MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 2018 chromosome

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017381	GA	10	20	7427	7446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017381	CA	3	6	16843	16848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017381	GT	3	6	25503	25508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017381	TA	3	6	27467	27472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017381	AG	3	6	40555	40560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017381	AG	3	6	64933	64938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017381	AG	3	6	72560	72565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017381	TA	5	10	78951	78960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017381	TC	3	6	81131	81136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017381	AG	3	6	85653	85658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017381	GA	3	6	94043	94048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017381	AG	3	6	94123	94128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017381	TA	3	6	97616	97621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017381	AG	3	6	98764	98769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017381	GT	3	6	99537	99542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017381	AT	3	6	104359	104364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017381	AG	3	6	109807	109812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017381	AG	3	6	112596	112601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017381	GA	3	6	112992	112997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017381	CT	3	6	125055	125060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017381	TC	3	6	131393	131398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017381	CT	3	6	134403	134408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017381	GC	3	6	137655	137660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017381	AG	3	6	154407	154412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017381	TC	3	6	165580	165585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017381	AT	3	6	174633	174638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017381	AC	3	6	174957	174962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017381	CT	3	6	177603	177608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017381	GT	3	6	177645	177650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017381	AG	3	6	186506	186511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017381	CT	3	6	186541	186546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017381	TA	3	6	201818	201823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017381	TA	3	6	201870	201875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017381	AT	3	6	212557	212562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017381	GC	3	6	212910	212915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017381	TG	3	6	224950	224955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017381	GA	3	6	224967	224972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017381	GT	3	6	230926	230931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017381	GA	3	6	232451	232456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017381	AG	3	6	236849	236854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017381	AC	3	6	237261	237266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017381	GA	3	6	290438	290443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017381	AG	3	6	300779	300784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017381	GA	3	6	304555	304560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017381	AC	3	6	314678	314683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017381	TC	3	6	324844	324849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017381	AG	3	6	331732	331737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017381	AG	3	6	340238	340243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017381	TA	3	6	371943	371948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017381	AT	3	6	373846	373851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017381	AG	3	6	375538	375543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017381	GA	4	8	385493	385500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017381	GT	3	6	408130	408135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017381	AT	3	6	423976	423981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017381	TA	3	6	436768	436773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017381	GC	3	6	436860	436865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017381	GT	3	6	463629	463634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017381	AG	3	6	463647	463652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017381	TA	3	6	464784	464789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017381	TG	3	6	468674	468679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017381	TG	3	6	489157	489162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017381	AT	3	6	502789	502794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017381	AT	3	6	502863	502868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017381	AT	3	6	507103	507108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017381	GA	3	6	514226	514231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017381	AG	4	8	514501	514508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017381	GA	3	6	516107	516112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017381	AG	3	6	516131	516136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017381	TG	3	6	517628	517633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017381	AC	3	6	517889	517894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017381	TG	3	6	518052	518057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017381	GA	3	6	518200	518205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017381	AT	3	6	524166	524171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017381	TG	3	6	524176	524181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017381	CT	4	8	528448	528455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017381	CT	3	6	529761	529766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017381	GT	3	6	530161	530166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017381	AG	3	6	534002	534007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017381	TC	3	6	534502	534507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017381	GA	4	8	541198	541205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017381	TA	3	6	545386	545391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017381	CA	3	6	550058	550063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017381	TA	3	6	558591	558596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017381	CT	4	8	575364	575371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017381	AT	3	6	577126	577131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017381	AT	3	6	583650	583655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017381	AT	3	6	583699	583704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017381	CT	3	6	583813	583818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017381	GT	3	6	584247	584252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017381	AT	3	6	584264	584269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017381	TA	3	6	594573	594578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017381	TA	3	6	604756	604761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017381	TC	3	6	604967	604972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017381	AG	3	6	619006	619011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017381	CG	3	6	631663	631668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017381	CT	8	16	632340	632355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017381	TA	3	6	648128	648133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017381	CT	3	6	681444	681449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017381	TC	3	6	683315	683320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017381	CT	3	6	683512	683517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017381	AC	3	6	683660	683665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017381	TA	3	6	688602	688607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017381	AC	3	6	691689	691694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017381	CA	3	6	694751	694756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017381	AG	3	6	696028	696033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017381	TA	3	6	707884	707889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017381	AG	3	6	707959	707964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017381	TC	3	6	708026	708031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017381	AG	3	6	708277	708282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017381	CT	3	6	708439	708444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017381	CT	3	6	714119	714124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017381	TA	3	6	714205	714210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017381	AT	3	6	729785	729790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017381	GC	3	6	731085	731090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017381	GA	3	6	734961	734966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017381	GT	3	6	739391	739396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017381	TA	3	6	740759	740764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017381	AG	3	6	751551	751556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017381	TC	3	6	760575	760580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017381	GA	3	6	761411	761416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017381	AT	3	6	761852	761857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017381	GA	3	6	763202	763207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017381	GA	3	6	777469	777474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017381	TC	3	6	782373	782378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017381	TC	3	6	791172	791177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017381	CT	3	6	821626	821631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017381	AC	3	6	864195	864200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017381	TA	3	6	870540	870545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017381	TA	3	6	871096	871101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017381	AT	3	6	884862	884867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017381	CT	3	6	885653	885658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017381	AG	3	6	888032	888037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017381	AT	3	6	911637	911642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017381	AG	3	6	936831	936836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017381	AG	3	6	936910	936915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017381	TA	3	6	938719	938724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017381	CT	3	6	947158	947163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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139	NC_017381	CT	3	6	960052	960057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017381	AG	3	6	966604	966609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017381	CT	3	6	979008	979013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017381	TA	3	6	983411	983416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017381	AG	3	6	985071	985076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017381	GA	3	6	985124	985129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017381	GT	3	6	986448	986453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017381	AG	3	6	986998	987003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017381	TA	3	6	987152	987157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017381	AT	3	6	993509	993514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017381	AG	3	6	993955	993960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_017381	GT	3	6	1001264	1001269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017381	CA	3	6	1001585	1001590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.