MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori India7 chromosome

Total Repeats: 4124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017372	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017372	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017372	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017372	TGG	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017372	GTG	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017372	ACC	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017372	GGT	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017372	A	7	7	4580	4586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017372	T	8	8	4600	4607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017372	AAT	2	6	4621	4626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017372	GAAAC	2	10	4650	4659	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017372	TGT	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017372	ATT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017372	A	6	6	4847	4852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017372	A	6	6	4863	4868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017372	ATTTT	2	10	4893	4902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017372	TTTTA	2	10	4926	4935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017372	TC	3	6	4971	4976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017372	A	7	7	5006	5012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017372	T	7	7	5017	5023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017372	A	6	6	5060	5065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017372	TCA	2	6	5082	5087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017372	A	6	6	5096	5101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017372	A	9	9	5110	5118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017372	AGAA	2	8	5131	5138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017372	A	6	6	5145	5150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017372	A	6	6	7233	7238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017372	GA	7	14	7272	7285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017372	T	6	6	7296	7301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017372	AAATT	2	10	7317	7326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017372	ATT	2	6	7374	7379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017372	T	13	13	7394	7406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017372	T	6	6	7438	7443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017372	TTTG	2	8	7449	7456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017372	GGT	2	6	7457	7462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017372	T	6	6	7525	7530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017372	TAAA	2	8	7566	7573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017372	A	7	7	7581	7587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017372	TAA	3	9	9275	9283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017372	ATAA	2	8	9674	9681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017372	TTA	2	6	9704	9709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017372	TAA	2	6	9764	9769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017372	ATT	2	6	9783	9788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017372	TA	3	6	9798	9803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017372	G	6	6	9841	9846	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017372	TTA	2	6	9849	9854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017372	TATT	2	8	9875	9882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017372	A	6	6	9913	9918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017372	AAAG	2	8	9925	9932	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017372	A	6	6	12718	12723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017372	T	7	7	12745	12751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017372	AGG	2	6	12752	12757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017372	GCTTT	2	10	13609	13618	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017372	T	6	6	13616	13621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017372	T	7	7	13678	13684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017372	ATA	2	6	13688	13693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017372	TTAA	2	8	13707	13714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017372	AGTT	2	8	16653	16660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017372	CA	3	6	16714	16719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017372	CTG	2	6	16735	16740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017372	A	6	6	16870	16875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017372	A	6	6	18309	18314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017372	AAACAC	2	12	18349	18360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017372	ATCA	2	8	22757	22764	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017372	TTTCTT	2	12	22999	23010	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017372	AAAAG	2	10	23067	23076	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017372	AAG	2	6	23084	23089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017372	C	6	6	23099	23104	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_017372	GATT	2	8	25234	25241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017372	GT	3	6	25263	25268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017372	TAAG	2	8	25272	25279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017372	ATTA	2	8	25330	25337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017372	A	10	10	25355	25364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017372	GTT	2	6	25426	25431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017372	A	7	7	25449	25455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017372	TGT	2	6	25485	25490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017372	TGCT	2	8	25636	25643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017372	T	6	6	25707	25712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017372	GTA	2	6	27024	27029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017372	TAT	2	6	27039	27044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017372	A	6	6	27050	27055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017372	T	6	6	27085	27090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017372	A	7	7	27128	27134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017372	TA	3	6	27148	27153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017372	T	6	6	28489	28494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017372	A	6	6	28521	28526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017372	T	6	6	31439	31444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017372	CAG	2	6	31478	31483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017372	GGTT	2	8	31526	31533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017372	AGC	2	6	31970	31975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017372	T	7	7	37211	37217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017372	T	6	6	37236	37241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017372	A	7	7	37269	37275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017372	TAA	2	6	40172	40177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017372	A	6	6	40182	40187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017372	AG	3	6	40192	40197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017372	CTT	2	6	43958	43963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017372	AG	4	8	43992	43999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017372	ATCT	2	8	44016	44023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017372	CTGT	2	8	44077	44084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017372	T	7	7	44147	44153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017372	CCA	2	6	44161	44166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017372	TTG	2	6	44188	44193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017372	TAG	2	6	44219	44224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017372	ACTTAG	2	12	44225	44236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017372	A	6	6	44244	44249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017372	AG	3	6	44262	44267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017372	A	6	6	44273	44278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017372	ATTAA	2	10	49607	49616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017372	TTTA	2	8	54716	54723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017372	TAA	2	6	54777	54782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017372	ATT	2	6	54824	54829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017372	ATT	2	6	54855	54860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017372	T	6	6	54888	54893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017372	TTAAA	2	10	54987	54996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017372	ACAAA	2	10	55015	55024	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017372	G	10	10	55267	55276	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017372	ATA	2	6	55277	55282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017372	AAC	2	6	55314	55319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017372	GTG	2	6	55362	55367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017372	C	11	11	55413	55423	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_017372	GAA	2	6	55448	55453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017372	AGA	2	6	55510	55515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017372	TC	3	6	55536	55541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017372	T	6	6	55556	55561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017372	A	6	6	55605	55610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017372	A	6	6	55625	55630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017372	AAG	2	6	55635	55640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017372	AGA	2	6	55657	55662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017372	AGAA	2	8	55681	55688	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017372	CTAG	2	8	55694	55701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017372	AGCT	2	8	55713	55720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017372	CTGA	2	8	55736	55743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017372	A	6	6	55743	55748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017372	AGAAAA	2	12	55764	55775	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017372	A	6	6	55839	55844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017372	ACA	2	6	59213	59218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017372	GAT	2	6	59482	59487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017372	A	6	6	64466	64471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017372	A	6	6	64480	64485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017372	CAAA	2	8	67849	67856	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017372	ACA	2	6	67864	67869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017372	TTG	2	6	67891	67896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017372	ATT	3	9	70570	70578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017372	AAAT	2	8	70581	70588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017372	TTA	2	6	70621	70626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017372	A	7	7	70677	70683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017372	TGG	2	6	70708	70713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017372	TTTTA	2	10	70784	70793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017372	TAGA	2	8	72648	72655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017372	CTT	2	6	72985	72990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017372	AGT	2	6	72998	73003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017372	TAT	2	6	73011	73016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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