MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Puno135 chromosome

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017379	TTTTA	2	10	4899	4908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017379	GCTTT	2	10	13332	13341	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017379	ATGAA	2	10	24857	24866	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017379	TTAAA	2	10	57404	57413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017379	ACAAA	2	10	57433	57442	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017379	TATCT	2	10	69769	69778	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017379	CAAAA	2	10	70906	70915	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017379	TTTTA	2	10	73855	73864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017379	TTACA	2	10	75740	75749	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017379	TTTGT	2	10	78517	78526	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017379	TAAGA	2	10	89243	89252	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017379	TAAAA	2	10	89314	89323	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017379	GGCTT	2	10	93707	93716	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017379	AATTT	2	10	98389	98398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017379	AAAAT	2	10	105046	105055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017379	TTAAT	2	10	113505	113514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017379	TTTAG	2	10	125148	125157	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017379	CAAAT	2	10	152907	152916	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017379	AACAA	2	10	160165	160174	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017379	AAATC	2	10	174484	174493	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017379	TTTAA	2	10	177529	177538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017379	AAGAG	2	10	184055	184064	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017379	TCATT	2	10	200682	200691	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017379	AAACA	2	10	201654	201663	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017379	TGCTA	2	10	208550	208559	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017379	AAGCG	2	10	220314	220323	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017379	AACAG	2	10	222147	222156	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017379	CTTAA	2	10	227008	227017	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017379	AAATT	2	10	245111	245120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017379	AAAAT	2	10	250309	250318	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017379	ATCGT	2	10	250619	250628	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017379	CAATC	2	10	254208	254217	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017379	AAATA	2	10	272877	272886	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017379	GTTTT	2	10	278487	278496	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017379	TTATA	2	10	321727	321736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017379	AAGTT	2	10	328612	328621	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017379	CTCTC	2	10	339273	339282	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_017379	TCAAA	2	10	339570	339579	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017379	AAAGG	2	10	420052	420061	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017379	TTAAT	2	10	421662	421671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017379	CCTTG	2	10	426466	426475	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017379	ATAAA	2	10	431839	431848	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017379	AAAAT	2	10	431873	431882	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017379	GTTTT	2	10	439933	439942	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017379	TAACA	2	10	452709	452718	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017379	AATAA	2	10	454101	454110	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017379	TAAAA	2	10	454195	454204	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017379	TTTGA	2	10	454295	454304	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017379	AAAAT	2	10	458828	458837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017379	TATCC	2	10	469094	469103	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017379	AGTTT	2	10	477181	477190	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017379	TAACT	2	10	481515	481524	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017379	AGGCT	2	10	489821	489830	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017379	TAAAA	2	10	495556	495565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017379	GCATT	2	10	537741	537750	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017379	CTATA	2	10	537924	537933	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017379	TTAAA	2	10	544238	544247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017379	ATTTT	2	10	544316	544325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017379	AACGA	2	10	562191	562200	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017379	TAAGG	2	10	583772	583781	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017379	ATTTT	2	10	583999	584008	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017379	CAACA	2	10	590861	590870	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017379	ATTTT	2	10	590993	591002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017379	TTTAA	2	10	615839	615848	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017379	ATTGC	2	10	632722	632731	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017379	TTTAA	2	10	639522	639531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017379	ATTTT	2	10	676784	676793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017379	TGTTT	2	10	684772	684781	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017379	TAAAT	2	10	689448	689457	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017379	AAAAC	2	10	695301	695310	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017379	TTCTA	2	10	705834	705843	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017379	AAGAT	2	10	715956	715965	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017379	ATTTA	2	10	725773	725782	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017379	ACCAC	2	10	726261	726270	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_017379	TATAG	2	10	727605	727614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017379	TTCTA	2	10	738098	738107	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017379	CATGA	2	10	750059	750068	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017379	TCTTT	2	10	762788	762797	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017379	TTTTA	2	10	780444	780453	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017379	TTTTA	2	10	789673	789682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017379	CGTTG	2	10	808089	808098	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017379	ATTAA	2	10	828779	828788	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017379	TTTTA	2	10	836220	836229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017379	TTTTA	2	10	853676	853685	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017379	TTTAA	2	10	872811	872820	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017379	ATTTT	2	10	877493	877502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017379	CAATC	2	10	881403	881412	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017379	TTTTC	2	10	881758	881767	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017379	CTAAA	2	10	882696	882705	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017379	TATAA	2	10	885152	885161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017379	TGTAT	2	10	892404	892413	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017379	ATAAA	2	10	893498	893507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017379	ATAAA	2	10	893651	893660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017379	GAAAA	2	10	900472	900481	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017379	TCGTA	2	10	903215	903224	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017379	TAAAA	2	10	906711	906720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017379	GCGTG	2	10	915169	915178	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017379	TCAAG	2	10	938106	938115	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017379	CGATA	2	10	947966	947975	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017379	TTATT	2	10	951250	951259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017379	TCTCA	2	10	999097	999106	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017379	ATGAA	2	10	1015001	1015010	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017379	TGCTA	2	10	1015536	1015545	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017379	AAGAC	2	10	1017863	1017872	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017379	TTTTC	2	10	1018199	1018208	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017379	ACCCT	2	10	1018249	1018258	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_017379	CATGA	2	10	1018403	1018412	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017379	AATTT	2	10	1018595	1018604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017379	GTTTT	2	10	1021445	1021454	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017379	GATTT	2	10	1030198	1030207	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017379	TTAAA	2	10	1032134	1032143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017379	AATTA	2	10	1032286	1032295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017379	CAAAT	2	10	1034482	1034491	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017379	TAATT	2	10	1038836	1038845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017379	AAAGC	2	10	1040026	1040035	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017379	TTTCA	2	10	1040889	1040898	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017379	TTTAA	2	10	1043244	1043253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017379	CTACA	2	10	1043309	1043318	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017379	TAATG	2	10	1052680	1052689	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017379	TAAAG	2	10	1053730	1053739	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017379	CAATA	2	10	1059242	1059251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017379	TATCT	2	10	1060574	1060583	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017379	TTCAA	2	10	1061692	1061701	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017379	TCACT	2	10	1063400	1063409	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017379	TACTT	2	10	1063699	1063708	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017379	AGCGA	2	10	1067812	1067821	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017379	AACGA	2	10	1067912	1067921	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017379	ATTTA	2	10	1068499	1068508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017379	CAACA	2	10	1069205	1069214	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017379	AAAAT	2	10	1090065	1090074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017379	TGCAA	2	10	1106821	1106830	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017379	AATTG	2	10	1113805	1113814	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017379	ATAAA	2	10	1117868	1117877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017379	TAAAA	2	10	1128874	1128883	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017379	TGAAA	2	10	1143474	1143483	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017379	AAATC	2	10	1158842	1158851	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017379	AAAAC	2	10	1163686	1163695	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017379	ATTTT	2	10	1173310	1173319	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017379	TTCAT	2	10	1174711	1174720	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017379	GATTT	2	10	1193184	1193193	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017379	AATTT	2	10	1193220	1193229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017379	AAAAC	2	10	1193940	1193949	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017379	CACGA	2	10	1194645	1194654	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017379	TTACC	2	10	1195443	1195452	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017379	TTAAA	2	10	1203922	1203931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017379	TAAAA	2	10	1216005	1216014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.