MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori F16

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017368	CCCTA	2	10	2399	2408	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_017368	TTTGT	2	10	2428	2437	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017368	TTTTA	2	10	4902	4911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017368	GCTTT	2	10	13396	13405	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017368	GCATG	2	10	22705	22714	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017368	AAAAG	2	10	22852	22861	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017368	AAATC	2	10	25690	25699	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017368	AAATT	2	10	29995	30004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017368	TTAAA	2	10	72563	72572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017368	ACAAA	2	10	72580	72589	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017368	CAAAA	2	10	85523	85532	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017368	TTACA	2	10	90378	90387	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017368	AATTT	2	10	113997	114006	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017368	CAAAA	2	10	120689	120698	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017368	TTAAT	2	10	129539	129548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017368	CAAAT	2	10	169361	169370	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017368	ATTTA	2	10	175225	175234	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017368	ATAAA	2	10	176550	176559	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017368	CAAAA	2	10	176630	176639	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017368	TTTAA	2	10	192968	192977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017368	TTCAA	2	10	206102	206111	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017368	AAACA	2	10	217251	217260	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017368	TGCTA	2	10	224152	224161	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017368	TTGGT	2	10	224628	224637	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017368	AAGCG	2	10	236144	236153	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017368	AAACC	2	10	236553	236562	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017368	TAAAA	2	10	250583	250592	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017368	AAATT	2	10	261460	261469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017368	CATTT	2	10	277108	277117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017368	AAATA	2	10	289227	289236	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017368	GTTTT	2	10	294840	294849	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017368	TTATA	2	10	331079	331088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017368	AAGTT	2	10	337646	337655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017368	ATTAA	2	10	343478	343487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017368	TGTGT	2	10	345843	345852	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017368	AATCA	2	10	363992	364001	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017368	TTGAT	2	10	412667	412676	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017368	AAAGG	2	10	426441	426450	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017368	TTAAT	2	10	428052	428061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017368	ATAAA	2	10	438189	438198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017368	AAAAT	2	10	438223	438232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017368	GTTTT	2	10	446288	446297	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017368	AAAGC	2	10	451498	451507	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017368	TAACA	2	10	459108	459117	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017368	TACAA	2	10	459120	459129	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017368	AATAA	2	10	460497	460506	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017368	AAAAT	2	10	465220	465229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017368	AGAAA	2	10	471452	471461	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017368	AAAAT	2	10	496095	496104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017368	TTAAA	2	10	500791	500800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017368	TAAAA	2	10	523841	523850	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017368	TTTAA	2	10	532273	532282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017368	AAATA	2	10	532555	532564	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017368	ATAAA	2	10	580872	580881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017368	TGAGA	2	10	580907	580916	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017368	CCCAC	2	10	585351	585360	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
57	NC_017368	TGCAT	2	10	588500	588509	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017368	TAAAA	2	10	590149	590158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017368	TTTTA	2	10	599846	599855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017368	AAAGA	2	10	607621	607630	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017368	TACTA	2	10	642811	642820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017368	TAAAT	2	10	644666	644675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017368	TTGAC	2	10	650302	650311	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017368	TGGGT	2	10	650380	650389	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017368	TTTAA	2	10	650456	650465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017368	TATTT	2	10	650492	650501	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017368	AAAAC	2	10	651553	651562	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017368	CTTAT	2	10	702768	702777	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017368	TAAAT	2	10	705984	705993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017368	AAAAC	2	10	711830	711839	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017368	TTCTA	2	10	722357	722366	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017368	TAAAA	2	10	731079	731088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017368	GGAAT	2	10	731231	731240	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017368	TAAAA	2	10	737484	737493	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017368	ATTAA	2	10	737521	737530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017368	TTAAA	2	10	761176	761185	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017368	GTTTT	2	10	764657	764666	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017368	CCTTA	2	10	792501	792510	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017368	TACAA	2	10	828141	828150	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017368	ATTAA	2	10	833877	833886	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017368	AAAAC	2	10	850115	850124	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017368	TATTT	2	10	851989	851998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017368	TTAAA	2	10	854935	854944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017368	TTTTA	2	10	880679	880688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017368	TTGAA	2	10	880879	880888	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017368	AGCCT	2	10	886405	886414	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017368	AGTTA	2	10	895743	895752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017368	AAACT	2	10	900081	900090	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017368	CTAAA	2	10	904525	904534	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017368	TATAA	2	10	906982	906991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017368	CTTAA	2	10	918226	918235	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017368	AAAGA	2	10	918426	918435	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017368	AAAAG	2	10	918609	918618	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017368	ATTGA	2	10	920923	920932	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017368	TCGTA	2	10	923941	923950	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017368	TAAAA	2	10	927455	927464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017368	CCTAA	2	10	940170	940179	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017368	TCAAG	2	10	959327	959336	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017368	AAATT	2	10	996455	996464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017368	TTCAA	2	10	1018953	1018962	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017368	CTCAT	2	10	1019183	1019192	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017368	TCACT	2	10	1020662	1020671	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017368	TACTT	2	10	1020960	1020969	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017368	TAAAT	2	10	1021356	1021365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017368	AAAAT	2	10	1047239	1047248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017368	AATTG	2	10	1064569	1064578	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017368	ATAAA	2	10	1068662	1068671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017368	TAAAA	2	10	1079651	1079660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017368	TGAAA	2	10	1093993	1094002	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017368	AAATC	2	10	1109407	1109416	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017368	ATTAA	2	10	1114280	1114289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017368	TAGCG	2	10	1117406	1117415	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017368	CAAAG	2	10	1118078	1118087	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017368	AAAAC	2	10	1124637	1124646	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017368	GATTT	2	10	1143520	1143529	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017368	AATTT	2	10	1143556	1143565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017368	CACGA	2	10	1144781	1144790	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017368	TTACC	2	10	1145579	1145588	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017368	TTTTA	2	10	1145910	1145919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017368	TTAAA	2	10	1154063	1154072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017368	AAAGC	2	10	1168888	1168897	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017368	TTATA	2	10	1170668	1170677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017368	ATTTA	2	10	1176892	1176901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017368	TTAAT	2	10	1179658	1179667	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017368	TATTT	2	10	1179694	1179703	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017368	TTGTG	2	10	1179726	1179735	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017368	AAATC	2	10	1185714	1185723	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017368	CAATC	2	10	1194354	1194363	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017368	AATCC	2	10	1211706	1211715	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017368	CTAGA	2	10	1212258	1212267	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017368	CCTCC	2	10	1214502	1214511	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
132	NC_017368	TAATA	2	10	1216620	1216629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017368	TGTAT	2	10	1220242	1220251	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017368	CGCAC	2	10	1220519	1220528	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_017368	ATTTT	2	10	1230351	1230360	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017368	ATGAG	2	10	1242505	1242514	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017368	AACAA	2	10	1242535	1242544	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017368	TTGGT	2	10	1248675	1248684	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017368	AAAAG	2	10	1253164	1253173	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017368	AAAAG	2	10	1253179	1253188	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017368	AAAAG	2	10	1253194	1253203	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017368	AGCCA	2	10	1255725	1255734	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017368	TAAGC	2	10	1287255	1287264	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017368	TCTCA	2	10	1287340	1287349	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017368	TATAT	2	10	1313137	1313146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017368	TTATT	2	10	1313745	1313754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017368	AATAA	2	10	1314138	1314147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017368	TATTT	2	10	1315517	1315526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017368	GATTT	2	10	1331765	1331774	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017368	TGTGA	2	10	1360724	1360733	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017368	TACTT	2	10	1367068	1367077	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_017368	TAAAA	2	10	1391414	1391423	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017368	AATTT	2	10	1391442	1391451	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_017368	TTTTA	2	10	1572245	1572254	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017368	ATTTA	2	10	1572476	1572485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017368	TAAAA	2	10	1573881	1573890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017368	TTAAA	2	10	1574300	1574309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.