MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 2017 chromosome

Total Repeats: 203

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017374	TCATT	2	10	4955	4964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017374	TTTTG	2	10	9840	9849	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017374	GCTTT	2	10	11505	11514	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017374	CTTTA	2	10	23223	23232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017374	AGCCT	2	10	23798	23807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017374	TTTTA	2	10	26909	26918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017374	GATAA	2	10	48350	48359	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017374	AACGA	2	10	57502	57511	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017374	TTAAA	2	10	57514	57523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017374	ACAAA	2	10	57542	57551	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017374	TGATA	2	10	57856	57865	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017374	AAGCC	2	10	58316	58325	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017374	CAAAA	2	10	70194	70203	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017374	TTACA	2	10	75059	75068	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017374	TAAAA	2	10	76742	76751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017374	TAAGA	2	10	89739	89748	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017374	ATTAT	2	10	89795	89804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017374	ATAAA	2	10	96414	96423	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017374	GAATG	2	10	110330	110339	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017374	GATTT	2	10	114598	114607	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017374	CCATA	2	10	122510	122519	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017374	ATTTT	2	10	130414	130423	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017374	AATAA	2	10	132640	132649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017374	ATAAA	2	10	137050	137059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017374	AGAGC	2	10	137513	137522	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017374	CAAAT	2	10	154037	154046	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017374	TTGAA	2	10	161308	161317	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017374	AATAT	2	10	172394	172403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017374	TTTCC	2	10	172446	172455	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017374	GAATG	2	10	172532	172541	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017374	TTTCT	2	10	175412	175421	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017374	AAATC	2	10	175756	175765	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017374	TTTAA	2	10	178807	178816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017374	TTCAA	2	10	191943	191952	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017374	AAACA	2	10	203443	203452	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017374	TAAGA	2	10	210432	210441	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017374	ATTTT	2	10	213704	213713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017374	TTTAG	2	10	222539	222548	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017374	AAAAC	2	10	222567	222576	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017374	CTTAA	2	10	227238	227247	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017374	TTTTA	2	10	228561	228570	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017374	ATTTA	2	10	232759	232768	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017374	CTAAC	2	10	235024	235033	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017374	AATTT	2	10	278911	278920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017374	AACAT	2	10	301282	301291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017374	GTGGG	2	10	312444	312453	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017374	TTTTA	2	10	329581	329590	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017374	ATTAA	2	10	335412	335421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017374	AATAA	2	10	339208	339217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017374	AATAA	2	10	339220	339229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017374	TAAAA	2	10	343463	343472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017374	TAAAA	2	10	355251	355260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017374	TAAAA	2	10	364238	364247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017374	TAGTG	2	10	402318	402327	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017374	TAAAG	2	10	415226	415235	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017374	ATAAA	2	10	427202	427211	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017374	AAAAT	2	10	427236	427245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017374	AAAAT	2	10	436299	436308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017374	TAACA	2	10	447468	447477	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017374	ATTAA	2	10	448854	448863	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017374	TAAAA	2	10	448952	448961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017374	TTTGA	2	10	449053	449062	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017374	AAAAT	2	10	453684	453693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017374	AGTAA	2	10	462850	462859	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017374	AAAAC	2	10	466041	466050	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017374	TAACT	2	10	472165	472174	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017374	AGGCT	2	10	481522	481531	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017374	ATTTT	2	10	487917	487926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017374	TAAAA	2	10	488122	488131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017374	CTGAT	2	10	500976	500985	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017374	GTTTT	2	10	516319	516328	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017374	ATACC	2	10	528088	528097	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017374	AAATT	2	10	531844	531853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017374	GAGTT	2	10	532468	532477	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017374	TTTAA	2	10	533267	533276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017374	ATTTT	2	10	534792	534801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017374	TTGTA	2	10	539024	539033	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017374	TATAA	2	10	547885	547894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017374	AAAAG	2	10	548005	548014	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017374	ACTCT	2	10	563489	563498	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017374	TAAGG	2	10	575164	575173	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017374	ATTTT	2	10	582390	582399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017374	TTTAA	2	10	606405	606414	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017374	TTTAA	2	10	616836	616845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017374	ATTTT	2	10	671506	671515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017374	TTGTA	2	10	671522	671531	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017374	AAATC	2	10	678701	678710	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017374	CTTAT	2	10	681080	681089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017374	GTTTT	2	10	699996	700005	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017374	TCTAT	2	10	700084	700093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017374	CTTTT	2	10	705884	705893	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017374	GGAAT	2	10	709390	709399	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017374	ATTTA	2	10	720830	720839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017374	AAAAT	2	10	738789	738798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017374	TCTTT	2	10	753373	753382	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017374	TCTCT	2	10	759834	759843	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017374	GGTTT	2	10	775833	775842	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017374	TTTTA	2	10	780400	780409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017374	AATAA	2	10	786326	786335	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017374	TTCTT	2	10	794155	794164	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017374	TAAGA	2	10	816981	816990	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017374	CAAGC	2	10	827857	827866	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017374	TATTT	2	10	828450	828459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017374	ATAAA	2	10	828652	828661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017374	TTTAA	2	10	858963	858972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017374	AAAGA	2	10	861951	861960	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017374	ATTTT	2	10	863675	863684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017374	ATTAA	2	10	884607	884616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017374	TTTGT	2	10	885329	885338	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017374	TTTTA	2	10	885511	885520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017374	ATAAA	2	10	887903	887912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017374	TAAAA	2	10	894227	894236	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017374	ATGAT	2	10	902545	902554	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017374	TTTGT	2	10	907169	907178	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017374	TCAAG	2	10	926333	926342	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017374	TATTT	2	10	937949	937958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017374	GATTG	2	10	937987	937996	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017374	TGATT	2	10	939530	939539	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017374	GATTT	2	10	944226	944235	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017374	AAACA	2	10	947169	947178	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017374	TTACT	2	10	958475	958484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017374	CAATA	2	10	979634	979643	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017374	TTTTA	2	10	991195	991204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017374	TTAAA	2	10	991218	991227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017374	TTTTA	2	10	992741	992750	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017374	ATTTT	2	10	992760	992769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017374	TTCAA	2	10	994324	994333	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017374	CTCAT	2	10	994554	994563	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017374	TCACT	2	10	996033	996042	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017374	TACTT	2	10	996332	996341	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017374	TTAAT	2	10	999173	999182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017374	AAAAT	2	10	1019320	1019329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017374	TAAAA	2	10	1050920	1050929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017374	AAAAT	2	10	1052098	1052107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017374	AACTT	2	10	1052114	1052123	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017374	TTTTG	2	10	1054174	1054183	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017374	TGAAA	2	10	1065377	1065386	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017374	ATTTA	2	10	1065445	1065454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017374	GATTA	2	10	1065722	1065731	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017374	TAAGT	2	10	1076934	1076943	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017374	ATAAA	2	10	1085490	1085499	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017374	TAAAA	2	10	1090180	1090189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017374	AAAAC	2	10	1096560	1096569	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017374	CACGA	2	10	1116530	1116539	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017374	TTACC	2	10	1117328	1117337	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017374	TTTTG	2	10	1117596	1117605	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017374	CCAAT	2	10	1118015	1118024	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_017374	TTAAA	2	10	1124547	1124556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_017374	TCAAA	2	10	1524279	1524288	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_017374	CTTTT	2	10	1526764	1526773	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
199	NC_017374	TAAAA	2	10	1527773	1527782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_017374	AATTC	2	10	1538232	1538241	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.