MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Puno135 chromosome

Total Repeats: 297

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017379	TC	3	6	4944	4949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017379	GA	9	18	7035	7052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017379	CT	3	6	13377	13382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017379	CA	3	6	16437	16442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017379	CT	4	8	22541	22548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017379	TA	3	6	26785	26790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017379	AG	3	6	38482	38487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017379	AG	3	6	42271	42276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017379	CT	3	6	49682	49687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017379	GA	3	6	49759	49764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017379	TC	3	6	51490	51495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017379	AG	3	6	57664	57669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017379	AG	3	6	71040	71045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017379	TA	5	10	77366	77375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017379	CT	3	6	77522	77527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017379	TC	3	6	78481	78486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017379	AG	3	6	78555	78560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017379	AG	3	6	82994	82999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017379	AG	3	6	83021	83026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017379	AG	3	6	91364	91369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017379	AT	3	6	91410	91415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017379	TA	3	6	94687	94692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017379	GT	3	6	96761	96766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017379	GA	3	6	98360	98365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017379	CT	3	6	113537	113542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017379	CA	3	6	129724	129729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017379	AG	3	6	130691	130696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017379	TA	3	6	130730	130735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017379	CT	3	6	131697	131702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017379	TG	3	6	158851	158856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017379	TC	3	6	162267	162272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017379	AC	3	6	171572	171577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017379	AG	3	6	182685	182690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017379	AG	3	6	183158	183163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017379	TG	3	6	183178	183183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017379	TC	3	6	183957	183962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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39	NC_017379	AT	3	6	208412	208417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017379	TG	3	6	220755	220760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017379	AG	3	6	227073	227078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017379	GT	3	6	228455	228460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017379	AT	3	6	260719	260724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017379	AG	3	6	297965	297970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017379	AG	3	6	328682	328687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017379	AG	3	6	338094	338099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017379	GA	3	6	339424	339429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017379	GA	3	6	339645	339650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017379	CT	3	6	356343	356348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017379	AT	3	6	356451	356456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017379	AT	3	6	375360	375365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017379	AG	3	6	377043	377048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017379	AG	3	6	378496	378501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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57	NC_017379	GC	3	6	439433	439438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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59	NC_017379	AT	4	8	454121	454128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017379	AC	3	6	455016	455021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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62	NC_017379	AG	3	6	467920	467925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017379	TA	3	6	469002	469007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017379	GA	3	6	489000	489005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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67	NC_017379	CA	3	6	505331	505336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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69	NC_017379	AG	5	10	523146	523155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017379	AG	3	6	523173	523178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017379	TG	3	6	524025	524030	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017379	GT	3	6	524541	524546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017379	CT	3	6	525513	525518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017379	GT	3	6	525552	525557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017379	GA	3	6	526209	526214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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79	NC_017379	AC	3	6	548443	548448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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81	NC_017379	AC	3	6	553937	553942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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109	NC_017379	CT	3	6	769422	769427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017379	GA	3	6	784731	784736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017379	TC	3	6	789637	789642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017379	CT	3	6	795363	795368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017379	TA	3	6	797458	797463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017379	TC	3	6	799540	799545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017379	CT	3	6	808418	808423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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119	NC_017379	TG	3	6	853221	853226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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121	NC_017379	GA	3	6	874414	874419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_017379	CA	4	8	892728	892735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017379	TC	3	6	892820	892825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017379	AG	3	6	892875	892880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_017379	AT	3	6	896359	896364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.