MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 2018 chromosome

Total Repeats: 3322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017381	A	6	6	1461647	1461652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017381	TAT	2	6	1461675	1461680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017381	T	8	8	1461694	1461701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017381	GTT	2	6	1461720	1461725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017381	A	7	7	1461726	1461732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017381	T	6	6	1461805	1461810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017381	A	6	6	1461947	1461952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017381	T	6	6	1461995	1462000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017381	TTTG	2	8	1462006	1462013	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017381	T	6	6	1462052	1462057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017381	G	6	6	1462060	1462065	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017381	GTTT	2	8	1462125	1462132	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017381	CTA	2	6	1462148	1462153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_017381	T	6	6	1462192	1462197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017381	CTTG	2	8	1462223	1462230	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_017381	T	7	7	1462268	1462274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017381	ATC	2	6	1462323	1462328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_017381	GTA	2	6	1462329	1462334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017381	T	6	6	1462369	1462374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017381	TAAA	2	8	1466537	1466544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017381	TCA	2	6	1466625	1466630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_017381	ATC	2	6	1466648	1466653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_017381	TTGGT	2	10	1466661	1466670	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017381	T	6	6	1466691	1466696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017381	A	6	6	1466705	1466710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017381	TTC	2	6	1466738	1466743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3028	NC_017381	CCA	2	6	1466782	1466787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_017381	AAC	2	6	1466790	1466795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_017381	T	6	6	1466798	1466803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017381	TTC	2	6	1466915	1466920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_017381	CT	3	6	1467038	1467043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_017381	TC	3	6	1467046	1467051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_017381	TCA	2	6	1467057	1467062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_017381	T	6	6	1467075	1467080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017381	T	9	9	1467189	1467197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017381	TCA	2	6	1467217	1467222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017381	TTA	2	6	1467268	1467273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017381	T	6	6	1467366	1467371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017381	CGT	2	6	1467375	1467380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_017381	AAG	2	6	1467410	1467415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017381	T	7	7	1467422	1467428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017381	TCA	2	6	1467436	1467441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_017381	TGA	2	6	1467481	1467486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017381	T	6	6	1467513	1467518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017381	TTGATT	2	12	1467532	1467543	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017381	T	6	6	1467542	1467547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017381	A	6	6	1467604	1467609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017381	T	7	7	1467672	1467678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017381	TTGA	2	8	1467690	1467697	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017381	TCA	2	6	1467715	1467720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_017381	TTCT	2	8	1467725	1467732	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3053	NC_017381	AAACCC	2	12	1467736	1467747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_017381	T	6	6	1467780	1467785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017381	T	6	6	1467797	1467802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3057	NC_017381	CAAAAT	2	12	1467917	1467928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3058	NC_017381	TTG	2	6	1467993	1467998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017381	TCA	2	6	1468043	1468048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_017381	A	6	6	1468088	1468093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017381	TTTTTC	2	12	1468125	1468136	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3062	NC_017381	T	6	6	1468209	1468214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017381	TCT	2	6	1468219	1468224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_017381	GC	3	6	1468228	1468233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_017381	CTT	2	6	1468277	1468282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_017381	TTG	2	6	1468290	1468295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017381	CTT	2	6	1468412	1468417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_017381	CTT	2	6	1468457	1468462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_017381	TCT	2	6	1468567	1468572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_017381	GC	3	6	1468592	1468597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_017381	TTTGAC	2	12	1468614	1468625	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3072	NC_017381	TCG	2	6	1468661	1468666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_017381	T	6	6	1468677	1468682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017381	A	6	6	1468702	1468707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017381	TCA	2	6	1468711	1468716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_017381	T	6	6	1468770	1468775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017381	ATC	2	6	1468806	1468811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_017381	T	7	7	1468866	1468872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_017381	TG	3	6	1468892	1468897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017381	TGAT	3	12	1468986	1468997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017381	T	6	6	1469007	1469012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_017381	GCA	2	6	1469020	1469025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3084	NC_017381	AC	3	6	1469039	1469044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_017381	GAAT	2	8	1469066	1469073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_017381	A	6	6	1469124	1469129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017381	TAA	2	6	1469361	1469366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017381	AATC	2	8	1469438	1469445	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_017381	ATAAA	2	10	1473351	1473360	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017381	T	7	7	1475174	1475180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017381	T	6	6	1475203	1475208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017381	TAA	2	6	1475212	1475217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017381	T	6	6	1475221	1475226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017381	GCTTG	2	10	1475227	1475236	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3095	NC_017381	AGA	2	6	1475256	1475261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017381	GGT	2	6	1475279	1475284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017381	CCA	2	6	1475301	1475306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_017381	TAAT	2	8	1476841	1476848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017381	AGT	2	6	1476862	1476867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017381	TGAA	2	8	1476875	1476882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017381	TGAA	2	8	1476950	1476957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017381	TTA	2	6	1478358	1478363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017381	GTG	2	6	1478376	1478381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017381	TGAA	2	8	1478402	1478409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017381	TGAA	2	8	1478413	1478420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017381	TGCT	2	8	1478462	1478469	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_017381	TAA	2	6	1478473	1478478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017381	A	6	6	1478492	1478497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017381	TAA	2	6	1481780	1481785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017381	TGA	2	6	1481828	1481833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017381	TGT	2	6	1481848	1481853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017381	TAA	2	6	1482707	1482712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017381	T	6	6	1482717	1482722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017381	ATT	2	6	1482752	1482757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017381	TGT	2	6	1482797	1482802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017381	T	6	6	1482891	1482896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017381	ATG	2	6	1482991	1482996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017381	AAT	2	6	1483025	1483030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017381	GTT	2	6	1483074	1483079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017381	TATAA	2	10	1485573	1485582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017381	TCA	2	6	1489348	1489353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_017381	C	6	6	1489365	1489370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3123	NC_017381	GA	3	6	1491932	1491937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017381	ATT	2	6	1491949	1491954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017381	T	6	6	1491959	1491964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017381	TAA	2	6	1492001	1492006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017381	A	7	7	1492012	1492018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017381	TAA	2	6	1492021	1492026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017381	TTA	2	6	1492060	1492065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017381	T	15	15	1492080	1492094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_017381	TAG	2	6	1492110	1492115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_017381	AC	3	6	1492132	1492137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_017381	T	6	6	1492174	1492179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_017381	ATC	2	6	1492290	1492295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3260	NC_017381	A	6	6	1551395	1551400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3264	NC_017381	A	7	7	1551648	1551654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_017381	TTG	2	6	1551680	1551685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3269	NC_017381	TTG	2	6	1551791	1551796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3271	NC_017381	TTTGA	2	10	1551878	1551887	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3300	NC_017381	A	6	6	1559030	1559035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3304	NC_017381	T	6	6	1560708	1560713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3312	NC_017381	T	7	7	1561257	1561263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3313	NC_017381	A	7	7	1561266	1561272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3319	NC_017381	TTG	2	6	1562483	1562488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3321	NC_017381	GTT	2	6	1562551	1562556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3322	NC_017381	ACC	2	6	1562823	1562828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.