MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Puno120 chromosome

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017378	GTTTT	2	10	2427	2436	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017378	GAAAC	2	10	4649	4658	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017378	TTTTA	2	10	4922	4931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017378	GCTTT	2	10	13336	13345	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017378	ATGAA	2	10	24910	24919	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017378	CGTTT	2	10	49042	49051	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017378	TAAAA	2	10	49355	49364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017378	TGCTT	2	10	49454	49463	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017378	TTAAA	2	10	55186	55195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017378	ACAAA	2	10	55215	55224	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017378	AAAGA	2	10	55809	55818	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017378	TATCC	2	10	58712	58721	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017378	TTTTA	2	10	71466	71475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017378	AAAAC	2	10	76192	76201	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017378	ATAAA	2	10	86699	86708	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017378	TAAGA	2	10	86736	86745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017378	GGCTT	2	10	91488	91497	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017378	AATTT	2	10	96167	96176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017378	AAAAT	2	10	104467	104476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017378	ATTTT	2	10	104495	104504	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017378	AAAAT	2	10	106313	106322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017378	TTTAT	2	10	108792	108801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017378	TTAAT	2	10	115020	115029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017378	CAATC	2	10	124169	124178	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017378	TTTAG	2	10	128053	128062	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017378	CAAAT	2	10	156045	156054	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017378	CAAAA	2	10	163301	163310	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017378	TTTAA	2	10	180266	180275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017378	AGAGG	2	10	186894	186903	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017378	AAACA	2	10	204678	204687	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017378	AACAG	2	10	224813	224822	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017378	CTTAA	2	10	229682	229691	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017378	TTGAA	2	10	229824	229833	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017378	CAAAA	2	10	238466	238475	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017378	AAATT	2	10	247812	247821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017378	CAATC	2	10	256904	256913	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017378	AAATA	2	10	273794	273803	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017378	GTTTT	2	10	279407	279416	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017378	TCGGT	2	10	289285	289294	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017378	TTATA	2	10	291804	291813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017378	TTTAA	2	10	292881	292890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017378	AGCGT	2	10	295968	295977	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017378	TTATA	2	10	322715	322724	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017378	AAGTT	2	10	329476	329485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017378	CTCTC	2	10	339574	339583	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_017378	TCAAA	2	10	339864	339873	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017378	AATAA	2	10	361159	361168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017378	TCAAA	2	10	362168	362177	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017378	AACTC	2	10	362831	362840	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017378	AAAGA	2	10	396999	397008	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017378	GCATC	2	10	402384	402393	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017378	AATCA	2	10	404791	404800	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017378	AAAGG	2	10	417516	417525	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017378	TTAAT	2	10	419127	419136	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017378	CCTTG	2	10	423890	423899	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017378	ATAAA	2	10	429249	429258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017378	AAAAT	2	10	429283	429292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017378	GTTTT	2	10	437348	437357	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017378	TAACA	2	10	450089	450098	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017378	CTATT	2	10	451441	451450	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017378	TAAAA	2	10	451569	451578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017378	AAAAT	2	10	456207	456216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017378	AAAAT	2	10	458447	458456	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017378	TATCC	2	10	466465	466474	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017378	AGTTT	2	10	474505	474514	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017378	GCTTT	2	10	478044	478053	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017378	TAACT	2	10	478834	478843	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017378	AGGCT	2	10	487156	487165	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017378	TTTAT	2	10	492608	492617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017378	TAAAA	2	10	492887	492896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017378	ATTTA	2	10	518678	518687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017378	ATAAA	2	10	521280	521289	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017378	CTATC	2	10	532511	532520	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017378	GCATT	2	10	534960	534969	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017378	ATTTT	2	10	541445	541454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017378	TTGTA	2	10	545419	545428	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017378	TAAGG	2	10	581025	581034	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017378	TCAAT	2	10	591090	591099	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017378	TTTTA	2	10	591187	591196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017378	TCTAT	2	10	591242	591251	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017378	TTTAA	2	10	613165	613174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017378	TTTAA	2	10	636820	636829	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017378	GTTTT	2	10	662600	662609	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017378	TTAAT	2	10	665807	665816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017378	AAACA	2	10	670473	670482	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017378	CTTTT	2	10	671612	671621	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017378	ATTTT	2	10	678650	678659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017378	ATTAA	2	10	717148	717157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017378	ATTTA	2	10	722850	722859	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017378	TATAG	2	10	724702	724711	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017378	TCTTT	2	10	759700	759709	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017378	TTTTA	2	10	775734	775743	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017378	TTTTA	2	10	784964	784973	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017378	CGTTG	2	10	802725	802734	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017378	GCTTT	2	10	807244	807253	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017378	ATTAA	2	10	823577	823586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017378	TTAAA	2	10	831303	831312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017378	TTTAA	2	10	864071	864080	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017378	ATTTT	2	10	868792	868801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017378	GCTCA	2	10	872997	873006	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017378	TATAA	2	10	878106	878115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017378	ATAAA	2	10	886431	886440	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017378	ATTGG	2	10	892957	892966	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017378	GAAAA	2	10	893227	893236	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017378	TCGTA	2	10	895978	895987	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017378	TAAAA	2	10	899468	899477	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017378	GCGTG	2	10	907463	907472	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017378	TCAAG	2	10	930609	930618	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017378	GCGAT	2	10	939016	939025	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017378	AAGCA	2	10	951939	951948	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017378	GTTTT	2	10	964332	964341	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017378	TACCC	2	10	987753	987762	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
113	NC_017378	TGCTT	2	10	988250	988259	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017378	AAACC	2	10	992845	992854	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017378	ATGAA	2	10	1005106	1005115	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017378	TAAAT	2	10	1009628	1009637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017378	AATTT	2	10	1011199	1011208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017378	TTCAA	2	10	1013100	1013109	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017378	TCACT	2	10	1014808	1014817	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017378	TACTT	2	10	1015106	1015115	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017378	TATCG	2	10	1018308	1018317	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017378	ACCCT	2	10	1023192	1023201	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
123	NC_017378	ATAAA	2	10	1023236	1023245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017378	TGGAT	2	10	1023765	1023774	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017378	AAAAT	2	10	1038911	1038920	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017378	CCAAC	2	10	1046618	1046627	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_017378	AATTG	2	10	1056281	1056290	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017378	AATAA	2	10	1058036	1058045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017378	ATAAA	2	10	1060342	1060351	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017378	TAAAA	2	10	1071348	1071357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017378	TGAAA	2	10	1085673	1085682	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017378	TTATT	2	10	1088571	1088580	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017378	AAATC	2	10	1101080	1101089	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017378	AAAAC	2	10	1105925	1105934	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017378	ATTTT	2	10	1115579	1115588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017378	AAAAC	2	10	1116699	1116708	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017378	TTCAT	2	10	1116979	1116988	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017378	GATTT	2	10	1135590	1135599	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017378	AAACA	2	10	1136028	1136037	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017378	AAACA	2	10	1136326	1136335	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017378	CACGA	2	10	1136906	1136915	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017378	TTACC	2	10	1137704	1137713	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017378	ATACA	2	10	1138166	1138175	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017378	TTAAA	2	10	1146132	1146141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017378	TTAAT	2	10	1172866	1172875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017378	TATTT	2	10	1172902	1172911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017378	TTGTG	2	10	1172934	1172943	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.