	2	8	106572	106579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017451	TCTT	2	8	117961	117968	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017451	CTGT	2	8	120282	120289	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017451	AATC	2	8	121074	121081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017451	GAAT	2	8	121480	121487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017451	TGCT	20	80	121721	121800	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017451	AAAT	2	8	121836	121843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017451	TATT	2	8	121903	121910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017451	TTAT	2	8	121913	121920	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017451	CTTT	2	8	126806	126813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017451	TTTC	2	8	131092	131099	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017451	ATTT	2	8	135049	135056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017451	TTTA	2	8	145294	145301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017451	AAAC	2	8	145668	145675	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017451	AAAT	2	8	145686	145693	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017451	ATTT	2	8	164142	164149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017451	ATTA	2	8	164274	164281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017451	TAAT	2	8	165728	165735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017451	ATTC	2	8	168353	168360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017451	TAAA	2	8	175996	176003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017451	AGCA	9	36	183669	183704	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017451	ATTA	2	8	183817	183824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017451	TTTA	2	8	183909	183916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017451	TATC	2	8	184084	184091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017451	TCTA	2	8	184092	184099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017451	GAAA	2	8	184136	184143	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017451	CTTA	2	8	184253	184260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017451	ATAG	2	8	191340	191347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017451	GAAT	2	8	196148	196155	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017451	AATT	2	8	197249	197256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017451	TAAA	2	8	197745	197752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017451	AATA	2	8	200399	200406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017451	TTAG	2	8	211938	211945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017451	TAAA	2	8	212049	212056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017451	ATCT	2	8	212161	212168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017451	ATAA	2	8	215714	215721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017451	TAAT	2	8	223567	223574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017451	ATGA	3	12	229893	229904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017451	AGCA	2	8	238217	238224	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017451	ATTA	2	8	242093	242100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017451	ATTC	2	8	243843	243850	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017451	CTAA	2	8	244094	244101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017451	AATA	2	8	246160	246167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017451	TAAA	2	8	246197	246204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017451	ATCT	2	8	247111	247118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017451	GATT	2	8	249800	249807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017451	ATAA	2	8	249815	249822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017451	ATTA	2	8	255677	255684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017451	CAAT	2	8	255701	255708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017451	GAAG	2	8	258694	258701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017451	AATC	2	8	258755	258762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017451	TAGA	2	8	259178	259185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017451	TAAA	2	8	260296	260303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017451	TAAA	2	8	263046	263053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017451	TTTA	2	8	267181	267188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017451	ATGA	2	8	267190	267197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017451	AAAT	2	8	269973	269980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017451	ACAA	2	8	270913	270920	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017451	TTAT	2	8	276216	276223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017451	ATTT	2	8	279995	280002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017451	ATTT	2	8	282945	282952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017451	AAAT	2	8	284230	284237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017451	CTTT	2	8	289525	289532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017451	AAAT	2	8	291039	291046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017451	AAAT	2	8	291086	291093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017451	TTTA	2	8	295953	295960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017451	AAAT	2	8	299605	299612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017451	ATAA	2	8	300961	300968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017451	CAAT	2	8	301882	301889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017451	ATCA	2	8	301951	301958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017451	TGTC	2	8	306195	306202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017451	TAAA	2	8	315739	315746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017451	GACA	2	8	317470	317477	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017451	TTAC	2	8	318759	318766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017451	ATTC	2	8	320357	320364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017451	ATTT	2	8	325967	325974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017451	TTAA	2	8	326084	326091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017451	ATTA	2	8	330438	330445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017451	TATT	2	8	331005	331012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017451	TAAA	2	8	337803	337810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017451	AATG	2	8	340105	340112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017451	CTTT	2	8	340193	340200	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017451	TATT	2	8	341788	341795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017451	ATAA	2	8	343653	343660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017451	GAAT	2	8	343703	343710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017451	GATT	2	8	343749	343756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017451	CTTT	2	8	344706	344713	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017451	ATAA	2	8	348416	348423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017451	AACC	2	8	354340	354347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017451	AGGC	2	8	354365	354372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017451	GCTT	2	8	357329	357336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017451	TGAA	2	8	357652	357659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017451	AGGG	2	8	357910	357917	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017451	AAAC	2	8	359131	359138	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017451	TTGA	2	8	359156	359163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017451	TGAA	2	8	359187	359194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017451	GCGA	2	8	359510	359517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017451	GTAC	2	8	359784	359791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017451	CGTC	2	8	360224	360231	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017451	AAAG	2	8	360347	360354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017451	GCTG	2	8	361139	361146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017451	TGCC	2	8	361206	361213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017451	AAGC	2	8	361711	361718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017451	GACA	2	8	361729	361736	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017451	AGTA	2	8	362376	362383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017451	AGAA	2	8	362397	362404	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017451	TAAA	2	8	362656	362663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017451	CATA	2	8	363501	363508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017451	TTTA	2	8	365580	365587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017451	GATA	2	8	373552	373559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017451	CTAA	2	8	377917	377924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017451	TACT	2	8	377969	377976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017451	TAAA	2	8	378070	378077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017451	ATTT	2	8	379710	379717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017451	TGAA	2	8	380036	380043	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017451	ATTT	2	8	383296	383303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017451	AAAT	2	8	386137	386144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017451	TAAT	2	8	390488	390495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017451	TTTA	2	8	466814	466821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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