MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 2017 chromosome

Total Repeats: 225

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017374	AG	3	6	9649	9654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017374	AG	3	6	9709	9714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017374	GC	3	6	10107	10112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017374	AG	3	6	10535	10540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017374	AG	3	6	10545	10550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017374	CA	3	6	14591	14596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017374	GT	3	6	23271	23276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017374	TA	3	6	25236	25241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017374	AG	3	6	27048	27053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017374	GC	3	6	27124	27129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017374	AG	3	6	38323	38328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017374	AG	3	6	62701	62706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017374	AG	3	6	70329	70334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017374	TA	5	10	76720	76729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017374	TC	3	6	78900	78905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017374	AG	3	6	83422	83427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017374	GA	3	6	91812	91817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017374	AG	3	6	91892	91897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017374	TA	3	6	95387	95392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017374	AG	3	6	96535	96540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017374	GT	3	6	97308	97313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017374	AT	3	6	102129	102134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017374	GA	3	6	105588	105593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017374	AG	3	6	107583	107588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017374	AG	3	6	110372	110377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017374	GA	3	6	110768	110773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017374	CT	3	6	122833	122838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017374	TC	3	6	129172	129177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017374	CT	3	6	132225	132230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017374	GC	3	6	135477	135482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017374	AG	3	6	152106	152111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017374	TC	3	6	163279	163284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017374	AT	3	6	172335	172340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017374	AC	3	6	172659	172664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017374	CT	3	6	175305	175310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017374	GT	3	6	175347	175352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017374	AG	3	6	184208	184213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017374	CT	3	6	184243	184248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017374	TA	3	6	199520	199525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017374	TA	3	6	199572	199577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017374	AT	3	6	210206	210211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017374	GC	3	6	210559	210564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017374	TG	3	6	222606	222611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017374	GA	3	6	222623	222628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017374	GT	3	6	228697	228702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017374	AG	3	6	234641	234646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017374	AC	3	6	235053	235058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017374	GA	3	6	247953	247958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017374	CG	3	6	248007	248012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017374	GA	3	6	288233	288238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017374	AG	3	6	298575	298580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017374	GA	3	6	302351	302356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017374	AC	3	6	312474	312479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017374	AG	3	6	329648	329653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017374	AG	3	6	338154	338159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017374	TA	3	6	369883	369888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017374	AT	3	6	371786	371791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017374	AG	3	6	373478	373483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017374	GA	4	8	383433	383440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017374	GT	3	6	406070	406075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017374	AT	3	6	421917	421922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017374	TA	3	6	434709	434714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017374	GC	3	6	434801	434806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017374	GT	3	6	461552	461557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017374	AG	3	6	461570	461575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017374	TA	3	6	462660	462665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017374	TG	3	6	466550	466555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017374	TG	3	6	487033	487038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017374	AT	3	6	500678	500683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017374	AT	3	6	500752	500757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017374	AT	3	6	504992	504997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017374	GA	3	6	512126	512131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017374	AG	4	8	512401	512408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017374	GA	3	6	514007	514012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017374	AG	3	6	514031	514036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017374	TG	3	6	515528	515533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017374	AC	3	6	515789	515794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017374	TG	3	6	515952	515957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017374	GA	3	6	516100	516105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017374	AT	3	6	522066	522071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017374	TG	3	6	522076	522081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017374	CT	4	8	526348	526355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017374	CT	3	6	527661	527666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017374	GT	3	6	528061	528066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017374	AG	3	6	531902	531907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017374	TC	3	6	532402	532407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017374	GA	4	8	539098	539105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017374	TA	3	6	543286	543291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017374	CA	3	6	547958	547963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017374	TA	3	6	556491	556496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017374	CT	4	8	573270	573277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017374	AT	3	6	575032	575037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017374	AT	3	6	581556	581561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017374	AT	3	6	581605	581610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017374	CT	3	6	581719	581724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017374	GT	3	6	582153	582158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017374	AT	3	6	582170	582175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017374	TA	3	6	592479	592484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017374	TA	3	6	602667	602672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017374	TC	3	6	602878	602883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017374	AG	3	6	616912	616917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017374	CG	3	6	629564	629569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017374	TA	3	6	646031	646036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017374	CT	3	6	679347	679352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017374	TA	3	6	686504	686509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017374	AC	3	6	689591	689596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017374	CA	3	6	692653	692658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017374	AG	3	6	693930	693935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017374	TA	3	6	705786	705791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017374	AG	3	6	705861	705866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017374	TC	3	6	705928	705933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017374	AG	3	6	706179	706184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017374	CT	3	6	706341	706346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017374	CT	3	6	712021	712026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017374	TA	3	6	712107	712112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017374	AT	3	6	727754	727759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017374	GC	3	6	729054	729059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017374	GA	3	6	732930	732935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017374	GT	3	6	737360	737365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017374	TA	3	6	738728	738733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017374	AG	3	6	749520	749525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017374	TC	3	6	758544	758549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017374	AT	3	6	759821	759826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017374	GA	3	6	761171	761176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017374	GA	3	6	775459	775464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017374	TC	3	6	780363	780368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017374	TC	3	6	789162	789167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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131	NC_017374	TA	3	6	868770	868775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017374	AT	3	6	882537	882542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017374	CT	3	6	883328	883333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017374	AG	3	6	885707	885712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017374	AT	3	6	909093	909098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017374	AG	3	6	934144	934149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017374	AG	3	6	934223	934228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017374	TA	3	6	936032	936037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017374	CT	3	6	944464	944469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_017374	GA	3	6	977169	977174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.