MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 2018 chromosome

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017381	TCATT	2	10	4955	4964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017381	GCTTT	2	10	13757	13766	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017381	CTTTA	2	10	25455	25464	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017381	AGCCT	2	10	26029	26038	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017381	GATAA	2	10	50582	50591	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017381	AACGA	2	10	59734	59743	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017381	TTAAA	2	10	59746	59755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017381	ACAAA	2	10	59774	59783	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017381	TGATA	2	10	60088	60097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017381	AAGCC	2	10	60548	60557	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017381	CAAAA	2	10	72425	72434	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017381	TTACA	2	10	77290	77299	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017381	TAAAA	2	10	78973	78982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017381	TAAGA	2	10	91970	91979	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017381	ATTAT	2	10	92026	92035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017381	ATAAA	2	10	98643	98652	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017381	GAATG	2	10	112554	112563	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017381	GATTT	2	10	116822	116831	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017381	CCATA	2	10	124732	124741	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017381	ATTTT	2	10	132592	132601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017381	AATAA	2	10	134818	134827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017381	ATAAA	2	10	139228	139237	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017381	AGAGC	2	10	139691	139700	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017381	CAAAT	2	10	156338	156347	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017381	TTGAA	2	10	163609	163618	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017381	AATAT	2	10	174692	174701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017381	TTTCC	2	10	174744	174753	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017381	GAATG	2	10	174830	174839	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017381	TTTCT	2	10	177710	177719	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017381	AAATC	2	10	178054	178063	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017381	TTTAA	2	10	181105	181114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017381	TTCAA	2	10	194241	194250	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017381	AAACA	2	10	205741	205750	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017381	TAAGA	2	10	212783	212792	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017381	ATTTT	2	10	216055	216064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017381	TTTAG	2	10	224883	224892	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017381	AAAAC	2	10	224911	224920	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017381	CTTAA	2	10	229467	229476	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017381	TTTTA	2	10	230790	230799	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017381	ATTTA	2	10	234967	234976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017381	CTAAC	2	10	237232	237241	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017381	AATTT	2	10	281120	281129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017381	AACAT	2	10	303486	303495	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017381	GTGGG	2	10	314648	314657	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017381	TTTTA	2	10	331665	331674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017381	ATTAA	2	10	337496	337505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017381	AATAA	2	10	341292	341301	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017381	AATAA	2	10	341304	341313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017381	TAAAA	2	10	345523	345532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017381	TAAAA	2	10	357311	357320	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017381	TAAAA	2	10	366298	366307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017381	TAGTG	2	10	404378	404387	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017381	TAAAG	2	10	417285	417294	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017381	ATAAA	2	10	429261	429270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017381	AAAAT	2	10	429295	429304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017381	AAAAT	2	10	438357	438366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017381	TAACA	2	10	449498	449507	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017381	ATTAA	2	10	450884	450893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017381	TAAAA	2	10	450982	450991	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017381	TTTGA	2	10	451083	451092	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017381	AAAAT	2	10	455714	455723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017381	AGTAA	2	10	464974	464983	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017381	AAAAC	2	10	468165	468174	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017381	TAACT	2	10	474289	474298	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017381	AGGCT	2	10	483646	483655	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017381	ATTTT	2	10	490044	490053	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017381	TAAAA	2	10	490233	490242	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017381	CTGAT	2	10	503087	503096	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017381	AAAAT	2	10	509482	509491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017381	GTTTT	2	10	518419	518428	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017381	ATACC	2	10	530188	530197	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017381	AAATT	2	10	533944	533953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017381	GAGTT	2	10	534568	534577	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017381	TTTAA	2	10	535367	535376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017381	ATTTT	2	10	536892	536901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017381	TTGTA	2	10	541124	541133	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017381	TATAA	2	10	549985	549994	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017381	AAAAG	2	10	550105	550114	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017381	ACTCT	2	10	565581	565590	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017381	TAAGG	2	10	577258	577267	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017381	ATTTT	2	10	584484	584493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017381	TTTAA	2	10	608494	608503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017381	TTTAA	2	10	618930	618939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017381	ATTTT	2	10	673603	673612	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017381	TTGTA	2	10	673619	673628	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017381	AAATC	2	10	680798	680807	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017381	CTTAT	2	10	683177	683186	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017381	GTTTT	2	10	702094	702103	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017381	TCTAT	2	10	702182	702191	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017381	CTTTT	2	10	707982	707991	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017381	GGAAT	2	10	711488	711497	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017381	ATTTA	2	10	722928	722937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017381	AAAAT	2	10	740820	740829	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017381	TCTTT	2	10	755404	755413	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017381	TCTCT	2	10	761865	761874	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017381	GGTTT	2	10	777843	777852	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017381	TTTTA	2	10	782410	782419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017381	AATAA	2	10	788336	788345	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017381	TTCTT	2	10	796165	796174	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017381	TAAGA	2	10	818993	819002	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017381	CAAGC	2	10	829869	829878	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017381	TATTT	2	10	830462	830471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017381	ATAAA	2	10	830664	830673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017381	TTTAA	2	10	861289	861298	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017381	AAAGA	2	10	864277	864286	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017381	ATTTT	2	10	866001	866010	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017381	ATTAA	2	10	886932	886941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017381	TTTGT	2	10	887654	887663	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017381	TTTTA	2	10	887836	887845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017381	GATTG	2	10	889668	889677	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017381	ATAAA	2	10	890406	890415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017381	TAAAA	2	10	896730	896739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017381	ATGAT	2	10	905049	905058	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017381	TTTGT	2	10	909722	909731	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017381	TCAAG	2	10	928877	928886	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017381	TATTT	2	10	940636	940645	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017381	GATTG	2	10	940674	940683	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017381	TGATT	2	10	942218	942227	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017381	GATTT	2	10	946920	946929	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017381	AAACA	2	10	949863	949872	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017381	CAATA	2	10	987589	987598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017381	TTTTA	2	10	999150	999159	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017381	TTAAA	2	10	999173	999182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017381	TTCAA	2	10	1002104	1002113	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017381	CTCAT	2	10	1002334	1002343	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017381	TCACT	2	10	1003813	1003822	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017381	TACTT	2	10	1004112	1004121	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017381	TTAAT	2	10	1006950	1006959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017381	AAAAT	2	10	1027097	1027106	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017381	TAAAA	2	10	1058696	1058705	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017381	AAAAT	2	10	1059874	1059883	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017381	AACTT	2	10	1059890	1059899	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017381	TGAAA	2	10	1073210	1073219	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017381	ATTTA	2	10	1073278	1073287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017381	GATTA	2	10	1073555	1073564	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017381	TAAGT	2	10	1084767	1084776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017381	ATAAA	2	10	1093323	1093332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017381	TAAAA	2	10	1098013	1098022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017381	AAAAC	2	10	1104393	1104402	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017381	ATCCA	2	10	1115456	1115465	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017381	CACGA	2	10	1124363	1124372	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017381	TTACC	2	10	1125161	1125170	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017381	CCAAT	2	10	1126313	1126322	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017381	TTAAA	2	10	1132840	1132849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017381	AAAAG	2	10	1134430	1134439	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017381	TAATT	2	10	1155786	1155795	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017381	AAAAC	2	10	1155824	1155833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017381	TTAAT	2	10	1158571	1158580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017381	TATTT	2	10	1158607	1158616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017381	CAATC	2	10	1173014	1173023	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_017381	ACCAT	2	10	1189426	1189435	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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156	NC_017381	AAATT	2	10	1198528	1198537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017381	TAACA	2	10	1212249	1212258	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_017381	GTTTT	2	10	1230162	1230171	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_017381	TATTT	2	10	1292549	1292558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017381	GTTTG	2	10	1293245	1293254	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_017381	AATTG	3	15	1345017	1345031	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_017381	AATTT	2	10	1348653	1348662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_017381	CAACC	2	10	1360656	1360665	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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182	NC_017381	TATAT	2	10	1411582	1411591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017381	TTATT	2	10	1440426	1440435	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017381	TAATA	2	10	1451122	1451131	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017381	AAAAG	2	10	1460961	1460970	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_017381	TATAA	2	10	1485573	1485582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_017381	GTTTG	2	10	1492478	1492487	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
191	NC_017381	CTAAA	2	10	1493505	1493514	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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193	NC_017381	AATCA	2	10	1507048	1507057	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
194	NC_017381	ATAAA	2	10	1509859	1509868	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_017381	CTTTT	2	10	1541570	1541579	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_017381	TAAAA	2	10	1542579	1542588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_017381	TTTGA	2	10	1551878	1551887	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017381	AATTC	2	10	1553039	1553048	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
199	NC_017381	ATCTC	2	10	1557087	1557096	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
200	NC_017381	TAGTG	2	10	1558588	1558597	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
201	NC_017381	TAAAA	2	10	1558813	1558822	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_017381	ATATT	2	10	1560640	1560649	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.