MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 51 chromosome

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017382	AAACAC	2	12	18185	18196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017382	TTTCTT	2	12	22742	22753	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017382	ATTTGC	2	12	74158	74169	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017382	AGATAA	2	12	80384	80395	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017382	ATATTG	2	12	97927	97938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017382	ATAAAA	2	12	121933	121944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017382	GTTTTA	2	12	145239	145250	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017382	TTGTTT	2	12	166845	166856	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017382	TAAAAA	2	12	181400	181411	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017382	AATTTC	2	12	185508	185519	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017382	TATAAT	2	12	228260	228271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017382	TAATTA	2	12	235932	235943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017382	ATTAAA	2	12	242250	242261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017382	ATTTTA	2	12	265256	265267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017382	CAAAGC	2	12	271428	271439	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017382	TTTTAA	2	12	308817	308828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017382	ATGGGG	2	12	348500	348511	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017382	TCTTTC	2	12	413434	413445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017382	TTCTTT	2	12	451360	451371	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017382	TAAAAA	2	12	454453	454464	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017382	ACTTTA	2	12	473319	473330	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017382	TATTTT	2	12	479361	479372	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017382	ATTTGA	2	12	490588	490599	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017382	TTTTTC	2	12	518980	518991	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017382	TAAAAA	2	12	564368	564379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017382	TGAAGA	2	12	622698	622709	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017382	GAAAAA	2	12	622783	622794	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017382	TTCAAA	2	12	623476	623487	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017382	ATTTTT	2	12	632979	632990	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017382	CTCATT	2	12	678054	678065	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017382	ATTTTT	2	12	688528	688539	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017382	TCGTTT	2	12	689390	689401	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017382	GATTTT	2	12	690490	690501	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017382	GCTTTA	2	12	691364	691375	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017382	TTTGAT	2	12	778196	778207	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017382	TTAAAA	2	12	785286	785297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017382	TTTAAA	2	12	818319	818330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017382	TTACAA	2	12	843493	843504	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017382	ATTAAA	2	12	880895	880906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017382	ATTATA	2	12	924738	924749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017382	ATTGAA	2	12	932143	932154	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017382	TCAAAT	2	12	954665	954676	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017382	ATTTTT	2	12	956681	956692	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017382	TTAAAA	2	12	976865	976876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017382	GCTGTG	2	12	1002395	1002406	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017382	GAAAAA	2	12	1005949	1005960	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017382	CTCTTT	2	12	1011000	1011011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017382	CTAATT	2	12	1012547	1012558	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017382	AGCTTG	2	12	1013427	1013438	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017382	TCTTGC	2	12	1015333	1015344	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017382	GTTATT	2	12	1016670	1016681	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017382	CTTTAG	2	12	1019385	1019396	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017382	CACTCC	2	12	1023972	1023983	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017382	AAGGGA	2	12	1024419	1024430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017382	ACCACT	2	12	1024510	1024521	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017382	CCACAA	2	12	1025007	1025018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017382	TTATTG	2	12	1026228	1026239	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017382	ATTTTG	2	12	1027772	1027783	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017382	TGCCAT	2	12	1052918	1052929	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017382	ACAAAA	2	12	1122914	1122925	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017382	GATTGC	2	12	1133369	1133380	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017382	AACGCT	2	12	1155497	1155508	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017382	GGCCTA	2	12	1171408	1171419	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017382	AAAAAG	2	12	1193190	1193201	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017382	GCGCAT	2	12	1206063	1206074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017382	TTGTAT	2	12	1208465	1208476	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017382	ACTTAA	2	12	1225558	1225569	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017382	AAACTT	2	12	1247814	1247825	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017382	AAAAAG	2	12	1262607	1262618	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017382	ATTTTT	2	12	1278598	1278609	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017382	CTCACG	2	12	1292744	1292755	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017382	AGTTTT	2	12	1369267	1369278	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017382	TTTTTC	2	12	1379780	1379791	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017382	AGCGGG	2	12	1380719	1380730	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017382	TGTTTA	2	12	1382983	1382994	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017382	AAAGAC	2	12	1384045	1384056	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017382	GTTTTA	2	12	1390827	1390838	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017382	TAAAAA	2	12	1391649	1391660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017382	AAGCCA	2	12	1391800	1391811	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017382	ATTAAA	2	12	1392047	1392058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017382	CTAAGT	2	12	1402955	1402966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017382	ATGTAT	2	12	1405415	1405426	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017382	TGTTTA	2	12	1411496	1411507	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017382	CCCCAA	2	12	1422395	1422406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017382	TGAAAT	2	12	1438535	1438546	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017382	TTGAAT	2	12	1492328	1492339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017382	TTGTCT	2	12	1492392	1492403	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017382	TTTTGA	2	12	1492917	1492928	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017382	TTTTCA	2	12	1494272	1494283	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017382	TGACAA	2	12	1523771	1523782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017382	CAATGC	2	12	1524172	1524183	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017382	AATAAA	2	12	1524276	1524287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017382	TTTAAA	2	12	1539736	1539747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017382	TTGCTA	2	12	1540253	1540264	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017382	AAGTTT	2	12	1586716	1586727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.