MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 83 chromosome

Total Repeats: 479

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017375	ATGC	2	8	4284	4291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017375	ATAA	2	8	9643	9650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017375	ATTC	2	8	9846	9853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017375	TTAA	2	8	13658	13665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017375	ATTA	2	8	25245	25252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017375	GAGC	2	8	25667	25674	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017375	TGAA	2	8	25716	25723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017375	AGCG	2	8	30979	30986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017375	GTTA	2	8	55308	55315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017375	AGCC	2	8	57341	57348	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017375	TGAA	2	8	57431	57438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017375	TAGA	2	8	57459	57466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017375	TTCT	2	8	57503	57510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017375	TTTA	2	8	61524	61531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017375	TAAA	2	8	61560	61567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017375	AAAG	2	8	65624	65631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017375	TTCA	2	8	65768	65775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017375	TTAA	2	8	67405	67412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017375	TAAT	2	8	72633	72640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017375	ACTA	2	8	73465	73472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017375	CTAA	2	8	73487	73494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017375	CTGA	2	8	73508	73515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017375	CGAG	2	8	74321	74328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017375	TTAG	2	8	80206	80213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017375	AATA	2	8	80241	80248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017375	AACA	2	8	80422	80429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017375	AGAT	2	8	81515	81522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017375	AACT	2	8	81599	81606	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017375	CTCA	2	8	89680	89687	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017375	TAAG	2	8	89734	89741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017375	TAAT	2	8	91653	91660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017375	AAAG	2	8	99751	99758	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017375	TATT	2	8	115870	115877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017375	TTTA	2	8	119753	119760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017375	CATG	2	8	119896	119903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017375	TTTA	2	8	121426	121433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017375	CCAA	2	8	121434	121441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017375	AAAG	2	8	121448	121455	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017375	TCTA	2	8	121499	121506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017375	GTTT	2	8	121596	121603	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017375	TTTG	2	8	127044	127051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017375	TCAA	2	8	132292	132299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017375	GGTG	2	8	134225	134232	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017375	TCCC	2	8	134295	134302	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017375	TAAA	2	8	137282	137289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017375	CTAA	2	8	139014	139021	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017375	TTCA	2	8	140003	140010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017375	TTTA	2	8	140030	140037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017375	ATCA	2	8	148293	148300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017375	AATA	2	8	148467	148474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017375	AAGC	2	8	153153	153160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017375	CCGC	2	8	153176	153183	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_017375	CTTT	2	8	155079	155086	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017375	AAAT	2	8	155089	155096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017375	ATTT	2	8	156621	156628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017375	TCAT	2	8	161323	161330	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017375	CATC	2	8	165776	165783	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017375	CATT	2	8	167307	167314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017375	TATC	2	8	169771	169778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017375	TTAG	2	8	169911	169918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017375	AAAG	2	8	172816	172823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017375	AAAG	2	8	173311	173318	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017375	GAAG	2	8	173368	173375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017375	AATT	2	8	174433	174440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017375	AATC	2	8	174546	174553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017375	AAAC	2	8	177005	177012	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017375	ATTT	2	8	179875	179882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017375	TCTT	2	8	181319	181326	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017375	GTGG	2	8	181571	181578	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017375	CAAA	2	8	181660	181667	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017375	AAAT	2	8	185156	185163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017375	TAAG	2	8	185222	185229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017375	GAGC	2	8	203770	203777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017375	TGAA	2	8	205070	205077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017375	TCAA	2	8	205112	205119	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017375	TTGA	2	8	213837	213844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017375	GAAT	2	8	216380	216387	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017375	GCGT	2	8	219049	219056	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017375	GATT	2	8	222089	222096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017375	CGCT	2	8	222208	222215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017375	CATT	2	8	227301	227308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017375	TTTG	2	8	227320	227327	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017375	TTCA	2	8	229144	229151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017375	TAAG	2	8	239515	239522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017375	TTAG	2	8	242684	242691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017375	CTTT	2	8	242699	242706	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017375	CTAG	2	8	242733	242740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017375	TCTT	2	8	245444	245451	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017375	AATG	2	8	252169	252176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017375	GTTT	2	8	253216	253223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017375	TTGA	2	8	253231	253238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017375	ACAA	2	8	253290	253297	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017375	AAAG	2	8	253388	253395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017375	TATT	2	8	262305	262312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017375	CGCT	2	8	268263	268270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017375	ACTC	2	8	268440	268447	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017375	TTAG	2	8	268668	268675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017375	AAAT	2	8	268711	268718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017375	TGAT	2	8	268776	268783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017375	TTAT	2	8	278030	278037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017375	TAAT	2	8	294593	294600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017375	AAAG	2	8	294638	294645	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017375	GATT	2	8	304038	304045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017375	TATT	2	8	304106	304113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017375	TTGA	2	8	304211	304218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017375	TCAA	2	8	344128	344135	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017375	AAGG	2	8	345180	345187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017375	AACA	2	8	347762	347769	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017375	TTAA	2	8	348621	348628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017375	TCCT	2	8	348690	348697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017375	TGAG	2	8	365650	365657	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017375	TTGG	2	8	368365	368372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017375	AAAT	2	8	376658	376665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017375	AATC	2	8	382576	382583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017375	TGTT	2	8	383239	383246	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017375	CAAT	2	8	384964	384971	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017375	TGAA	2	8	389277	389284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017375	CTAA	2	8	389285	389292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017375	TTGA	2	8	398143	398150	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017375	GCAT	2	8	398542	398549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017375	TAAA	2	8	399432	399439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017375	CAAT	2	8	410822	410829	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017375	TTAA	2	8	410968	410975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017375	TAAA	2	8	410979	410986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017375	TTTA	2	8	420552	420559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017375	TTGT	2	8	420813	420820	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017375	TTCG	2	8	420838	420845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017375	ATCT	2	8	420859	420866	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017375	CTTT	2	8	420876	420883	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017375	TTTC	2	8	420943	420950	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017375	CAAA	2	8	420998	421005	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017375	GTTT	2	8	428026	428033	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017375	AAGT	2	8	428126	428133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017375	TTTC	2	8	432362	432369	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017375	GGGT	2	8	434253	434260	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017375	GAAA	2	8	434310	434317	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017375	AACA	2	8	434323	434330	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017375	GGGA	2	8	447100	447107	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017375	CCAA	2	8	448494	448501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017375	TCAA	2	8	466544	466551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017375	TTAA	2	8	466617	466624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017375	CACC	2	8	481794	481801	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_017375	TATC	2	8	496145	496152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017375	TTGA	2	8	497703	497710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017375	GATT	2	8	512710	512717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017375	CACC	2	8	513809	513816	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
147	NC_017375	TTGG	2	8	513972	513979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017375	AATT	2	8	514002	514009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017375	TTAT	2	8	514846	514853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017375	TCTT	2	8	517971	517978	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_017375	CAAT	2	8	522579	522586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.